145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5633 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5633  NB-ARC domain-containing protein  100 
 
 		 744 aa  1503    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345268  normal  0.0245797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2767  hypothetical protein  30.1 
 
 		 715 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0532773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  29.02 
 
 		 915 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  27.01 
 
 		 996 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  27.07 
 
 		 790 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  26.99 
 
 		 788 aa  137  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  26.24 
 
 		 930 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  28.14 
 
 		 797 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2713  NB-ARC domain protein  29.57 
 
 		 838 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220271  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 946 aa  129  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  26.57 
 
 		 806 aa  128  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3944  Tetratricopeptide TPR_4  27.18 
 
 		 705 aa  128  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664408  normal  0.0198084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 1048 aa  127  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  25.95 
 
 		 715 aa  127  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  30.68 
 
 		 1030 aa  127  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  27.12 
 
 		 1025 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1805  putative regulator protein  26.97 
 
 		 708 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.569489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  25.29 
 
 		 907 aa  117  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  27.73 
 
 		 1088 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  25.78 
 
 		 1004 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  28.45 
 
 		 921 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  24.77 
 
 		 1020 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  26.58 
 
 		 928 aa  111  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  26.92 
 
 		 741 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  25.28 
 
 		 981 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  25.57 
 
 		 792 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  27.05 
 
 		 921 aa  109  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  28.13 
 
 		 934 aa  108  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  26.92 
 
 		 940 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 850 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 755 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 1071 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  27.13 
 
 		 1033 aa  105  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4182  AAA ATPase  28.78 
 
 		 690 aa  105  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  25.82 
 
 		 971 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  27.9 
 
 		 908 aa  104  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  26.17 
 
 		 1030 aa  104  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 814 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  24.83 
 
 		 1022 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  25.32 
 
 		 913 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  24.37 
 
 		 965 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  26.23 
 
 		 956 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  27.94 
 
 		 1010 aa  99.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  26.42 
 
 		 1011 aa  99  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  24.48 
 
 		 967 aa  99  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  26.4 
 
 		 931 aa  98.2  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  28.91 
 
 		 990 aa  97.4  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  25.04 
 
 		 782 aa  97.4  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  26.3 
 
 		 1027 aa  96.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  25.41 
 
 		 970 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 1017 aa  96.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  25.79 
 
 		 992 aa  96.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 941 aa  96.3  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  27.6 
 
 		 964 aa  93.2  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  26.18 
 
 		 989 aa  93.2  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  25.75 
 
 		 992 aa  92  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  24.85 
 
 		 993 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  27.08 
 
 		 978 aa  91.3  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  27.08 
 
 		 1003 aa  91.3  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  25.98 
 
 		 919 aa  91.3  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  26.72 
 
 		 1001 aa  91.3  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  26.63 
 
 		 1014 aa  90.5  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  25.88 
 
 		 1108 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  24.47 
 
 		 1022 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  27.33 
 
 		 1008 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  24.72 
 
 		 990 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  26.87 
 
 		 928 aa  88.2  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.07 
 
 		 742 aa  86.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  27.29 
 
 		 962 aa  86.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  24.92 
 
 		 775 aa  85.1  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  25.89 
 
 		 1003 aa  85.1  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  24.73 
 
 		 995 aa  84  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 993 aa  83.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  26.64 
 
 		 680 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  26.22 
 
 		 1034 aa  80.9  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  25.79 
 
 		 1025 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  26.77 
 
 		 792 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  28.83 
 
 		 1003 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6340  hypothetical protein  27.31 
 
 		 772 aa  79  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  25.45 
 
 		 983 aa  78.2  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  27.05 
 
 		 1138 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  30.28 
 
 		 994 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  23.26 
 
 		 783 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  25.56 
 
 		 982 aa  75.5  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4985  Tetratricopeptide TPR_4  23.82 
 
 		 687 aa  74.7  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.688243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  25.78 
 
 		 1033 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  28.91 
 
 		 775 aa  75.1  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  26.83 
 
 		 621 aa  74.7  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  30.73 
 
 		 963 aa  74.7  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  22.52 
 
 		 1060 aa  73.9  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  27.65 
 
 		 632 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6871  hypothetical protein  26.95 
 
 		 854 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  33 
 
 		 810 aa  72  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 621 aa  71.6  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 907 aa  71.2  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  26.82 
 
 		 965 aa  71.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  29.29 
 
 		 926 aa  70.9  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  26.25 
 
 		 1024 aa  70.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 954 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  24.76 
 
 		 935 aa  70.1  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>