152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3793 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 616 aa  1181    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  35.46 
 
 		 685 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.03 
 
 		 2194 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.65 
 
 		 1222 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  30.05 
 
 		 644 aa  141  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.83 
 
 		 889 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.53 
 
 		 1118 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.23 
 
 		 1340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.01 
 
 		 1113 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  30.53 
 
 		 1838 aa  134  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  36.03 
 
 		 662 aa  130  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.24 
 
 		 1225 aa  130  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  30.89 
 
 		 1019 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.49 
 
 		 2807 aa  125  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  33.15 
 
 		 828 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  33.77 
 
 		 657 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.29 
 
 		 1009 aa  114  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  32.07 
 
 		 1490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  31.72 
 
 		 872 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  31.47 
 
 		 974 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.64 
 
 		 891 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  31.93 
 
 		 1126 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  29.25 
 
 		 1557 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  32.53 
 
 		 386 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.27 
 
 		 1012 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  33.8 
 
 		 1275 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  29.1 
 
 		 412 aa  98.2  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  29.29 
 
 		 663 aa  98.2  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  31.58 
 
 		 3197 aa  94.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  31.93 
 
 		 604 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  32.93 
 
 		 3197 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  30.08 
 
 		 720 aa  84  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  32.18 
 
 		 554 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1289 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  29.53 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  27.84 
 
 		 4379 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  32.14 
 
 		 1124 aa  73.9  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.24 
 
 		 1212 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  34.03 
 
 		 813 aa  71.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  29.8 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  39.45 
 
 		 1736 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  27.92 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  30.58 
 
 		 1022 aa  67.4  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.9 
 
 		 1109 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  34.33 
 
 		 699 aa  65.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  33.05 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  29.32 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.72 
 
 		 1001 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  35.58 
 
 		 1424 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  37.95 
 
 		 1426 aa  63.9  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  35.85 
 
 		 1193 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  33.03 
 
 		 1428 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  26.42 
 
 		 433 aa  62  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  30.07 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  38.52 
 
 		 897 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1127 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  26.92 
 
 		 1161 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.28 
 
 		 1246 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  33.65 
 
 		 1029 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2225  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  38.14 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  29.44 
 
 		 1098 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  39.8 
 
 		 1073 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  30.68 
 
 		 485 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1575 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  32.69 
 
 		 2239 aa  57.8  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  26.03 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  34.84 
 
 		 2082 aa  57.4  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  30.77 
 
 		 447 aa  57  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.06 
 
 		 1170 aa  57  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  31.45 
 
 		 456 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  27.86 
 
 		 1120 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.97 
 
 		 1228 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  36.72 
 
 		 772 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  26.56 
 
 		 510 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  27.87 
 
 		 499 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  24.4 
 
 		 917 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.04 
 
 		 600 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  24.65 
 
 		 1126 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.05 
 
 		 11716 aa  56.2  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  28.37 
 
 		 1166 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  26.03 
 
 		 1098 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  25.41 
 
 		 404 aa  55.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.42 
 
 		 1189 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.63 
 
 		 1193 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.33 
 
 		 1192 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  27.4 
 
 		 569 aa  54.3  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.38 
 
 		 1208 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1231 aa  53.9  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  28.57 
 
 		 593 aa  53.9  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  40.86 
 
 		 607 aa  53.9  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  31.07 
 
 		 1310 aa  53.9  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  30.28 
 
 		 1094 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.99 
 
 		 959 aa  53.5  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  25.13 
 
 		 523 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2002  hypothetical protein  30.89 
 
 		 492 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.583711  normal  0.178712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  29.03 
 
 		 803 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.89 
 
 		 1138 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.56 
 
 		 1226 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3385  FG-GAP repeat-containing protein  27.97 
 
 		 463 aa  51.2  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.8 
 
 		 1236 aa  51.2  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>