More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0137 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  57.27 
 
 
657 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  50.22 
 
 
663 aa  645    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  53.05 
 
 
681 aa  703    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  50.57 
 
 
690 aa  706    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  63.64 
 
 
657 aa  868    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  72.16 
 
 
663 aa  1005    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  55.27 
 
 
666 aa  736    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  50.75 
 
 
671 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  55.4 
 
 
672 aa  721    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  62.94 
 
 
684 aa  875    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  49.54 
 
 
692 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  55.01 
 
 
655 aa  720    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  49.55 
 
 
668 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  50.6 
 
 
671 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  49.55 
 
 
664 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  53.33 
 
 
677 aa  706    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  50.23 
 
 
677 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  52.88 
 
 
661 aa  693    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  59.09 
 
 
661 aa  805    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3228  transketolase  50.15 
 
 
665 aa  662    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  71.56 
 
 
663 aa  996    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  64.9 
 
 
658 aa  874    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  54.17 
 
 
672 aa  714    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  58.57 
 
 
657 aa  766    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  59.03 
 
 
661 aa  817    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  57.16 
 
 
665 aa  786    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  72.31 
 
 
738 aa  1004    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  57.27 
 
 
661 aa  752    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  49.55 
 
 
664 aa  644    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  55.76 
 
 
653 aa  726    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  100 
 
 
666 aa  1380    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  67.79 
 
 
651 aa  885    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6143  transketolase  50.92 
 
 
682 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  55.62 
 
 
695 aa  767    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  57.47 
 
 
660 aa  752    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  49.62 
 
 
665 aa  635    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  54.17 
 
 
672 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  57.03 
 
 
668 aa  768    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  56.53 
 
 
671 aa  773    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  59.35 
 
 
662 aa  795    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  53.8 
 
 
655 aa  711    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  53.03 
 
 
663 aa  701    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  55.49 
 
 
671 aa  748    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  58.42 
 
 
657 aa  762    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  57.16 
 
 
671 aa  781    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  56.82 
 
 
673 aa  784    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  57.96 
 
 
686 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  59.48 
 
 
667 aa  799    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  57.19 
 
 
671 aa  792    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  50 
 
 
694 aa  646    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  49.55 
 
 
723 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  56.64 
 
 
671 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  58.42 
 
 
662 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  53.87 
 
 
672 aa  709    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  48.73 
 
 
664 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  58.61 
 
 
678 aa  785    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  49.32 
 
 
660 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  50.37 
 
 
680 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  51.75 
 
 
673 aa  682    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  53.59 
 
 
660 aa  709    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  58.41 
 
 
670 aa  763    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  53.2 
 
 
681 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  68.52 
 
 
686 aa  937    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  50 
 
 
662 aa  643    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  53.51 
 
 
657 aa  716    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  49.55 
 
 
664 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  49.33 
 
 
666 aa  650    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  63.33 
 
 
657 aa  837    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  53.76 
 
 
660 aa  723    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  49.17 
 
 
657 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  49.55 
 
 
665 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  53.2 
 
 
681 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  58.07 
 
 
663 aa  789    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  47.97 
 
 
663 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  47.97 
 
 
663 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  50.38 
 
 
663 aa  633  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  47.85 
 
 
666 aa  632  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  47.85 
 
 
666 aa  632  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  50.76 
 
 
665 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  49.09 
 
 
667 aa  633  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  47.97 
 
 
663 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  50.08 
 
 
666 aa  634  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  49.25 
 
 
663 aa  632  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  49.09 
 
 
668 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  47.97 
 
 
663 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  50.83 
 
 
663 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  47.97 
 
 
663 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  48.12 
 
 
663 aa  633  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  48.27 
 
 
663 aa  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  49.47 
 
 
659 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  48.94 
 
 
665 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  48.12 
 
 
663 aa  633  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  47.82 
 
 
663 aa  630  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  51.06 
 
 
675 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  48.2 
 
 
664 aa  629  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  50.6 
 
 
672 aa  631  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  48.42 
 
 
664 aa  629  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  48.29 
 
 
666 aa  629  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  48.28 
 
 
665 aa  628  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  49.25 
 
 
675 aa  627  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>