More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0889 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  55.1 
 
 		 663 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  54.99 
 
 		 684 aa  714    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  56.99 
 
 		 663 aa  726    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  57.27 
 
 		 695 aa  721    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  55.34 
 
 		 663 aa  719    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  52.4 
 
 		 677 aa  653    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  53.16 
 
 		 661 aa  693    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  54.49 
 
 		 671 aa  710    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  100 
 
 		 672 aa  1384    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  53.68 
 
 		 665 aa  683    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  95.24 
 
 		 672 aa  1332    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  57.25 
 
 		 657 aa  671    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  57.38 
 
 		 651 aa  719    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  64.95 
 
 		 672 aa  860    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  55.49 
 
 		 738 aa  719    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  54.6 
 
 		 666 aa  683    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  56.19 
 
 		 655 aa  698    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  54.69 
 
 		 660 aa  665    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  57.14 
 
 		 668 aa  714    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  55 
 
 		 658 aa  687    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  54.56 
 
 		 671 aa  691    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  53.85 
 
 		 662 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  56.44 
 
 		 655 aa  707    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  70.79 
 
 		 671 aa  1002    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  71.65 
 
 		 657 aa  981    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  54.12 
 
 		 673 aa  685    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  54.23 
 
 		 686 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  53.87 
 
 		 661 aa  703    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  54.41 
 
 		 671 aa  679    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  56.33 
 
 		 657 aa  713    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  53.93 
 
 		 671 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  53.69 
 
 		 662 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  53.54 
 
 		 678 aa  692    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  55.16 
 
 		 653 aa  677    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  56.02 
 
 		 657 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  56.95 
 
 		 657 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  95.68 
 
 		 672 aa  1338    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  70.73 
 
 		 673 aa  988    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  54.8 
 
 		 660 aa  686    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  55.78 
 
 		 686 aa  703    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  53.87 
 
 		 666 aa  709    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  54.28 
 
 		 670 aa  675    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  52.41 
 
 		 661 aa  659    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  56.55 
 
 		 667 aa  706    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  53.35 
 
 		 660 aa  668    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  57.56 
 
 		 657 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  47.73 
 
 		 663 aa  633  1e-180  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  50.61 
 
 		 681 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  50.91 
 
 		 681 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  50.46 
 
 		 681 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  47.82 
 
 		 661 aa  618  1e-175  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  47.07 
 
 		 690 aa  612  9.999999999999999e-175  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  48.87 
 
 		 660 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  47.66 
 
 		 692 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  48.21 
 
 		 666 aa  598  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  48.44 
 
 		 670 aa  591  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  48.15 
 
 		 670 aa  592  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  49.34 
 
 		 680 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  47.59 
 
 		 668 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  47.44 
 
 		 668 aa  587  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  50.3 
 
 		 692 aa  587  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  48.14 
 
 		 723 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2599  transketolase  48.43 
 
 		 672 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  47.91 
 
 		 665 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  47.99 
 
 		 690 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  47.29 
 
 		 657 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  47.76 
 
 		 665 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2740  transketolase  48.33 
 
 		 659 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3391  transketolase  48.96 
 
 		 699 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0869549  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  48.14 
 
 		 690 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  47.02 
 
 		 666 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0220  transketolase  49.04 
 
 		 681 aa  580  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  47.84 
 
 		 690 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  47.84 
 
 		 690 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  47.84 
 
 		 690 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  47.61 
 
 		 665 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6143  transketolase  49.77 
 
 		 682 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  47.84 
 
 		 690 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  48.14 
 
 		 690 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  47.84 
 
 		 675 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  47.84 
 
 		 690 aa  580  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  48.65 
 
 		 664 aa  580  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  48.66 
 
 		 662 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  48.03 
 
 		 681 aa  581  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  47.86 
 
 		 664 aa  581  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  48.14 
 
 		 690 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  48.8 
 
 		 665 aa  580  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  47.84 
 
 		 696 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  47.84 
 
 		 690 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  48.14 
 
 		 690 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  47.6 
 
 		 663 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  47.75 
 
 		 663 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  47.82 
 
 		 694 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  47.6 
 
 		 663 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  47.75 
 
 		 663 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2748  transketolase  47.54 
 
 		 690 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.495668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  46.48 
 
 		 677 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  47.97 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  47.6 
 
 		 663 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  47.6 
 
 		 663 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>