299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0002 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0002  16S rRNA-processing protein RimM  100 
 
 		 175 aa  349  1e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0930  16S rRNA-processing protein RimM  83.14 
 
 		 173 aa  276  7e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1282  16S rRNA-processing protein RimM  50.3 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1186  16S rRNA processing protein RimM  35.8 
 
 		 201 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292134  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3615  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.900619  hitchhiker  0.00782345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2886  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 		 199 aa  124  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0689866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0366  16S rRNA-processing protein RimM  39.18 
 
 		 198 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0182  16S rRNA-processing protein RimM  31.93 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1420  16S rRNA-processing protein RimM  31.03 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.261134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0223  16S rRNA-processing protein RimM  35.8 
 
 		 176 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.0149038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3580  16S rRNA-processing protein RimM  35.88 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264248  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0244  16S rRNA-processing protein RimM  35.54 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2781  16S rRNA-processing protein RimM  36.59 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00810863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0748  16S rRNA-processing protein RimM  32.35 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0508  16S rRNA-processing protein RimM  33.13 
 
 		 176 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2512  16S rRNA-processing protein RimM  35.58 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1047  16S rRNA-processing protein RimM  31.33 
 
 		 169 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2708  16S rRNA-processing protein RimM  31.93 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0300271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3443  16S rRNA-processing protein RimM  37.34 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0351  16S rRNA-processing protein RimM  34.15 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0344  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 		 166 aa  114  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2889  16S rRNA-processing protein RimM  30.3 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2897  16S rRNA processing protein RimM  32.95 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2609  16S rRNA-processing protein RimM  32.53 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.740533  normal  0.0121185 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3882  16S rRNA-processing protein RimM  30.86 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.13781  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4889  16S rRNA-processing protein RimM  30.59 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4207  16S rRNA-processing protein RimM  30.18 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408553  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3681  16S rRNA-processing protein RimM  29.63 
 
 		 176 aa  101  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3277  16S rRNA processing protein RimM  30.39 
 
 		 188 aa  100  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1915  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1843  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0355078  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0633  16S rRNA-processing protein RimM  31.93 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0085  16S rRNA-processing protein RimM  32.16 
 
 		 191 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0654  16S rRNA-processing protein RimM  30.91 
 
 		 223 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0665  16S rRNA-processing protein RimM  30.91 
 
 		 223 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3353  16S rRNA-processing protein RimM  29.68 
 
 		 173 aa  98.2  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0943  16S rRNA-processing protein RimM  31.65 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2152  16S rRNA processing protein RimM  25.7 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.523891  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3753  16S rRNA-processing protein RimM  27.97 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1406  16S rRNA processing protein RimM  30.26 
 
 		 166 aa  84.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502149  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4076  16S rRNA-processing protein RimM  28.47 
 
 		 189 aa  84.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17981  16S rRNA-processing protein RimM  31.58 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.581865  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2726  16S rRNA processing protein RimM  29.66 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18151  16S rRNA-processing protein RimM  31.79 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3098  16S rRNA-processing protein RimM  29.17 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17931  16S rRNA-processing protein RimM  29.24 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1698  16S rRNA-processing protein RimM  30.99 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1068  16S rRNA-processing protein RimM  30.2 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1463  16S rRNA-processing protein RimM  30 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278393  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4258  16S rRNA-processing protein RimM  30 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1514  16S rRNA-processing protein RimM  25.93 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621384  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2658  16S rRNA processing protein RimM  31.47 
 
 		 157 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39550  16S rRNA-processing protein RimM  31.29 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2183  16S rRNA processing protein RimM  25.61 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1255  16S rRNA-processing protein RimM  30.91 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000136012  hitchhiker  0.0000512506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09770  16S rRNA processing protein RimM  25.15 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.098871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1064  16S rRNA-processing protein RimM  29.88 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000154206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1020  16S rRNA-processing protein RimM  29.8 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104306  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2885  16S rRNA processing protein RimM  24.1 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4156  16S rRNA-processing protein RimM  30.2 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12723  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2485  16S rRNA processing protein RimM  25 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423168  normal  0.175293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0393  16S rRNA processing protein RimM  26.25 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1474  16S rRNA processing protein RimM  29.14 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1283  16S rRNA-processing protein RimM  29.14 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.896512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2374  16S rRNA processing protein RimM  28.47 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1403  16S rRNA-processing protein RimM  27.56 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3016  16S rRNA-processing protein RimM  32.54 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000828768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20561  16S rRNA-processing protein RimM  28.65 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.656397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1181  16S rRNA-processing protein RimM  28.65 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.612534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  29.55 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4627  16S rRNA-processing protein RimM  28.16 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1307  16S rRNA-processing protein RimM  22.86 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01706  16S rRNA-processing protein RimM  27.63 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0345877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3421  16S rRNA processing protein RimM  26.19 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0959961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2674  16S rRNA processing protein RimM  22.84 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109453  hitchhiker  0.000000299021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2481  16S rRNA-processing protein RimM  31.85 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00367621  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1559  16S rRNA processing protein RimM  26.09 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0559633 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1578  16S rRNA-processing protein RimM  27.63 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.637772  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2837  16S rRNA-processing protein RimM  30.12 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2919  16S rRNA-processing protein RimM  30.12 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000363709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5924  16S rRNA processing protein RimM  25.3 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.144619  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3134  16S rRNA processing protein RimM  24.69 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2919  16S rRNA-processing protein RimM  28.57 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000569736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2452  16S rRNA processing protein RimM  24.24 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000919836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1160  16S rRNA-processing protein RimM  29.7 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4970  16S rRNA processing protein RimM  25.29 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4068  16S rRNA-processing protein RimM  29.17 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.199941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1710  16S rRNA-processing protein RimM  29.17 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000120991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0853  16S rRNA-processing protein RimM  31.29 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000199239  hitchhiker  0.0000659128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1050  16S rRNA-processing protein RimM  29.09 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09170  16S rRNA processing protein RimM  23.08 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0712  16S rRNA-processing protein RimM  28.74 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1196  16S rRNA-processing protein RimM  23.43 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.934668 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0650  16S rRNA-processing protein RimM  26.85 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.182958  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1358  16S rRNA-processing protein RimM  29.52 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1619  16S rRNA processing protein RimM  26.79 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0096  16S rRNA-processing protein RimM  27.27 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000752452  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1284  16S rRNA processing protein RimM  25.71 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.304592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4117  16S rRNA-processing protein RimM  27.91 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0124  putative 16S rRNA processing protein RimM  24.85 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>