More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0538 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00688  transketolase TktA (AFU_orthologue; AFUA_1G13500)  54.72 
 
 		 684 aa  715    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0372185  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  53.71 
 
 		 667 aa  696    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  56.36 
 
 		 663 aa  725    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  56.36 
 
 		 663 aa  725    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  53.71 
 
 		 667 aa  696    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  53.86 
 
 		 666 aa  731    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  53.86 
 
 		 666 aa  731    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  52.88 
 
 		 665 aa  666    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  53.24 
 
 		 662 aa  700    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  56.46 
 
 		 670 aa  722    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  56.46 
 
 		 670 aa  722    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  69.91 
 
 		 670 aa  1010    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  52.18 
 
 		 664 aa  677    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  55.75 
 
 		 666 aa  755    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  53.52 
 
 		 662 aa  684    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  55.2 
 
 		 661 aa  703    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  50.29 
 
 		 681 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  53.67 
 
 		 664 aa  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  53.46 
 
 		 665 aa  680    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  51.56 
 
 		 674 aa  671    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  55.46 
 
 		 666 aa  748    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  52.48 
 
 		 664 aa  678    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  55.46 
 
 		 666 aa  748    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  52.48 
 
 		 664 aa  678    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  55.46 
 
 		 666 aa  746    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  53.16 
 
 		 690 aa  659    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  52.58 
 
 		 668 aa  664    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  52.12 
 
 		 668 aa  659    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  55.02 
 
 		 687 aa  709    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  52.41 
 
 		 665 aa  667    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  50.76 
 
 		 665 aa  636    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  56.36 
 
 		 668 aa  684    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  53.78 
 
 		 690 aa  659    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  66.62 
 
 		 668 aa  962    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  69.31 
 
 		 670 aa  1007    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  53.68 
 
 		 677 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  55.3 
 
 		 661 aa  684    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  76.72 
 
 		 670 aa  1069    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  53.3 
 
 		 690 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  53.94 
 
 		 665 aa  684    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  53.46 
 
 		 681 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  50.45 
 
 		 664 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  53.08 
 
 		 690 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  51.27 
 
 		 684 aa  664    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  72.5 
 
 		 669 aa  1007    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  72.94 
 
 		 669 aa  1033    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  55 
 
 		 664 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0244  transketolase  51.59 
 
 		 662 aa  661    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  51.56 
 
 		 674 aa  671    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  55.46 
 
 		 666 aa  748    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  67.51 
 
 		 668 aa  978    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  100 
 
 		 668 aa  1372    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  54.92 
 
 		 671 aa  686    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  49.13 
 
 		 707 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  55.37 
 
 		 666 aa  696    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  52.72 
 
 		 690 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  54.01 
 
 		 671 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  51.83 
 
 		 655 aa  650    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  54.55 
 
 		 688 aa  745    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  53.71 
 
 		 667 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  76.27 
 
 		 670 aa  1087    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  55.13 
 
 		 663 aa  702    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  68.11 
 
 		 668 aa  983    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  53.02 
 
 		 668 aa  677    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  54.57 
 
 		 662 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  49.05 
 
 		 694 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  52.32 
 
 		 680 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  54.39 
 
 		 664 aa  673    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  53.56 
 
 		 671 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  52.58 
 
 		 663 aa  635    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  53.8 
 
 		 663 aa  688    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  72.46 
 
 		 669 aa  1010    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  51.58 
 
 		 684 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  53.31 
 
 		 659 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  51.35 
 
 		 665 aa  673    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  52.54 
 
 		 697 aa  702    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  56.41 
 
 		 667 aa  715    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  53.16 
 
 		 690 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  53.52 
 
 		 690 aa  658    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  52.99 
 
 		 691 aa  721    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  51.51 
 
 		 666 aa  653    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  53.89 
 
 		 667 aa  673    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  55.26 
 
 		 662 aa  701    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  74.7 
 
 		 672 aa  1030    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  54.87 
 
 		 664 aa  690    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  54.72 
 
 		 664 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  54.52 
 
 		 666 aa  683    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  54.79 
 
 		 665 aa  682    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  53.13 
 
 		 680 aa  667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  51.97 
 
 		 664 aa  636    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  53.37 
 
 		 690 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  54.89 
 
 		 665 aa  680    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  51.29 
 
 		 658 aa  657    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  51.52 
 
 		 658 aa  672    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  53.52 
 
 		 690 aa  658    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  52.99 
 
 		 691 aa  721    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  55.9 
 
 		 655 aa  696    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  54.87 
 
 		 664 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  49.7 
 
 		 692 aa  641    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  50.97 
 
 		 671 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>