57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3385 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3385  FG-GAP repeat-containing protein  100 
 
 		 463 aa  935    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  55.07 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  29.41 
 
 		 1838 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 1127 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.97 
 
 		 616 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  36.52 
 
 		 2807 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  26.18 
 
 		 1019 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  27.34 
 
 		 872 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  23.44 
 
 		 657 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  25.15 
 
 		 4379 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.07 
 
 		 1225 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.06 
 
 		 1113 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  26.61 
 
 		 1557 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.85 
 
 		 2194 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.31 
 
 		 3197 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  26.01 
 
 		 828 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  32.62 
 
 		 1490 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  30.7 
 
 		 412 aa  57  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 		 889 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  33.09 
 
 		 3197 aa  56.6  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.21 
 
 		 1222 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  24.25 
 
 		 1126 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  24.41 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  31.97 
 
 		 604 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  29.06 
 
 		 554 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.47 
 
 		 1118 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.96 
 
 		 655 aa  53.5  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.63 
 
 		 1340 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  34.88 
 
 		 685 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  31.01 
 
 		 1275 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  32.04 
 
 		 1289 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.56 
 
 		 891 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  22.56 
 
 		 494 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  23.1 
 
 		 583 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  30.66 
 
 		 813 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  24.86 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  26.28 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  30.08 
 
 		 720 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.39 
 
 		 1009 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  24.7 
 
 		 556 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  27.74 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.71 
 
 		 726 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  25 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  30.77 
 
 		 951 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  29.8 
 
 		 1127 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  25.46 
 
 		 485 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.46 
 
 		 1012 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.82 
 
 		 691 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.11 
 
 		 585 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  29.25 
 
 		 1172 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  31.48 
 
 		 435 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.49 
 
 		 11716 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1575 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  29.91 
 
 		 644 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.73 
 
 		 1170 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.06 
 
 		 1066 aa  43.5  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.59 
 
 		 1114 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>