128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4707 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
291 aa  595  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  50.87 
 
 
306 aa  288  8e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  47.49 
 
 
315 aa  267  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  43.37 
 
 
532 aa  247  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  47.84 
 
 
328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  45.36 
 
 
694 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  45.49 
 
 
358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  41.67 
 
 
912 aa  219  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  42.09 
 
 
1918 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  42.28 
 
 
884 aa  216  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  40.91 
 
 
1321 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  39.38 
 
 
276 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  38.97 
 
 
883 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  38.1 
 
 
633 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  38.26 
 
 
274 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.89 
 
 
742 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  40.07 
 
 
503 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  38.87 
 
 
286 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  39.16 
 
 
286 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.54 
 
 
1694 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  37.04 
 
 
409 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  39.19 
 
 
301 aa  160  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  36 
 
 
279 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  38.75 
 
 
291 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  35.07 
 
 
330 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  34.43 
 
 
328 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  35.77 
 
 
383 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.98 
 
 
288 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  34.25 
 
 
389 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  33.89 
 
 
469 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  37.27 
 
 
423 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 
556 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  34.42 
 
 
281 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  33.83 
 
 
426 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  36.13 
 
 
289 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  35.79 
 
 
1028 aa  144  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.75 
 
 
252 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.75 
 
 
547 aa  143  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  33.45 
 
 
641 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  33.45 
 
 
642 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.74 
 
 
282 aa  141  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.48 
 
 
627 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  35.02 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  37.73 
 
 
588 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.17 
 
 
1290 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  35.03 
 
 
1332 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.43 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  31.19 
 
 
1059 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  36.7 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  34.93 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  34.07 
 
 
569 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  31.6 
 
 
1441 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  34.94 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.53 
 
 
819 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  30.5 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  29.58 
 
 
752 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  33.91 
 
 
306 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 
394 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  31.86 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  30.58 
 
 
275 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  30.34 
 
 
286 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  32.72 
 
 
346 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  29.9 
 
 
405 aa  105  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 
427 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  28.57 
 
 
277 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 
384 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.2 
 
 
261 aa  99  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  30.21 
 
 
269 aa  99  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  33.13 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  30.1 
 
 
470 aa  95.5  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  31.54 
 
 
465 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  29.47 
 
 
608 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  31.96 
 
 
477 aa  89  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  27.11 
 
 
334 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  31.16 
 
 
467 aa  86.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  27.57 
 
 
263 aa  86.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  29.41 
 
 
464 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 
449 aa  85.1  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  29.68 
 
 
722 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  30.98 
 
 
479 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  27.11 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  33.16 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  29.74 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  30.05 
 
 
907 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  28.67 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  25.86 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  28.76 
 
 
469 aa  71.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  24.39 
 
 
1707 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  27.02 
 
 
446 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6178  glycoside hydrolase family 16  24.07 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.57 
 
 
915 aa  68.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  28 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  25.36 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.71 
 
 
1007 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  27.46 
 
 
539 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  28.51 
 
 
686 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3726  glycosy hydrolase family protein  25.08 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  25.55 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>