More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_00691 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  38.16 
 
 
1217 aa  724    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  49.09 
 
 
1201 aa  1052    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  38.13 
 
 
1226 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  36.43 
 
 
1198 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  49.29 
 
 
1183 aa  1020    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  37.38 
 
 
1208 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  45.64 
 
 
1184 aa  1001    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  46.37 
 
 
1204 aa  1049    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  46.35 
 
 
1202 aa  1032    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  92.47 
 
 
1196 aa  2157    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  100 
 
 
1196 aa  2379    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  76.38 
 
 
1194 aa  1808    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  96.74 
 
 
1196 aa  2269    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  36.56 
 
 
1219 aa  709    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  38.44 
 
 
1190 aa  693    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  47.89 
 
 
1207 aa  1023    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  38.08 
 
 
1226 aa  717    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  31.6 
 
 
1174 aa  500  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  32.26 
 
 
1171 aa  497  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  29.75 
 
 
1193 aa  459  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  30.15 
 
 
1146 aa  444  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  30.44 
 
 
1147 aa  440  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  30.73 
 
 
1149 aa  437  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  31.33 
 
 
1146 aa  429  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  29.02 
 
 
1146 aa  398  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  28.33 
 
 
1189 aa  383  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  28.04 
 
 
1189 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  28.75 
 
 
1191 aa  360  8e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  54.7 
 
 
1195 aa  321  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  27.59 
 
 
1185 aa  314  6.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.63 
 
 
1189 aa  297  6e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.57 
 
 
1187 aa  285  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  25.86 
 
 
1191 aa  267  8.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  30.96 
 
 
1172 aa  255  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  25.78 
 
 
1196 aa  254  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.24 
 
 
1185 aa  253  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  30.12 
 
 
1148 aa  248  6.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  25 
 
 
1198 aa  241  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  25.72 
 
 
1189 aa  238  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.18 
 
 
1184 aa  230  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.14 
 
 
1178 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  25.04 
 
 
1179 aa  222  3e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  50.24 
 
 
1175 aa  220  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  24.34 
 
 
1174 aa  217  9e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  24.69 
 
 
1191 aa  216  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  24.96 
 
 
1170 aa  215  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  40.43 
 
 
1189 aa  212  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.4 
 
 
1170 aa  205  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  37.96 
 
 
1196 aa  204  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  36.67 
 
 
1188 aa  202  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  38.28 
 
 
1192 aa  201  7e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.8 
 
 
1174 aa  200  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.63 
 
 
1181 aa  196  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.14 
 
 
1188 aa  196  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.14 
 
 
1188 aa  196  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  27.1 
 
 
1187 aa  193  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  26.75 
 
 
1190 aa  190  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  23.58 
 
 
1176 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  28.29 
 
 
1175 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  26.84 
 
 
1189 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  27.35 
 
 
1185 aa  181  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  35.29 
 
 
1189 aa  178  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  26.92 
 
 
1185 aa  177  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  24.08 
 
 
1171 aa  176  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  39.72 
 
 
1184 aa  172  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  26.36 
 
 
1164 aa  171  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25.33 
 
 
1189 aa  170  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46490  predicted protein  24.63 
 
 
1209 aa  169  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0173437 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  26.29 
 
 
1174 aa  165  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  25.6 
 
 
1215 aa  165  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  28.21 
 
 
1082 aa  165  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  27.38 
 
 
1187 aa  162  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  25.07 
 
 
1189 aa  162  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.45 
 
 
1186 aa  162  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  24.9 
 
 
1189 aa  160  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.42 
 
 
1134 aa  159  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  26.75 
 
 
1177 aa  159  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  25.75 
 
 
1189 aa  158  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  26.88 
 
 
1199 aa  156  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  26.88 
 
 
1199 aa  156  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  25.96 
 
 
1189 aa  155  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  25.31 
 
 
1199 aa  154  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.4 
 
 
1148 aa  150  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  24.53 
 
 
1213 aa  139  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  37.33 
 
 
1185 aa  138  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1570  condensin subunit Smc  41.62 
 
 
1188 aa  137  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.069704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  39.49 
 
 
1194 aa  137  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4188  chromosome segregation protein SMC  40 
 
 
1194 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269339  normal  0.69068 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  24.48 
 
 
1179 aa  135  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2076  chromosome segregation protein SMC  31.38 
 
 
1217 aa  135  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.164859  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0655  condensin subunit Smc  38.78 
 
 
1183 aa  134  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1933  condensin subunit Smc  35.87 
 
 
1195 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00525455  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  25.67 
 
 
1153 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2175  chromosome segregation protein SMC  38.92 
 
 
1194 aa  132  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1999  condensin subunit Smc  35.87 
 
 
1195 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1953  condensin subunit Smc  35.87 
 
 
1195 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  25.73 
 
 
980 aa  130  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  39.67 
 
 
1188 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  40.11 
 
 
1224 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2776  chromosome segregation protein SMC  37.76 
 
 
1234 aa  129  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371529  normal  0.187776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>