More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1968 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2759  transketolase  55.06 
 
 		 663 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  52.51 
 
 		 663 aa  663    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  52.51 
 
 		 663 aa  663    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  54.05 
 
 		 680 aa  679    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  55.02 
 
 		 692 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  54.92 
 
 		 680 aa  672    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  53.15 
 
 		 665 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  52.8 
 
 		 670 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  52.8 
 
 		 670 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  48.33 
 
 		 690 aa  655    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  55.3 
 
 		 675 aa  658    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  53.4 
 
 		 675 aa  671    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  50.46 
 
 		 662 aa  643    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  53.18 
 
 		 657 aa  677    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  60.37 
 
 		 663 aa  770    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  52.75 
 
 		 664 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  52.84 
 
 		 665 aa  663    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  60.09 
 
 		 657 aa  706    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  52.75 
 
 		 664 aa  651    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  53.4 
 
 		 690 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  53.4 
 
 		 690 aa  670    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  53.36 
 
 		 664 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  52.36 
 
 		 663 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  52.53 
 
 		 665 aa  659    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  51.37 
 
 		 665 aa  647    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  53.7 
 
 		 668 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  51.47 
 
 		 690 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4585  transketolase  52.34 
 
 		 695 aa  677    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  56.44 
 
 		 672 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  54.71 
 
 		 677 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  51.06 
 
 		 661 aa  676    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  54.06 
 
 		 661 aa  674    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  55.67 
 
 		 661 aa  718    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  52.68 
 
 		 681 aa  662    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  53.4 
 
 		 690 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  51.77 
 
 		 665 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  53.14 
 
 		 681 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  55.67 
 
 		 672 aa  704    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  60.4 
 
 		 657 aa  709    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  51.75 
 
 		 667 aa  659    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  54.46 
 
 		 690 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0192  transketolase  52.76 
 
 		 693 aa  665    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  54.27 
 
 		 668 aa  662    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  51.84 
 
 		 664 aa  635    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  60.71 
 
 		 657 aa  721    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  53.25 
 
 		 696 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  51.98 
 
 		 664 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  51.83 
 
 		 668 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  52.79 
 
 		 671 aa  668    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  59.1 
 
 		 660 aa  724    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  53.4 
 
 		 690 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  54.48 
 
 		 690 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  57.65 
 
 		 671 aa  721    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  54.67 
 
 		 662 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  100 
 
 		 655 aa  1342    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  49.85 
 
 		 663 aa  671    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  53.53 
 
 		 671 aa  697    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4112  transketolase  52.24 
 
 		 693 aa  645    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  52.97 
 
 		 667 aa  667    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  56.45 
 
 		 673 aa  701    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  53.14 
 
 		 686 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  53.59 
 
 		 663 aa  679    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4349  transketolase  49.56 
 
 		 693 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  53.44 
 
 		 674 aa  658    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  52.21 
 
 		 662 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  53.41 
 
 		 680 aa  661    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  52.36 
 
 		 664 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  57.43 
 
 		 671 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  55.14 
 
 		 662 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  55.98 
 
 		 672 aa  709    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  52.2 
 
 		 663 aa  648    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  56.04 
 
 		 678 aa  704    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  50.76 
 
 		 665 aa  641    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  51.74 
 
 		 684 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  54.31 
 
 		 659 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  53.4 
 
 		 690 aa  670    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  59.01 
 
 		 668 aa  731    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  54.05 
 
 		 673 aa  679    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  70.94 
 
 		 660 aa  940    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  54.17 
 
 		 690 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  59.53 
 
 		 672 aa  737    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  51.9 
 
 		 681 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  52.84 
 
 		 666 aa  663    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  57.1 
 
 		 686 aa  722    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  51.9 
 
 		 662 aa  673    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  53.8 
 
 		 666 aa  711    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  53.21 
 
 		 664 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  53.36 
 
 		 664 aa  657    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  54.73 
 
 		 666 aa  662    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  55.34 
 
 		 665 aa  670    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  51.75 
 
 		 680 aa  636    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  56.31 
 
 		 660 aa  715    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  54.02 
 
 		 690 aa  668    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  52.23 
 
 		 665 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3959  transketolase  53.43 
 
 		 678 aa  657    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  54.17 
 
 		 690 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  52.68 
 
 		 666 aa  663    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  51.9 
 
 		 681 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  53.37 
 
 		 666 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  53.52 
 
 		 664 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>