More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2897 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2897  16S rRNA processing protein RimM  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2609  16S rRNA-processing protein RimM  42.11 
 
 		 171 aa  140  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.740533  normal  0.0121185 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1047  16S rRNA-processing protein RimM  45.4 
 
 		 169 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2708  16S rRNA-processing protein RimM  46.01 
 
 		 169 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0300271 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3882  16S rRNA-processing protein RimM  46.3 
 
 		 167 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.13781  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0182  16S rRNA-processing protein RimM  43.56 
 
 		 169 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4889  16S rRNA-processing protein RimM  43.55 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0748  16S rRNA-processing protein RimM  42.6 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0366  16S rRNA-processing protein RimM  40.24 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0344  16S rRNA-processing protein RimM  44.17 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2781  16S rRNA-processing protein RimM  40.49 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00810863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3580  16S rRNA-processing protein RimM  41.1 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264248  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2886  16S rRNA-processing protein RimM  44.05 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0689866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3443  16S rRNA-processing protein RimM  43.4 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0351  16S rRNA-processing protein RimM  39.88 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1186  16S rRNA processing protein RimM  40.74 
 
 		 201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292134  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0508  16S rRNA-processing protein RimM  38.41 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0223  16S rRNA-processing protein RimM  38.18 
 
 		 176 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.0149038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0244  16S rRNA-processing protein RimM  37.8 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0943  16S rRNA-processing protein RimM  40.37 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1843  16S rRNA-processing protein RimM  40.49 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0355078  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1915  16S rRNA-processing protein RimM  40.49 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2726  16S rRNA processing protein RimM  48.67 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1420  16S rRNA-processing protein RimM  41.34 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.261134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2889  16S rRNA-processing protein RimM  40 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4207  16S rRNA-processing protein RimM  42.33 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3753  16S rRNA-processing protein RimM  38.51 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0930  16S rRNA-processing protein RimM  32.56 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4076  16S rRNA-processing protein RimM  38.51 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1282  16S rRNA-processing protein RimM  36.75 
 
 		 168 aa  107  9.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3681  16S rRNA-processing protein RimM  44.44 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1406  16S rRNA processing protein RimM  43.05 
 
 		 166 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502149  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2658  16S rRNA processing protein RimM  42.68 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0633  16S rRNA-processing protein RimM  39.43 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0002  16S rRNA-processing protein RimM  33.15 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0665  16S rRNA-processing protein RimM  40.24 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329294 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0085  16S rRNA-processing protein RimM  34.38 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0654  16S rRNA-processing protein RimM  39.64 
 
 		 223 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2512  16S rRNA-processing protein RimM  37.42 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3277  16S rRNA processing protein RimM  36.99 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3615  16S rRNA-processing protein RimM  36.84 
 
 		 231 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.900619  hitchhiker  0.00782345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  36.2 
 
 		 170 aa  91.3  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10000  16S rRNA processing protein RimM  35.76 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0953699  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3421  16S rRNA processing protein RimM  38.55 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0959961  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5924  16S rRNA processing protein RimM  37.35 
 
 		 172 aa  88.6  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.144619  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3353  16S rRNA-processing protein RimM  37.87 
 
 		 173 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09170  16S rRNA processing protein RimM  37.5 
 
 		 200 aa  85.9  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0324  16S rRNA processing protein RimM  33.91 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.884603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2221  16S rRNA-processing protein RimM  33.54 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000411195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1967  16S rRNA-processing protein RimM  36.69 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0420461  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1947  16S rRNA-processing protein RimM  36.69 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2013  16S rRNA-processing protein RimM  36.69 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.325457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3098  16S rRNA-processing protein RimM  35.59 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09770  16S rRNA processing protein RimM  34.13 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.098871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2374  16S rRNA processing protein RimM  31.36 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1154  16S rRNA-processing protein RimM  32.1 
 
 		 170 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  37.42 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1463  16S rRNA-processing protein RimM  32.37 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278393  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1068  16S rRNA-processing protein RimM  32.37 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4258  16S rRNA-processing protein RimM  32.37 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1885  16S rRNA-processing protein RimM  32.04 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2854  16S rRNA processing protein RimM  30.72 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.77473  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02148  16S rRNA-processing protein RimM  29.01 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.899687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4156  16S rRNA-processing protein RimM  32.37 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12723  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2475  16S rRNA processing protein RimM  30.43 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2189  16S rRNA-processing protein RimM  34.91 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0264003  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1559  16S rRNA processing protein RimM  32.72 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0559633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1371  16S rRNA processing protein RimM  28.07 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000034435  normal  0.381877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1691  16S rRNA-processing protein RimM  27.22 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2152  16S rRNA processing protein RimM  35.88 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.523891  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0885  16S rRNA processing protein RimM  33.14 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4173  16S rRNA-processing protein RimM  34.91 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3134  16S rRNA processing protein RimM  33.13 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39550  16S rRNA-processing protein RimM  33.14 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1169  16S rRNA processing protein RimM  33.54 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17931  16S rRNA-processing protein RimM  27.49 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1020  16S rRNA-processing protein RimM  31.21 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104306  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1375  16S rRNA-processing protein RimM  32.39 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15980  16S rRNA-processing protein RimM  32.39 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00452583  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1698  16S rRNA-processing protein RimM  27.06 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1403  16S rRNA-processing protein RimM  28.74 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3429  16S rRNA processing protein RimM  30.72 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000572848  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3400  16S rRNA-processing protein RimM  31.98 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.80773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1619  16S rRNA processing protein RimM  34.91 
 
 		 173 aa  72  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0201  16S rRNA processing protein RimM  28.57 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000521632  normal  0.064349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1029  16S rRNA processing protein RimM  32.77 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.635977  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1479  16S rRNA-processing protein RimM  29.01 
 
 		 173 aa  72  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0074  16S rRNA-processing protein RimM  29.45 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0393  16S rRNA processing protein RimM  32.32 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17291  16S rRNA-processing protein RimM  31.95 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1064  16S rRNA-processing protein RimM  28.57 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000154206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1284  16S rRNA processing protein RimM  24.73 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.304592 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2702  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.294971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1400  16S rRNA processing protein RimM  31.25 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1283  16S rRNA-processing protein RimM  29.89 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.896512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0088  16S rRNA-processing protein RimM  28.99 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2452  16S rRNA processing protein RimM  29.14 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000919836  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1007  16S rRNA-processing protein RimM  32.39 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5344  16S rRNA-processing protein RimM  29.41 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0428  16S rRNA processing protein RimM  27.65 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>