More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1984 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  58.82 
 
 		 667 aa  792    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  61.29 
 
 		 663 aa  843    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  61.29 
 
 		 663 aa  843    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  58.82 
 
 		 667 aa  792    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  49.56 
 
 		 666 aa  644    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  49.56 
 
 		 666 aa  644    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  61.35 
 
 		 665 aa  829    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0192  transketolase  59.01 
 
 		 693 aa  783    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  62.11 
 
 		 670 aa  831    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  62.11 
 
 		 670 aa  831    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2479  transketolase  55.1 
 
 		 664 aa  698    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  65.37 
 
 		 675 aa  853    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  61.49 
 
 		 663 aa  824    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  64.77 
 
 		 675 aa  875    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  58.06 
 
 		 662 aa  805    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  60.9 
 
 		 664 aa  826    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  51.11 
 
 		 663 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  60.45 
 
 		 664 aa  815    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  61.04 
 
 		 665 aa  826    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  60.24 
 
 		 668 aa  776    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  60.9 
 
 		 666 aa  824    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  62.65 
 
 		 694 aa  851    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  57.48 
 
 		 667 aa  772    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  63.16 
 
 		 680 aa  828    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  64.77 
 
 		 690 aa  874    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  56.1 
 
 		 668 aa  769    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  55.65 
 
 		 668 aa  763    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  61.04 
 
 		 664 aa  791    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  61.04 
 
 		 665 aa  828    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  59.7 
 
 		 665 aa  812    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  64.71 
 
 		 668 aa  855    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  62.72 
 
 		 690 aa  840    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  61.19 
 
 		 664 aa  828    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  54.92 
 
 		 666 aa  671    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  64.23 
 
 		 677 aa  872    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4585  transketolase  62.55 
 
 		 695 aa  827    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  66.07 
 
 		 661 aa  904    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  61.64 
 
 		 723 aa  842    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  58.58 
 
 		 662 aa  792    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  65.01 
 
 		 690 aa  877    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  61.35 
 
 		 665 aa  817    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  61.75 
 
 		 681 aa  836    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1984  transketolase  100 
 
 		 693 aa  1419    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  65.5 
 
 		 690 aa  873    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4319  transketolase  60.99 
 
 		 666 aa  798    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.658339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  51.79 
 
 		 669 aa  638    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  58.81 
 
 		 664 aa  771    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0244  transketolase  57.32 
 
 		 662 aa  768    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179813  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  61.5 
 
 		 665 aa  830    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  51.1 
 
 		 655 aa  638    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  65.17 
 
 		 671 aa  872    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  59.17 
 
 		 664 aa  807    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  60.74 
 
 		 682 aa  790    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  64.09 
 
 		 690 aa  849    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  53.85 
 
 		 671 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  64.06 
 
 		 657 aa  879    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  52.3 
 
 		 655 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  64.77 
 
 		 690 aa  874    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  61.1 
 
 		 692 aa  792    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4112  transketolase  60.64 
 
 		 693 aa  782    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  61.55 
 
 		 667 aa  836    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  52.37 
 
 		 673 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  59.5 
 
 		 666 aa  810    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  62.13 
 
 		 663 aa  856    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4349  transketolase  57.7 
 
 		 693 aa  768    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  61.63 
 
 		 674 aa  809    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  64.49 
 
 		 662 aa  844    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  64.94 
 
 		 680 aa  858    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  61.04 
 
 		 664 aa  833    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  53.63 
 
 		 671 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3959  transketolase  62.65 
 
 		 678 aa  814    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  59.1 
 
 		 663 aa  749    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  60.09 
 
 		 663 aa  796    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  62.65 
 
 		 680 aa  852    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  59.26 
 
 		 665 aa  807    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  61.95 
 
 		 684 aa  827    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  65.47 
 
 		 659 aa  876    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  53.42 
 
 		 665 aa  755    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  61.46 
 
 		 681 aa  810    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  64.77 
 
 		 690 aa  874    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  65.07 
 
 		 690 aa  868    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  61.34 
 
 		 664 aa  811    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  51.27 
 
 		 666 aa  641    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  60.6 
 
 		 666 aa  824    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  61.29 
 
 		 663 aa  840    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  60.27 
 
 		 662 aa  831    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  64.92 
 
 		 696 aa  877    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  61.19 
 
 		 664 aa  832    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  61.19 
 
 		 664 aa  828    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  61.08 
 
 		 666 aa  810    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  61.16 
 
 		 665 aa  816    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  60.15 
 
 		 680 aa  816    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  63.25 
 
 		 666 aa  844    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  64.63 
 
 		 690 aa  865    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  61.79 
 
 		 665 aa  846    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  51.11 
 
 		 738 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  65.07 
 
 		 690 aa  868    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  65.01 
 
 		 690 aa  877    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  61.7 
 
 		 664 aa  837    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3540  transketolase  61.49 
 
 		 664 aa  815    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0018246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>