More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0912 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  49.34 
 
 		 688 aa  695    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  60.36 
 
 		 668 aa  839    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  53.31 
 
 		 664 aa  704    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  47.6 
 
 		 668 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  51.28 
 
 		 666 aa  658    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  50.98 
 
 		 666 aa  664    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  50.98 
 
 		 666 aa  664    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  52.12 
 
 		 667 aa  703    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1616  transketolase  56.17 
 
 		 662 aa  744    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  50.45 
 
 		 662 aa  677    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  100 
 
 		 662 aa  1363    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  51.58 
 
 		 670 aa  674    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  49.16 
 
 		 653 aa  647    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  48.35 
 
 		 668 aa  646    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  53.46 
 
 		 664 aa  707    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  59.55 
 
 		 666 aa  842    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  59.85 
 
 		 666 aa  836    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  56.69 
 
 		 661 aa  747    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  51.13 
 
 		 666 aa  662    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  52.37 
 
 		 674 aa  694    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  59.85 
 
 		 666 aa  841    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  53.16 
 
 		 664 aa  703    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  59.55 
 
 		 666 aa  839    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  59.55 
 
 		 680 aa  842    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  53.46 
 
 		 664 aa  706    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  59.55 
 
 		 666 aa  840    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  59.55 
 
 		 666 aa  840    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  47.38 
 
 		 671 aa  658    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  49.17 
 
 		 674 aa  665    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  48.65 
 
 		 671 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  48.6 
 
 		 691 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  49.7 
 
 		 670 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  84.29 
 
 		 662 aa  1179    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  48.65 
 
 		 668 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  84.29 
 
 		 662 aa  1179    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  52.62 
 
 		 670 aa  663    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  49.32 
 
 		 665 aa  636    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  58.65 
 
 		 668 aa  823    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  50.3 
 
 		 675 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  51.88 
 
 		 669 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  47.6 
 
 		 684 aa  659    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  49.33 
 
 		 669 aa  654    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  52.18 
 
 		 670 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  49.85 
 
 		 670 aa  668    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  52.37 
 
 		 674 aa  694    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  59.85 
 
 		 666 aa  841    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  48.35 
 
 		 668 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  53.24 
 
 		 668 aa  682    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  58.35 
 
 		 666 aa  833    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  50.6 
 
 		 668 aa  690    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  53.4 
 
 		 682 aa  719    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  51.49 
 
 		 711 aa  701    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  50.61 
 
 		 664 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  51.13 
 
 		 655 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  51.89 
 
 		 681 aa  679    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  49.4 
 
 		 669 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  58.95 
 
 		 666 aa  838    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  56.4 
 
 		 659 aa  771    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  51.66 
 
 		 668 aa  689    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  53.61 
 
 		 664 aa  706    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  51.26 
 
 		 660 aa  666    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  53.92 
 
 		 664 aa  710    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  50.3 
 
 		 711 aa  685    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  49.85 
 
 		 672 aa  652    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  50.53 
 
 		 678 aa  676    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  56.4 
 
 		 659 aa  770    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  50.3 
 
 		 664 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  49.7 
 
 		 695 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  49.85 
 
 		 669 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  47.73 
 
 		 697 aa  641    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  50.68 
 
 		 667 aa  666    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  53.46 
 
 		 664 aa  706    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  49.48 
 
 		 691 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  50.53 
 
 		 668 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  54.75 
 
 		 665 aa  742    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  50.3 
 
 		 672 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  50.76 
 
 		 664 aa  638    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  50.91 
 
 		 664 aa  641    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  59.7 
 
 		 680 aa  840    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  52.18 
 
 		 670 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  55.56 
 
 		 658 aa  748    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1480  transketolase  48.71 
 
 		 679 aa  642    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.7705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  54.56 
 
 		 658 aa  733    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  49.48 
 
 		 691 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  48.95 
 
 		 680 aa  633  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  48.73 
 
 		 694 aa  634  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  48.73 
 
 		 669 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  49.02 
 
 		 663 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  48.43 
 
 		 664 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  49.09 
 
 		 665 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  48.63 
 
 		 723 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  48.78 
 
 		 665 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  50.15 
 
 		 664 aa  625  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  48.64 
 
 		 665 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  47 
 
 		 676 aa  626  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  49.39 
 
 		 663 aa  626  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  48.35 
 
 		 679 aa  625  1e-178  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  47 
 
 		 676 aa  626  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  46.13 
 
 		 666 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  49.17 
 
 		 666 aa  623  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>