More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1535 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3638  transketolase  50.23 
 
 		 658 aa  639    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  51.93 
 
 		 695 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  51.98 
 
 		 684 aa  669    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  100 
 
 		 692 aa  1396    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  50.54 
 
 		 663 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  52.39 
 
 		 670 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  49.07 
 
 		 665 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  50.99 
 
 		 663 aa  667    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6143  transketolase  61.88 
 
 		 682 aa  783    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  51.22 
 
 		 738 aa  667    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  50.47 
 
 		 657 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2740  transketolase  71.39 
 
 		 659 aa  884    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  70.17 
 
 		 660 aa  915    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  53.82 
 
 		 660 aa  641    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  50.47 
 
 		 655 aa  641    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  48.78 
 
 		 671 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  51.63 
 
 		 653 aa  661    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  49.54 
 
 		 666 aa  663    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  51.37 
 
 		 681 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  50.92 
 
 		 686 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  52.18 
 
 		 671 aa  645    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  51.4 
 
 		 655 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  51.22 
 
 		 681 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  52.89 
 
 		 667 aa  635    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  50.91 
 
 		 681 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  50.08 
 
 		 677 aa  632  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  50.84 
 
 		 671 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  49.55 
 
 		 660 aa  633  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  50.54 
 
 		 651 aa  630  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  50.99 
 
 		 663 aa  631  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  50.77 
 
 		 673 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  49.54 
 
 		 657 aa  630  1e-179  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  50.23 
 
 		 671 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  50.31 
 
 		 671 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  45.57 
 
 		 663 aa  626  1e-178  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  50.99 
 
 		 661 aa  625  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  49.77 
 
 		 661 aa  622  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  49.31 
 
 		 666 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  45.78 
 
 		 661 aa  620  1e-176  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  50.31 
 
 		 657 aa  618  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  48.63 
 
 		 661 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  44.27 
 
 		 690 aa  610  1e-173  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  49.85 
 
 		 668 aa  611  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  49.7 
 
 		 660 aa  611  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  47.66 
 
 		 672 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  48.26 
 
 		 672 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  49.09 
 
 		 662 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  48.11 
 
 		 672 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  48.33 
 
 		 686 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  49.08 
 
 		 678 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  49.24 
 
 		 662 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  47.61 
 
 		 672 aa  596  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  51.05 
 
 		 657 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  50.9 
 
 		 657 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  47.47 
 
 		 663 aa  587  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  47.25 
 
 		 665 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  50.31 
 
 		 657 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  47.25 
 
 		 723 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  46.68 
 
 		 663 aa  578  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  48.11 
 
 		 659 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  46.88 
 
 		 665 aa  580  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3228  transketolase  46.9 
 
 		 665 aa  580  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  47.01 
 
 		 664 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  48.17 
 
 		 671 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  47.81 
 
 		 661 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  47.14 
 
 		 663 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  46.72 
 
 		 664 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  48.17 
 
 		 671 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  47.01 
 
 		 664 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02341  transketolase  47.05 
 
 		 666 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.904862  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  46.51 
 
 		 694 aa  574  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  46.86 
 
 		 665 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  45.74 
 
 		 673 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  45.65 
 
 		 666 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  46.93 
 
 		 664 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1034  transketolase  46.6 
 
 		 666 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  46.4 
 
 		 666 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  46.84 
 
 		 668 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  48.25 
 
 		 677 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  46.55 
 
 		 680 aa  572  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  48.2 
 
 		 680 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  47.37 
 
 		 663 aa  570  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  47.09 
 
 		 664 aa  571  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0910  transketolase  46.29 
 
 		 686 aa  572  1e-161  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  46.94 
 
 		 664 aa  572  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  46.4 
 
 		 665 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  45.72 
 
 		 665 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  46.41 
 
 		 664 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  46.34 
 
 		 664 aa  565  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  46.02 
 
 		 666 aa  567  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0777  transketolase  46.63 
 
 		 665 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  47.09 
 
 		 662 aa  566  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  45.7 
 
 		 665 aa  567  1e-160  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  46.48 
 
 		 681 aa  568  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  47.6 
 
 		 668 aa  566  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  46.19 
 
 		 667 aa  567  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  45.8 
 
 		 663 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3900  transketolase  46.41 
 
 		 664 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  46.63 
 
 		 664 aa  568  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  46.57 
 
 		 675 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>