More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0085 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0085  16S rRNA-processing protein RimM  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1915  16S rRNA-processing protein RimM  51.19 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1843  16S rRNA-processing protein RimM  51.19 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0355078  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0943  16S rRNA-processing protein RimM  50 
 
 		 189 aa  165  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3753  16S rRNA-processing protein RimM  45.95 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4076  16S rRNA-processing protein RimM  45.41 
 
 		 189 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4207  16S rRNA-processing protein RimM  48.54 
 
 		 221 aa  150  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408553  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3443  16S rRNA-processing protein RimM  45.18 
 
 		 212 aa  141  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3098  16S rRNA-processing protein RimM  47.13 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.9458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0665  16S rRNA-processing protein RimM  41.36 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0654  16S rRNA-processing protein RimM  41.36 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2886  16S rRNA-processing protein RimM  36.69 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0689866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0366  16S rRNA-processing protein RimM  37.27 
 
 		 198 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0244  16S rRNA-processing protein RimM  40.13 
 
 		 176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0633  16S rRNA-processing protein RimM  39.77 
 
 		 224 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.279374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0351  16S rRNA-processing protein RimM  36.31 
 
 		 182 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3882  16S rRNA-processing protein RimM  38.65 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.13781  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2781  16S rRNA-processing protein RimM  35.84 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00810863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0182  16S rRNA-processing protein RimM  38.99 
 
 		 169 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0508  16S rRNA-processing protein RimM  37.58 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0223  16S rRNA-processing protein RimM  38.22 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.0149038 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1186  16S rRNA processing protein RimM  40.7 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0344  16S rRNA-processing protein RimM  37.5 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1420  16S rRNA-processing protein RimM  38.01 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.261134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3580  16S rRNA-processing protein RimM  36.65 
 
 		 173 aa  104  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264248  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2708  16S rRNA-processing protein RimM  37.11 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0300271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2609  16S rRNA-processing protein RimM  38.18 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.740533  normal  0.0121185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4889  16S rRNA-processing protein RimM  35.2 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3615  16S rRNA-processing protein RimM  39.61 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.900619  hitchhiker  0.00782345 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1047  16S rRNA-processing protein RimM  37.74 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2512  16S rRNA-processing protein RimM  36.88 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1282  16S rRNA-processing protein RimM  37.34 
 
 		 168 aa  101  6e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2889  16S rRNA-processing protein RimM  35.4 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2897  16S rRNA processing protein RimM  34.38 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3681  16S rRNA-processing protein RimM  33.99 
 
 		 176 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3134  16S rRNA processing protein RimM  36.14 
 
 		 167 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0748  16S rRNA-processing protein RimM  35.44 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1559  16S rRNA processing protein RimM  34.32 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0559633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1406  16S rRNA processing protein RimM  35.76 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502149  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2726  16S rRNA processing protein RimM  35.37 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3592  16S rRNA-processing protein RimM  32.75 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0930  16S rRNA-processing protein RimM  31.18 
 
 		 173 aa  89.7  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0002  16S rRNA-processing protein RimM  31.58 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1307  16S rRNA-processing protein RimM  36.53 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0981  16S rRNA processing protein RimM  37.42 
 
 		 171 aa  88.6  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613857  normal  0.277259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0712  16S rRNA-processing protein RimM  36.67 
 
 		 169 aa  88.2  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1054  RimM protein for 16S rRNA processing  34.21 
 
 		 204 aa  87  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  36.84 
 
 		 170 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3421  16S rRNA processing protein RimM  34.36 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0959961  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3257  16S rRNA processing protein RimM  34.97 
 
 		 184 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1169  16S rRNA processing protein RimM  35.52 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2183  16S rRNA processing protein RimM  35.62 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10000  16S rRNA processing protein RimM  33.14 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0953699  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0767  16S rRNA-processing protein RimM  33.94 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000495507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1619  16S rRNA processing protein RimM  33.55 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3353  16S rRNA-processing protein RimM  37.66 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.170561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1196  16S rRNA-processing protein RimM  35.33 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.934668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1829  16S rRNA processing protein RimM  37.5 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0393  16S rRNA processing protein RimM  33.33 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09770  16S rRNA processing protein RimM  33.33 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.098871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4619  16S rRNA processing protein RimM  30.43 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0324  16S rRNA processing protein RimM  35.47 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.884603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  34.62 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2658  16S rRNA processing protein RimM  31.25 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1514  16S rRNA-processing protein RimM  35.19 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621384  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4173  16S rRNA-processing protein RimM  31.61 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1284  16S rRNA processing protein RimM  30.73 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.304592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3277  16S rRNA processing protein RimM  32.69 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1283  16S rRNA-processing protein RimM  29.05 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.896512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2221  16S rRNA-processing protein RimM  32.73 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000411195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1474  16S rRNA processing protein RimM  30.36 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1020  16S rRNA-processing protein RimM  30.17 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104306  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0876  16S rRNA-processing protein RimM  31.52 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2189  16S rRNA-processing protein RimM  29.68 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0264003  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2538  16S rRNA processing protein RimM  33.53 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139064  normal  0.135293 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0934  16S rRNA-processing protein RimM  30.91 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0565923 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  29.52 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2539  16S rRNA-processing protein RimM  33.52 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  29.52 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1710  16S rRNA-processing protein RimM  32.47 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000120991  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0805  16S rRNA-processing protein RimM  32.12 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11060  16S rRNA processing protein RimM  33.7 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0760298  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3400  16S rRNA-processing protein RimM  30.36 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.80773 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0518  16S rRNA processing protein RimM  28.57 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.541026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1463  16S rRNA-processing protein RimM  27.59 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278393  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17291  16S rRNA-processing protein RimM  34.81 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4258  16S rRNA-processing protein RimM  27.59 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1632  16S rRNA processing protein RimM  32.28 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2406  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000189149  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0987  16S rRNA processing protein RimM  31.74 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000000842356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2013  16S rRNA-processing protein RimM  29.03 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.325457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1947  16S rRNA-processing protein RimM  29.03 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1967  16S rRNA-processing protein RimM  29.03 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0420461  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0201  16S rRNA processing protein RimM  25.15 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000521632  normal  0.064349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5924  16S rRNA processing protein RimM  31.48 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.144619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3065  16S rRNA processing protein RimM  30.67 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000508882  hitchhiker  0.000000546045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2374  16S rRNA processing protein RimM  29.27 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4156  16S rRNA-processing protein RimM  27.59 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12723  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0847  16S rRNA processing protein RimM  30.06 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17931  16S rRNA-processing protein RimM  27.01 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>