More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2808 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  51.06 
 
 
665 aa  678    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  55.29 
 
 
676 aa  756    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  52.98 
 
 
711 aa  739    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  49.77 
 
 
664 aa  637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  51.21 
 
 
680 aa  712    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  52.4 
 
 
666 aa  703    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  52.4 
 
 
666 aa  703    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  53.45 
 
 
682 aa  742    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  51.59 
 
 
669 aa  685    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  47.73 
 
 
662 aa  641    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  52.18 
 
 
662 aa  714    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5186  transketolase  48.89 
 
 
697 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  51.21 
 
 
680 aa  714    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  49.47 
 
 
664 aa  650    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  51.21 
 
 
666 aa  713    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  56.34 
 
 
667 aa  754    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  50.61 
 
 
660 aa  679    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  59.32 
 
 
694 aa  823    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  53.17 
 
 
668 aa  736    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  49.03 
 
 
674 aa  643    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  51.36 
 
 
666 aa  711    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  49.77 
 
 
664 aa  651    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  51.21 
 
 
666 aa  712    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  49.62 
 
 
664 aa  651    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  51.36 
 
 
666 aa  712    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  50.45 
 
 
668 aa  716    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  49.62 
 
 
664 aa  649    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2922  transketolase  49.12 
 
 
697 aa  643    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.567008  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  51.58 
 
 
671 aa  708    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  50.08 
 
 
664 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  52.04 
 
 
674 aa  713    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  52.36 
 
 
669 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  50.45 
 
 
707 aa  671    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  49.85 
 
 
670 aa  681    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  51.28 
 
 
669 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  51.83 
 
 
688 aa  733    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  52.18 
 
 
668 aa  741    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  51.71 
 
 
670 aa  687    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  53.12 
 
 
691 aa  705    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  53.06 
 
 
711 aa  727    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  53.63 
 
 
668 aa  736    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  52.66 
 
 
664 aa  697    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2874  transketolase  60 
 
 
687 aa  848    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  49.56 
 
 
684 aa  686    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  50.9 
 
 
669 aa  664    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  51.36 
 
 
669 aa  686    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  49.39 
 
 
662 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  55.29 
 
 
676 aa  756    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  51.36 
 
 
666 aa  712    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  49.03 
 
 
674 aa  643    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  51.36 
 
 
666 aa  711    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  50.3 
 
 
668 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  52.54 
 
 
668 aa  692    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  50.82 
 
 
670 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  53.82 
 
 
707 aa  770    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  52.71 
 
 
678 aa  712    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  51.21 
 
 
666 aa  704    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  50.74 
 
 
699 aa  669    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  53.14 
 
 
675 aa  699    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  49.77 
 
 
664 aa  636    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  60.21 
 
 
694 aa  832    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  50.15 
 
 
670 aa  681    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  51.06 
 
 
666 aa  714    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  49.4 
 
 
668 aa  663    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  49.56 
 
 
712 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  51.29 
 
 
663 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  50.08 
 
 
664 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  50.76 
 
 
668 aa  672    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  50.82 
 
 
670 aa  667    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  100 
 
 
697 aa  1435    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  51.56 
 
 
667 aa  664    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  51.21 
 
 
668 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  54.03 
 
 
691 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  57.86 
 
 
686 aa  828    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  58.48 
 
 
703 aa  801    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  53.61 
 
 
672 aa  726    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  51.26 
 
 
672 aa  683    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  50.38 
 
 
664 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  60.62 
 
 
695 aa  847    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4964  transketolase  62.41 
 
 
691 aa  850    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.102617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  50.92 
 
 
663 aa  649    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  49.62 
 
 
664 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  49.13 
 
 
741 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  50 
 
 
665 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  51.67 
 
 
666 aa  717    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  52 
 
 
695 aa  701    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  60.95 
 
 
691 aa  855    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  62.41 
 
 
691 aa  850    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  54.03 
 
 
691 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  49.47 
 
 
664 aa  636    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  61.54 
 
 
691 aa  852    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  52.15 
 
 
692 aa  704    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  51.87 
 
 
668 aa  682    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  50.84 
 
 
671 aa  683    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2541  transketolase  49.11 
 
 
714 aa  639    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  52.69 
 
 
666 aa  698    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  49.62 
 
 
664 aa  655    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  58.72 
 
 
698 aa  831    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  49.39 
 
 
662 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  49.47 
 
 
664 aa  654    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>