208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1641 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  100 
 
 		 853 aa  1746    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  41.11 
 
 		 839 aa  691    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  36.96 
 
 		 843 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  37.09 
 
 		 857 aa  557  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  30.94 
 
 		 848 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  27.17 
 
 		 853 aa  339  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  28 
 
 		 841 aa  338  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  28.45 
 
 		 856 aa  334  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  28.14 
 
 		 855 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  27.75 
 
 		 828 aa  322  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  26.11 
 
 		 838 aa  238  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  21.58 
 
 		 877 aa  200  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  24.14 
 
 		 831 aa  174  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  25.2 
 
 		 828 aa  145  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  22.42 
 
 		 829 aa  143  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1719  hypothetical protein  22.5 
 
 		 811 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0193339  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  22.18 
 
 		 814 aa  124  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  22.36 
 
 		 849 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  24.55 
 
 		 816 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1059 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 975 aa  65.5  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 998 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  32.74 
 
 		 1062 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  21.88 
 
 		 925 aa  61.2  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  33.93 
 
 		 1019 aa  61.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1006 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  36.11 
 
 		 827 aa  60.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  29.23 
 
 		 1080 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1081 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  35.24 
 
 		 996 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  34.55 
 
 		 1095 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1010 aa  58.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1114 aa  58.2  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  34.04 
 
 		 1024 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  29.66 
 
 		 833 aa  56.6  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  31.43 
 
 		 1043 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 1004 aa  55.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1064 aa  56.2  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  22.54 
 
 		 905 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  37.08 
 
 		 986 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1188 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 1078 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  30.14 
 
 		 1038 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 1049 aa  55.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1051 aa  54.7  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1045 aa  54.7  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  33.33 
 
 		 914 aa  54.7  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1077 aa  54.3  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  29.92 
 
 		 800 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  41.77 
 
 		 1035 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  34.07 
 
 		 1062 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  38.54 
 
 		 1070 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1085 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  32.98 
 
 		 1003 aa  54.3  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  37.78 
 
 		 789 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1040 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  37.76 
 
 		 984 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1047 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1082 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  28.32 
 
 		 1073 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 854 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 931 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1117 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 1021 aa  52.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 861 aa  52.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  30.61 
 
 		 1031 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  30.48 
 
 		 1030 aa  52.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 1027 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1079 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1071 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1016 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 1010 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0560  TonB-dependent receptor plug  43.94 
 
 		 971 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0108635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 1047 aa  51.6  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 1060 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  30.3 
 
 		 1056 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  29.82 
 
 		 942 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 1008 aa  51.6  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 929 aa  51.6  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 1038 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  29.66 
 
 		 381 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  35.79 
 
 		 1109 aa  51.2  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 924 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 795 aa  50.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  21.23 
 
 		 854 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 922 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  35.06 
 
 		 814 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  32.61 
 
 		 1034 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1135 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1059 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  40.28 
 
 		 1037 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1176 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  37.08 
 
 		 1103 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1081 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1066 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 982 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  32.38 
 
 		 935 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 958 aa  50.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1047 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 1189 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>