More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4387 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  100 
 
 		 660 aa  1325    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  50.16 
 
 		 657 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  70.17 
 
 		 692 aa  908    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  50.84 
 
 		 663 aa  641    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  53.5 
 
 		 671 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2740  transketolase  89.19 
 
 		 659 aa  1135    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131701 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  50.99 
 
 		 738 aa  640    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6143  transketolase  62.58 
 
 		 682 aa  810    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  52.75 
 
 		 671 aa  650    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  53.18 
 
 		 695 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  53.61 
 
 		 660 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  51.68 
 
 		 671 aa  636    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  49.33 
 
 		 671 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  51.76 
 
 		 673 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  49.32 
 
 		 666 aa  645    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  51.83 
 
 		 671 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  51.75 
 
 		 681 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  51.75 
 
 		 681 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  51.07 
 
 		 684 aa  647    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  50.91 
 
 		 657 aa  636    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  50.54 
 
 		 655 aa  633  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  50.46 
 
 		 663 aa  634  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  51.14 
 
 		 681 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  50.23 
 
 		 666 aa  628  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  50.23 
 
 		 655 aa  628  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  50.69 
 
 		 658 aa  624  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  51.3 
 
 		 686 aa  625  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  51.68 
 
 		 663 aa  619  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  45.45 
 
 		 690 aa  616  1e-175  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  50.38 
 
 		 651 aa  616  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  49.47 
 
 		 672 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  49.62 
 
 		 672 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  51.68 
 
 		 667 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  49.62 
 
 		 686 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  49.77 
 
 		 660 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  49.69 
 
 		 677 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  50.47 
 
 		 657 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  50.15 
 
 		 661 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  48.99 
 
 		 665 aa  611  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  49.7 
 
 		 661 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  49.77 
 
 		 653 aa  611  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  51.89 
 
 		 657 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  48.87 
 
 		 672 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  49.77 
 
 		 672 aa  608  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  52.74 
 
 		 657 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  51.74 
 
 		 657 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  50.77 
 
 		 668 aa  601  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  50 
 
 		 662 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  45.36 
 
 		 663 aa  600  1e-170  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  49.47 
 
 		 660 aa  597  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  50 
 
 		 670 aa  598  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  48.94 
 
 		 678 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  49.55 
 
 		 661 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  49.32 
 
 		 662 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  45.81 
 
 		 661 aa  581  1e-164  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  46.92 
 
 		 663 aa  579  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  49.1 
 
 		 663 aa  579  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  49.77 
 
 		 680 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  46.17 
 
 		 663 aa  569  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  46.15 
 
 		 664 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  46.08 
 
 		 673 aa  565  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  46.15 
 
 		 664 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  46.15 
 
 		 664 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  45.85 
 
 		 665 aa  564  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  46.25 
 
 		 694 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  46.47 
 
 		 664 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  47.15 
 
 		 663 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  46.39 
 
 		 666 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  46.1 
 
 		 680 aa  561  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  46.54 
 
 		 661 aa  560  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  45.92 
 
 		 664 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  47.43 
 
 		 675 aa  559  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  50.53 
 
 		 682 aa  558  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  46.6 
 
 		 668 aa  558  1e-157  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  45.7 
 
 		 666 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  46.06 
 
 		 663 aa  557  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0777  transketolase  46.32 
 
 		 665 aa  557  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  47.03 
 
 		 671 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2618  transketolase  45.7 
 
 		 666 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  45.74 
 
 		 666 aa  557  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  46.88 
 
 		 671 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2840  transketolase  45.7 
 
 		 666 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  45.7 
 
 		 666 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  45.59 
 
 		 664 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2667  transketolase  45.55 
 
 		 666 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  45.21 
 
 		 657 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  45.93 
 
 		 664 aa  555  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1497  transketolase  46.74 
 
 		 675 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  45.99 
 
 		 665 aa  555  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  44.53 
 
 		 667 aa  554  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  46.08 
 
 		 664 aa  554  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  45.12 
 
 		 671 aa  552  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  47.21 
 
 		 662 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  48.1 
 
 		 653 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  46.69 
 
 		 663 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  45.66 
 
 		 666 aa  555  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  44.36 
 
 		 662 aa  553  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3391  transketolase  47.21 
 
 		 699 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0869549  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  44.86 
 
 		 666 aa  549  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  47.22 
 
 		 668 aa  550  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0287801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>