294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1282 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1282  16S rRNA-processing protein RimM  100 
 
 		 168 aa  333  5e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0930  16S rRNA-processing protein RimM  55.09 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0002  16S rRNA-processing protein RimM  50.3 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1047  16S rRNA-processing protein RimM  36.97 
 
 		 169 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2708  16S rRNA-processing protein RimM  37.58 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0300271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2886  16S rRNA-processing protein RimM  36.59 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0689866 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2781  16S rRNA-processing protein RimM  38.18 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00810863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0182  16S rRNA-processing protein RimM  35.76 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1420  16S rRNA-processing protein RimM  35.54 
 
 		 188 aa  121  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.261134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0244  16S rRNA-processing protein RimM  34.71 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3580  16S rRNA-processing protein RimM  37.58 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0366  16S rRNA-processing protein RimM  36.14 
 
 		 198 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0508  16S rRNA-processing protein RimM  32.94 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3882  16S rRNA-processing protein RimM  35.8 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.13781  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0351  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0748  16S rRNA-processing protein RimM  34.34 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1186  16S rRNA processing protein RimM  32.93 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292134  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2897  16S rRNA processing protein RimM  36.75 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0223  16S rRNA-processing protein RimM  34.12 
 
 		 176 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.0149038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3443  16S rRNA-processing protein RimM  39.61 
 
 		 212 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609284  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0344  16S rRNA-processing protein RimM  32.93 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0665  16S rRNA-processing protein RimM  34.94 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0633  16S rRNA-processing protein RimM  35.12 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_004310  BR1915  16S rRNA-processing protein RimM  38.06 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1843  16S rRNA-processing protein RimM  38.06 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0355078  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0654  16S rRNA-processing protein RimM  34.34 
 
 		 223 aa  104  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4889  16S rRNA-processing protein RimM  32.34 
 
 		 200 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2512  16S rRNA-processing protein RimM  32.52 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3277  16S rRNA processing protein RimM  31.98 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2889  16S rRNA-processing protein RimM  30.77 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0085  16S rRNA-processing protein RimM  37.34 
 
 		 191 aa  101  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0943  16S rRNA-processing protein RimM  37.04 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3615  16S rRNA-processing protein RimM  30.72 
 
 		 231 aa  99  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.900619  hitchhiker  0.00782345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2609  16S rRNA-processing protein RimM  31.33 
 
 		 171 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.740533  normal  0.0121185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3353  16S rRNA-processing protein RimM  34.18 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4207  16S rRNA-processing protein RimM  35.44 
 
 		 221 aa  95.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3753  16S rRNA-processing protein RimM  34.97 
 
 		 189 aa  91.3  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3681  16S rRNA-processing protein RimM  30.86 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4076  16S rRNA-processing protein RimM  34.36 
 
 		 189 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2152  16S rRNA processing protein RimM  31.18 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.523891  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17981  16S rRNA-processing protein RimM  31.14 
 
 		 179 aa  84.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.581865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1698  16S rRNA-processing protein RimM  30.41 
 
 		 179 aa  84  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01706  16S rRNA-processing protein RimM  33.12 
 
 		 173 aa  84  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0345877  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18151  16S rRNA-processing protein RimM  30.23 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2726  16S rRNA processing protein RimM  33.78 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17931  16S rRNA-processing protein RimM  28.07 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1181  16S rRNA-processing protein RimM  32.35 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.612534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09770  16S rRNA processing protein RimM  30.36 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.098871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20561  16S rRNA-processing protein RimM  32.35 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.656397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1406  16S rRNA processing protein RimM  32.68 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3098  16S rRNA-processing protein RimM  32.1 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1632  16S rRNA processing protein RimM  30.43 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09170  16S rRNA processing protein RimM  32.35 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2221  16S rRNA-processing protein RimM  31.68 
 
 		 181 aa  73.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000411195 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0124  putative 16S rRNA processing protein RimM  33.33 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2658  16S rRNA processing protein RimM  29.94 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3421  16S rRNA processing protein RimM  25.88 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0959961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  28.48 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2374  16S rRNA processing protein RimM  26.79 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3134  16S rRNA processing protein RimM  25.61 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26021  16S rRNA-processing protein RimM  25.88 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1255  16S rRNA-processing protein RimM  30.99 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000136012  hitchhiker  0.0000512506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2333  16S rRNA processing protein RimM  25.6 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377156  normal  0.0588442 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1578  16S rRNA-processing protein RimM  35.07 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.637772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1307  16S rRNA-processing protein RimM  24.57 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1829  16S rRNA processing protein RimM  27.98 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2753  16S rRNA-processing protein RimM  30.56 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000227208  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39550  16S rRNA-processing protein RimM  34.62 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2189  16S rRNA-processing protein RimM  25.15 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0264003  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2919  16S rRNA-processing protein RimM  29.71 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000569736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4173  16S rRNA-processing protein RimM  24.55 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1169  16S rRNA-processing protein RimM  32.22 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000549178  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0393  16S rRNA processing protein RimM  30.46 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5924  16S rRNA processing protein RimM  27.27 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.144619  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0981  16S rRNA processing protein RimM  25.75 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613857  normal  0.277259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4627  16S rRNA-processing protein RimM  30.05 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3366  16S rRNA processing protein RimM  28.65 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.83337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1196  16S rRNA-processing protein RimM  24 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.934668 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2259  16S rRNA-processing protein RimM  27.33 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.133781  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4258  16S rRNA-processing protein RimM  27.95 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0650  16S rRNA-processing protein RimM  31.54 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0518  16S rRNA processing protein RimM  26.67 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.541026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1463  16S rRNA-processing protein RimM  27.95 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278393  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4117  16S rRNA-processing protein RimM  26.4 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4006  16S rRNA processing protein RimM  28.67 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0967  16S rRNA processing protein RimM  29.17 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000740944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2485  16S rRNA processing protein RimM  26.99 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423168  normal  0.175293 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2005  16S rRNA processing protein RimM  25.29 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000559239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1491  16S rRNA processing protein RimM  31.58 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0201  16S rRNA processing protein RimM  31.34 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000521632  normal  0.064349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1068  16S rRNA-processing protein RimM  32.06 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2481  16S rRNA-processing protein RimM  29.75 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00367621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3016  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000828768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  24.24 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  31.25 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2859  16S rRNA-processing protein RimM  29.7 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1204  16S rRNA-processing protein RimM  34.81 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1050  16S rRNA-processing protein RimM  27.49 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1390  16S rRNA processing protein RimM  28.83 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0279558  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4619  16S rRNA processing protein RimM  24.54 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>