More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2748 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  60.66 
 
 
667 aa  823    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  63.64 
 
 
663 aa  874    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  63.64 
 
 
663 aa  874    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  60.66 
 
 
667 aa  823    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  50.15 
 
 
666 aa  647    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  50.15 
 
 
666 aa  647    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  62.65 
 
 
665 aa  849    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  92.61 
 
 
696 aa  1321    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  65.92 
 
 
670 aa  895    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  65.92 
 
 
670 aa  895    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  48.77 
 
 
690 aa  648    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  71.41 
 
 
675 aa  945    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  51.48 
 
 
670 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  49.48 
 
 
666 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  60.51 
 
 
662 aa  837    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  63.93 
 
 
664 aa  875    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4319  transketolase  60.71 
 
 
666 aa  823    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.658339  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  62.89 
 
 
664 aa  864    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  63.1 
 
 
665 aa  857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  66.62 
 
 
680 aa  888    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  49.93 
 
 
666 aa  639    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  92.61 
 
 
690 aa  1320    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  62.68 
 
 
680 aa  884    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  61.32 
 
 
692 aa  819    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2479  transketolase  52.4 
 
 
664 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  92.61 
 
 
690 aa  1320    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  57.01 
 
 
668 aa  770    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  56.42 
 
 
668 aa  764    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  60.93 
 
 
667 aa  822    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  62.95 
 
 
665 aa  862    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  57.8 
 
 
665 aa  781    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  63.72 
 
 
668 aa  849    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  60.51 
 
 
690 aa  796    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  48.37 
 
 
670 aa  635    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  71.17 
 
 
677 aa  970    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  63.73 
 
 
681 aa  860    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  66.67 
 
 
661 aa  918    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  69.17 
 
 
657 aa  950    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  51.97 
 
 
670 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  92.75 
 
 
690 aa  1322    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  63.17 
 
 
665 aa  857    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  62.8 
 
 
681 aa  845    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  63.64 
 
 
664 aa  875    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  94.06 
 
 
690 aa  1342    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  57.08 
 
 
668 aa  749    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  62.65 
 
 
665 aa  848    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  62.37 
 
 
723 aa  870    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  59.46 
 
 
664 aa  783    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0244  transketolase  60.3 
 
 
662 aa  821    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3959  transketolase  67.36 
 
 
678 aa  877    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  62.83 
 
 
694 aa  884    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  60.21 
 
 
662 aa  830    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  54.25 
 
 
668 aa  659    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  67.22 
 
 
671 aa  903    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  62.31 
 
 
666 aa  848    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  58.59 
 
 
682 aa  752    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  92.03 
 
 
690 aa  1260    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  53.74 
 
 
671 aa  646    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  48.66 
 
 
670 aa  637    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  53.6 
 
 
655 aa  664    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  62.35 
 
 
664 aa  865    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  92.61 
 
 
690 aa  1320    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4112  transketolase  64.64 
 
 
693 aa  836    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  62.82 
 
 
667 aa  843    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  53.21 
 
 
673 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0192  transketolase  62.96 
 
 
693 aa  839    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  65.52 
 
 
663 aa  900    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4349  transketolase  61 
 
 
693 aa  825    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  65.53 
 
 
674 aa  863    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  85.97 
 
 
662 aa  1172    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  69.37 
 
 
680 aa  952    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  62.15 
 
 
664 aa  847    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  53.74 
 
 
671 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4585  transketolase  66.72 
 
 
695 aa  881    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  60.03 
 
 
663 aa  769    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  61.47 
 
 
663 aa  818    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  92.74 
 
 
675 aa  1292    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  57.36 
 
 
665 aa  774    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  62.76 
 
 
684 aa  840    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  71.02 
 
 
659 aa  957    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  56.42 
 
 
665 aa  795    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  63.76 
 
 
663 aa  858    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  52.09 
 
 
667 aa  643    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  63.79 
 
 
664 aa  862    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  95.36 
 
 
690 aa  1357    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  95.36 
 
 
690 aa  1357    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1984  transketolase  64.68 
 
 
693 aa  829    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  62.69 
 
 
666 aa  869    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  92.75 
 
 
690 aa  1322    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  62.76 
 
 
662 aa  865    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  62.59 
 
 
663 aa  855    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  63.64 
 
 
664 aa  875    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  63.49 
 
 
664 aa  874    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  60.6 
 
 
666 aa  801    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  60.84 
 
 
665 aa  807    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  62.11 
 
 
680 aa  856    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  64.36 
 
 
666 aa  852    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  94.93 
 
 
690 aa  1356    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  64.16 
 
 
665 aa  875    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  59.61 
 
 
664 aa  788    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.582031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>