213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6157 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  98.95 
 
 		 205 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 203 aa  190  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 241 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  29.48 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  27.69 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 231 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 220 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 209 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.04 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 257 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  27.17 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 317 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1542  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1519  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 215 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 217 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 214 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 234 aa  45.1  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 238 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 238 aa  45.1  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 219 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>