More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1497 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  63.29 
 
 
667 aa  899    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  67.22 
 
 
663 aa  952    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  67.22 
 
 
663 aa  952    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  63.29 
 
 
667 aa  899    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  51.06 
 
 
666 aa  681    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  51.06 
 
 
666 aa  681    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  67.12 
 
 
665 aa  931    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  67.57 
 
 
664 aa  947    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  67.02 
 
 
690 aa  902    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  70.25 
 
 
670 aa  971    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  69.88 
 
 
670 aa  971    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  63.9 
 
 
668 aa  864    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  68.68 
 
 
675 aa  907    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  62.99 
 
 
662 aa  894    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  49.47 
 
 
666 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  63.75 
 
 
662 aa  903    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  67.17 
 
 
690 aa  904    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  51.06 
 
 
666 aa  678    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  69.03 
 
 
664 aa  952    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  66.82 
 
 
665 aa  924    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  50.45 
 
 
670 aa  658    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  49.02 
 
 
666 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  49.85 
 
 
668 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  49.17 
 
 
666 aa  640    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  67.02 
 
 
690 aa  902    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  49.17 
 
 
666 aa  640    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  67.02 
 
 
690 aa  902    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  56.24 
 
 
668 aa  790    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  55.19 
 
 
668 aa  775    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  66.52 
 
 
665 aa  919    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  64.95 
 
 
665 aa  894    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  72.26 
 
 
668 aa  983    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  62.57 
 
 
690 aa  858    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  50 
 
 
670 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  70.82 
 
 
677 aa  954    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  72.97 
 
 
661 aa  1017    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  66.72 
 
 
667 aa  919    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  53.37 
 
 
670 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  67.17 
 
 
690 aa  904    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  67.66 
 
 
665 aa  936    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  67.73 
 
 
681 aa  941    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  66.87 
 
 
690 aa  899    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  68.48 
 
 
663 aa  939    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  52.11 
 
 
670 aa  655    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  51.65 
 
 
669 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  63.8 
 
 
664 aa  853    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0244  transketolase  62.08 
 
 
662 aa  859    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179813  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  65.35 
 
 
680 aa  873    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  49.02 
 
 
666 aa  640    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  49.02 
 
 
668 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  55.12 
 
 
668 aa  670    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  76.3 
 
 
671 aa  1073    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  49.7 
 
 
668 aa  646    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  61.33 
 
 
682 aa  814    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  66.42 
 
 
690 aa  871    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  69.79 
 
 
664 aa  948    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  64.37 
 
 
664 aa  863    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  53.85 
 
 
655 aa  673    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1984  transketolase  62.68 
 
 
693 aa  821    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4112  transketolase  60.95 
 
 
693 aa  805    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  66.87 
 
 
667 aa  928    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  67.32 
 
 
696 aa  906    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0192  transketolase  61.88 
 
 
693 aa  835    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  67.78 
 
 
663 aa  936    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4349  transketolase  58.64 
 
 
693 aa  806    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  62.63 
 
 
674 aa  855    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  66.32 
 
 
662 aa  887    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  63.15 
 
 
680 aa  869    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  68.13 
 
 
664 aa  951    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  66.62 
 
 
663 aa  936    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  69.49 
 
 
664 aa  963    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  62.44 
 
 
663 aa  836    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  63.35 
 
 
663 aa  888    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4585  transketolase  64.66 
 
 
695 aa  847    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  64.5 
 
 
665 aa  891    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  61.5 
 
 
684 aa  846    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  70 
 
 
659 aa  938    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  59.33 
 
 
665 aa  850    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  62.57 
 
 
681 aa  842    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  52.13 
 
 
667 aa  656    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  66.47 
 
 
675 aa  902    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  67.02 
 
 
690 aa  905    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  69.94 
 
 
664 aa  968    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  49.17 
 
 
668 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  67.37 
 
 
666 aa  951    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3959  transketolase  63.39 
 
 
678 aa  835    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  68.37 
 
 
662 aa  959    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  53.65 
 
 
672 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  69.49 
 
 
664 aa  965    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  69.34 
 
 
664 aa  960    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  63.53 
 
 
666 aa  892    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  63.92 
 
 
665 aa  897    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  68.43 
 
 
680 aa  951    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  62.15 
 
 
692 aa  825    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  66.42 
 
 
690 aa  899    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  68.79 
 
 
665 aa  947    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  67.51 
 
 
666 aa  941    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  65.96 
 
 
657 aa  918    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  67.02 
 
 
690 aa  905    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  68.79 
 
 
666 aa  948    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>