More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2601 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  51.21 
 
 		 667 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  51.9 
 
 		 663 aa  655    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  51.9 
 
 		 663 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  51.21 
 
 		 667 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  52.51 
 
 		 694 aa  667    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  52.74 
 
 		 666 aa  656    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  51.15 
 
 		 665 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  52.12 
 
 		 670 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  51.96 
 
 		 670 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  48.48 
 
 		 690 aa  659    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  59.04 
 
 		 738 aa  772    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  60.81 
 
 		 671 aa  773    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  55.78 
 
 		 677 aa  711    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  50.3 
 
 		 662 aa  636    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  51.22 
 
 		 668 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  59.04 
 
 		 663 aa  773    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  62.56 
 
 		 684 aa  805    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  50.69 
 
 		 665 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  58.39 
 
 		 668 aa  719    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  50.08 
 
 		 657 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  55.99 
 
 		 661 aa  703    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  61.28 
 
 		 657 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  55.01 
 
 		 666 aa  720    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  52.34 
 
 		 680 aa  669    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  51.95 
 
 		 690 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  55.38 
 
 		 651 aa  697    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  52.05 
 
 		 664 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  50.99 
 
 		 665 aa  655    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  51.91 
 
 		 723 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  51.75 
 
 		 675 aa  649    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  52.62 
 
 		 690 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  51.99 
 
 		 666 aa  651    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  60.65 
 
 		 657 aa  704    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  52.66 
 
 		 664 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  49.77 
 
 		 661 aa  656    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  51.9 
 
 		 661 aa  657    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  56.17 
 
 		 661 aa  714    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  56.04 
 
 		 672 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  51.95 
 
 		 690 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  51.3 
 
 		 665 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  51.76 
 
 		 681 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  56.37 
 
 		 672 aa  699    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  60.96 
 
 		 657 aa  709    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  59.84 
 
 		 672 aa  741    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  51.9 
 
 		 663 aa  655    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  51.95 
 
 		 675 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  51.59 
 
 		 664 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  55.09 
 
 		 695 aa  708    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  51.52 
 
 		 663 aa  647    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  52.21 
 
 		 663 aa  656    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  51.95 
 
 		 690 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  54.31 
 
 		 670 aa  671    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  52.6 
 
 		 671 aa  649    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  60.9 
 
 		 660 aa  735    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  53.53 
 
 		 668 aa  660    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  51.24 
 
 		 692 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  55.93 
 
 		 671 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  54.9 
 
 		 662 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  68.72 
 
 		 655 aa  920    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  50.08 
 
 		 663 aa  660    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  55.21 
 
 		 671 aa  713    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  51.95 
 
 		 690 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  51.06 
 
 		 667 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  56.92 
 
 		 673 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  55.02 
 
 		 686 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  51.13 
 
 		 663 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  56.57 
 
 		 666 aa  736    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  51.95 
 
 		 690 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  51.36 
 
 		 662 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  52.51 
 
 		 680 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  51.89 
 
 		 664 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  56.24 
 
 		 671 aa  711    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  55.37 
 
 		 662 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  51.8 
 
 		 696 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  53.61 
 
 		 663 aa  679    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  56.24 
 
 		 678 aa  702    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  100 
 
 		 655 aa  1341    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  51.98 
 
 		 664 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  56.6 
 
 		 663 aa  730    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  53.46 
 
 		 680 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  51.59 
 
 		 664 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  53.45 
 
 		 673 aa  677    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  71.93 
 
 		 660 aa  976    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  51.87 
 
 		 690 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  52.7 
 
 		 681 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  50 
 
 		 666 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  58.44 
 
 		 686 aa  747    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  50.23 
 
 		 662 aa  641    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  56.19 
 
 		 672 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  51.75 
 
 		 664 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  51.44 
 
 		 664 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  54.42 
 
 		 666 aa  664    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  54.57 
 
 		 665 aa  665    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  51.51 
 
 		 680 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  54.5 
 
 		 660 aa  693    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  51.87 
 
 		 690 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  52.07 
 
 		 665 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  59.06 
 
 		 663 aa  770    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  51.87 
 
 		 690 aa  637    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  52.7 
 
 		 681 aa  663    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>