More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1220 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3228  transketolase  53.1 
 
 		 665 aa  668    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  56.64 
 
 		 665 aa  748    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  50.45 
 
 		 664 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  55.19 
 
 		 653 aa  717    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  56.34 
 
 		 663 aa  756    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  56.92 
 
 		 657 aa  735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  56.66 
 
 		 661 aa  751    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  50.6 
 
 		 665 aa  650    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  52.5 
 
 		 672 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  51.52 
 
 		 666 aa  657    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  55 
 
 		 663 aa  742    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  55.15 
 
 		 661 aa  703    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  49.17 
 
 		 665 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  57.08 
 
 		 657 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  54.9 
 
 		 738 aa  742    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  58.29 
 
 		 670 aa  735    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  55.17 
 
 		 666 aa  728    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  50.45 
 
 		 664 aa  636    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  49.78 
 
 		 665 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0910  transketolase  50.91 
 
 		 686 aa  638    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  59.38 
 
 		 671 aa  761    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  49.93 
 
 		 664 aa  635    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  47.23 
 
 		 661 aa  651    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  52.58 
 
 		 661 aa  649    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  55.84 
 
 		 661 aa  744    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  55.15 
 
 		 651 aa  699    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  52.2 
 
 		 672 aa  666    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  58.44 
 
 		 657 aa  694    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  56.99 
 
 		 684 aa  767    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  50.07 
 
 		 723 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  60.95 
 
 		 671 aa  794    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  54.96 
 
 		 681 aa  685    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  50.45 
 
 		 680 aa  646    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  55.45 
 
 		 667 aa  706    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  60.06 
 
 		 660 aa  727    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  50.15 
 
 		 694 aa  648    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  60.43 
 
 		 671 aa  789    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  56.05 
 
 		 662 aa  724    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  54.93 
 
 		 655 aa  727    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  47 
 
 		 663 aa  660    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  52.59 
 
 		 671 aa  688    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  53.27 
 
 		 666 aa  727    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  57.25 
 
 		 673 aa  767    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  52.66 
 
 		 686 aa  714    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  59.48 
 
 		 657 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  54.22 
 
 		 695 aa  698    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  100 
 
 		 677 aa  1367    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  53.51 
 
 		 657 aa  696    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  60.74 
 
 		 671 aa  793    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  56.63 
 
 		 662 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  55.59 
 
 		 655 aa  726    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  55.69 
 
 		 678 aa  731    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  58.13 
 
 		 657 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  52.35 
 
 		 672 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  50.45 
 
 		 664 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  51.75 
 
 		 673 aa  666    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  56.07 
 
 		 660 aa  736    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  57.85 
 
 		 663 aa  736    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  55.42 
 
 		 681 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  57.82 
 
 		 686 aa  736    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1497  transketolase  51.28 
 
 		 675 aa  637    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  50.45 
 
 		 664 aa  650    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  53.43 
 
 		 672 aa  655    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  56.39 
 
 		 660 aa  739    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  56.53 
 
 		 658 aa  725    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  49.77 
 
 		 665 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  57.19 
 
 		 668 aa  706    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02341  transketolase  51.73 
 
 		 666 aa  644    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.904862  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  55.42 
 
 		 681 aa  693    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  54.8 
 
 		 672 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  49.7 
 
 		 660 aa  633  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  51.76 
 
 		 653 aa  634  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  50.08 
 
 		 663 aa  633  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  50 
 
 		 666 aa  634  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  49.92 
 
 		 692 aa  633  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  50 
 
 		 664 aa  634  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  49.63 
 
 		 666 aa  633  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1034  transketolase  50.45 
 
 		 666 aa  633  1e-180  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  49.85 
 
 		 664 aa  631  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  52.48 
 
 		 668 aa  629  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  51.27 
 
 		 690 aa  629  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  49.1 
 
 		 665 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  49.18 
 
 		 681 aa  628  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  49.47 
 
 		 663 aa  631  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  49.32 
 
 		 666 aa  629  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  49.63 
 
 		 664 aa  631  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3900  transketolase  49.7 
 
 		 664 aa  630  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  49.55 
 
 		 675 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  48.49 
 
 		 662 aa  629  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  49.93 
 
 		 662 aa  628  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  44.61 
 
 		 690 aa  627  1e-178  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  48.34 
 
 		 668 aa  628  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0976  transketolase  53.01 
 
 		 664 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  48.5 
 
 		 666 aa  625  1e-178  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  48.65 
 
 		 663 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  49.09 
 
 		 663 aa  625  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3480  transketolase  49.1 
 
 		 664 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  49.18 
 
 		 665 aa  626  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  48.5 
 
 		 663 aa  625  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  48.65 
 
 		 663 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>