More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5573 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  53.28 
 
 		 664 aa  689    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  49.33 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  49.33 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  52.56 
 
 		 670 aa  704    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  55.69 
 
 		 666 aa  751    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  55.69 
 
 		 666 aa  751    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  49.33 
 
 		 663 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  51.45 
 
 		 695 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  49.85 
 
 		 668 aa  696    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  49.48 
 
 		 662 aa  671    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  50.51 
 
 		 670 aa  643    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  50.51 
 
 		 670 aa  643    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  53.18 
 
 		 664 aa  693    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  53.17 
 
 		 666 aa  748    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  49.34 
 
 		 662 aa  677    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  49.48 
 
 		 663 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  49.86 
 
 		 712 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  49.48 
 
 		 663 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  52.11 
 
 		 674 aa  682    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  53.46 
 
 		 666 aa  747    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  52.73 
 
 		 664 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  53.31 
 
 		 666 aa  746    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  53.13 
 
 		 664 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  53.31 
 
 		 666 aa  746    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  56.85 
 
 		 676 aa  778    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  49.85 
 
 		 668 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  50.15 
 
 		 668 aa  693    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  49.48 
 
 		 663 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  49.34 
 
 		 662 aa  677    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  49.33 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  49.63 
 
 		 664 aa  648    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  50.15 
 
 		 707 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  49.49 
 
 		 670 aa  697    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  51.65 
 
 		 691 aa  674    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  49.33 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  52.86 
 
 		 670 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  49.71 
 
 		 741 aa  651    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  53.15 
 
 		 670 aa  678    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  52.81 
 
 		 703 aa  699    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  55.92 
 
 		 664 aa  697    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  55.64 
 
 		 666 aa  751    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  52.62 
 
 		 684 aa  714    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  50.73 
 
 		 669 aa  676    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  50.58 
 
 		 669 aa  682    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  65.07 
 
 		 695 aa  899    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  61.41 
 
 		 674 aa  784    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  49.78 
 
 		 664 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  52.11 
 
 		 674 aa  682    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  53.46 
 
 		 666 aa  747    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  50.15 
 
 		 668 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  52.99 
 
 		 668 aa  707    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4964  transketolase  52.05 
 
 		 691 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.102617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  51.62 
 
 		 707 aa  701    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  49.78 
 
 		 664 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  49.7 
 
 		 665 aa  652    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  49.34 
 
 		 660 aa  652    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  51.32 
 
 		 668 aa  709    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  49.93 
 
 		 670 aa  699    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  54.11 
 
 		 686 aa  689    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  49.63 
 
 		 662 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  54.32 
 
 		 694 aa  722    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  52.05 
 
 		 691 aa  659    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  60.47 
 
 		 678 aa  776    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  49.33 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  51.34 
 
 		 663 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  49.33 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  48.2 
 
 		 680 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  53.17 
 
 		 698 aa  712    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  67.9 
 
 		 711 aa  934    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  54.03 
 
 		 697 aa  737    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  52.84 
 
 		 667 aa  639    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  50.22 
 
 		 669 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  100 
 
 		 691 aa  1394    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  53.9 
 
 		 666 aa  748    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  48.46 
 
 		 662 aa  648    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  52.55 
 
 		 672 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  53.31 
 
 		 666 aa  738    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  49.48 
 
 		 663 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  48.89 
 
 		 663 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  53.31 
 
 		 666 aa  746    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  93.48 
 
 		 691 aa  1263    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  52.88 
 
 		 664 aa  698    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  53.25 
 
 		 694 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  49.56 
 
 		 663 aa  647    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  49.71 
 
 		 668 aa  692    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  51.91 
 
 		 691 aa  657    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  49.11 
 
 		 694 aa  643    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  100 
 
 		 691 aa  1394    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  53.83 
 
 		 655 aa  676    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  49.63 
 
 		 663 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  53.29 
 
 		 692 aa  699    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  49.19 
 
 		 663 aa  650    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  52.42 
 
 		 671 aa  707    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  56.85 
 
 		 676 aa  778    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  57.92 
 
 		 667 aa  770    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  52.42 
 
 		 668 aa  697    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  50.81 
 
 		 669 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  53.47 
 
 		 671 aa  722    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2922  transketolase  48.35 
 
 		 697 aa  649    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.567008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  70.75 
 
 		 688 aa  960    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>