More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2650 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4585  transketolase  50.93 
 
 		 695 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  50.38 
 
 		 663 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  50.38 
 
 		 663 aa  641    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  50.38 
 
 		 663 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  50.68 
 
 		 664 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  53.18 
 
 		 664 aa  675    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  58.59 
 
 		 653 aa  752    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  51.13 
 
 		 667 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  51.67 
 
 		 665 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  58.58 
 
 		 672 aa  762    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  51.8 
 
 		 670 aa  658    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  51.8 
 
 		 670 aa  658    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  53.22 
 
 		 690 aa  726    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  60.62 
 
 		 695 aa  784    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  52.94 
 
 		 675 aa  650    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  49.77 
 
 		 662 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  61.21 
 
 		 668 aa  790    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  75.46 
 
 		 663 aa  1006    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  75.61 
 
 		 738 aa  1006    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  51.52 
 
 		 665 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  57.47 
 
 		 666 aa  749    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  57.38 
 
 		 672 aa  752    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  52.65 
 
 		 668 aa  653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  66.36 
 
 		 684 aa  910    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  49.92 
 
 		 668 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  50.08 
 
 		 668 aa  645    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  51.82 
 
 		 665 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5014  transketolase  51.37 
 
 		 665 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16096 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  58.73 
 
 		 670 aa  763    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  56.16 
 
 		 655 aa  741    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  67.79 
 
 		 666 aa  934    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  51.74 
 
 		 677 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  53.76 
 
 		 661 aa  713    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  51.67 
 
 		 661 aa  652    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  62.58 
 
 		 661 aa  822    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  50.92 
 
 		 666 aa  642    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  50.53 
 
 		 663 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  50.83 
 
 		 665 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  50.3 
 
 		 681 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  57.08 
 
 		 672 aa  749    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  60 
 
 		 657 aa  758    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  55.03 
 
 		 657 aa  737    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  53.33 
 
 		 664 aa  676    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  52.42 
 
 		 668 aa  645    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  51.77 
 
 		 657 aa  650    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  52.64 
 
 		 694 aa  665    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  50.54 
 
 		 692 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  59.85 
 
 		 657 aa  754    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  60.16 
 
 		 671 aa  810    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  55.4 
 
 		 677 aa  719    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  64.67 
 
 		 663 aa  840    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  60.78 
 
 		 660 aa  776    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  50.61 
 
 		 662 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  60 
 
 		 657 aa  762    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  59.05 
 
 		 671 aa  793    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  63.44 
 
 		 662 aa  812    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  56.75 
 
 		 655 aa  756    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  53.76 
 
 		 663 aa  726    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  57.62 
 
 		 671 aa  771    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  57.65 
 
 		 681 aa  744    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  53.33 
 
 		 664 aa  676    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  60.03 
 
 		 673 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  62.27 
 
 		 686 aa  814    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  51.29 
 
 		 663 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  51.59 
 
 		 664 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  100 
 
 		 651 aa  1344    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  50.53 
 
 		 663 aa  643    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  62.88 
 
 		 661 aa  809    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  50.38 
 
 		 664 aa  637    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  58.9 
 
 		 671 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  62.81 
 
 		 662 aa  795    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  57.38 
 
 		 672 aa  759    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  52.86 
 
 		 663 aa  653    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  61.66 
 
 		 678 aa  802    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  52.5 
 
 		 723 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  50.38 
 
 		 663 aa  641    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  52.34 
 
 		 659 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3480  transketolase  52.27 
 
 		 664 aa  646    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  51.21 
 
 		 666 aa  640    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  54.34 
 
 		 673 aa  711    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  55.98 
 
 		 660 aa  739    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3954  transketolase  52.12 
 
 		 664 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  52.64 
 
 		 680 aa  665    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  57.8 
 
 		 681 aa  751    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  50.53 
 
 		 666 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  73.24 
 
 		 686 aa  962    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  51.66 
 
 		 662 aa  660    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  74.08 
 
 		 663 aa  993    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  51.06 
 
 		 664 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0876  transketolase  50.53 
 
 		 663 aa  637    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  53.8 
 
 		 666 aa  662    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  54.02 
 
 		 665 aa  668    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  51.67 
 
 		 665 aa  652    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  55.98 
 
 		 660 aa  739    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  51.34 
 
 		 690 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  52.34 
 
 		 665 aa  668    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  53.25 
 
 		 663 aa  665    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  52.73 
 
 		 667 aa  644    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0220  transketolase  51.7 
 
 		 681 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  57.8 
 
 		 681 aa  752    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>