More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0997 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1150 aa  2287    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  44.19 
 
 		 1565 aa  596  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  41.31 
 
 		 1916 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  41.33 
 
 		 2066 aa  568  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  34.46 
 
 		 1009 aa  341  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  47.8 
 
 		 890 aa  169  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  54.7 
 
 		 816 aa  168  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  54.24 
 
 		 623 aa  157  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  55.11 
 
 		 1057 aa  156  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  48.04 
 
 		 623 aa  152  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  43.68 
 
 		 792 aa  135  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  52.35 
 
 		 517 aa  129  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  35.89 
 
 		 873 aa  123  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  48.8 
 
 		 938 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  42.22 
 
 		 773 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  39.04 
 
 		 1027 aa  110  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  46.37 
 
 		 734 aa  109  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.12 
 
 		 940 aa  105  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.13 
 
 		 1158 aa  105  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  32.81 
 
 		 2272 aa  102  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  57.61 
 
 		 943 aa  101  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  36.73 
 
 		 951 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  42.38 
 
 		 995 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  34.68 
 
 		 3197 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  39.29 
 
 		 918 aa  100  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  42.16 
 
 		 910 aa  100  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  42.76 
 
 		 948 aa  100  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0628  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  37.89 
 
 		 574 aa  100  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  34.98 
 
 		 552 aa  99.8  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  32.55 
 
 		 1231 aa  99  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  34.46 
 
 		 575 aa  98.6  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  50.82 
 
 		 935 aa  98.2  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  37.26 
 
 		 3295 aa  97.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  38.46 
 
 		 1151 aa  97.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  40.38 
 
 		 944 aa  97.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  37.76 
 
 		 1732 aa  97.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  41.98 
 
 		 948 aa  95.5  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  38.01 
 
 		 2000 aa  95.1  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  40.13 
 
 		 944 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  40.13 
 
 		 944 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.74 
 
 		 947 aa  94  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.13 
 
 		 944 aa  93.2  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  41.98 
 
 		 948 aa  93.6  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  41.5 
 
 		 1771 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  45.67 
 
 		 965 aa  93.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  32.68 
 
 		 752 aa  93.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  39.47 
 
 		 944 aa  93.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  59.09 
 
 		 712 aa  92.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  48 
 
 		 777 aa  92.4  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  35.8 
 
 		 2122 aa  92  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  41.25 
 
 		 948 aa  92  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  32.75 
 
 		 859 aa  91.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  38.15 
 
 		 2554 aa  91.7  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  33.5 
 
 		 978 aa  91.7  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  37.57 
 
 		 1969 aa  90.5  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  30.86 
 
 		 561 aa  90.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  38.42 
 
 		 596 aa  90.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.72 
 
 		 955 aa  90.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  45.16 
 
 		 936 aa  90.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  45.16 
 
 		 936 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  31.78 
 
 		 679 aa  89.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  42.29 
 
 		 918 aa  89.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1682 aa  89.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  38.22 
 
 		 528 aa  89.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  45.22 
 
 		 775 aa  89.4  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  31.36 
 
 		 685 aa  89.4  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  33.16 
 
 		 2036 aa  89  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  34.01 
 
 		 945 aa  89  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  41.3 
 
 		 317 aa  88.6  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  40.76 
 
 		 1667 aa  88.6  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  31.97 
 
 		 713 aa  88.6  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  38.46 
 
 		 713 aa  88.2  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  28.76 
 
 		 1300 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  32.17 
 
 		 618 aa  87.4  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  36.49 
 
 		 940 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  32.6 
 
 		 735 aa  87  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  33.71 
 
 		 675 aa  87  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  32.18 
 
 		 669 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.9 
 
 		 1842 aa  87.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  35.75 
 
 		 1667 aa  87  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  54.44 
 
 		 780 aa  87.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  30.7 
 
 		 581 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  32.29 
 
 		 547 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  39.09 
 
 		 938 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.71 
 
 		 942 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  42.24 
 
 		 601 aa  85.5  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  48.89 
 
 		 677 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  33.79 
 
 		 861 aa  85.5  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  32.09 
 
 		 1241 aa  85.1  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  31.82 
 
 		 2176 aa  84.7  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  49.43 
 
 		 778 aa  84  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  37.97 
 
 		 1356 aa  84  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  33.51 
 
 		 615 aa  84.3  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  32.8 
 
 		 1120 aa  84.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  33.68 
 
 		 1814 aa  84.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  49.43 
 
 		 778 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  49.43 
 
 		 778 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  32.39 
 
 		 658 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  37.79 
 
 		 184 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  36.31 
 
 		 1236 aa  84  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>