More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00940 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00688  transketolase TktA (AFU_orthologue; AFUA_1G13500)  64.86 
 
 		 684 aa  929    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0372185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  51.72 
 
 		 669 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  49.7 
 
 		 668 aa  638    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 687 aa  1420    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  51.56 
 
 		 669 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  50 
 
 		 670 aa  664    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  53.31 
 
 		 670 aa  671    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  50.6 
 
 		 669 aa  645    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  50.75 
 
 		 669 aa  661    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67105  transketolase 1  61.18 
 
 		 677 aa  840    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  49.7 
 
 		 670 aa  660    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  49.24 
 
 		 668 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  55.02 
 
 		 668 aa  693    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  49.18 
 
 		 668 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  54.37 
 
 		 668 aa  677    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  52.73 
 
 		 670 aa  669    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  53.31 
 
 		 670 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  52.85 
 
 		 672 aa  660    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  54.76 
 
 		 669 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  53.31 
 
 		 670 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29260  transketolase  51.4 
 
 		 684 aa  698    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.029788  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  49.4 
 
 		 668 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  49.7 
 
 		 679 aa  630  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  47.4 
 
 		 674 aa  623  1e-177  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  48.27 
 
 		 668 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  47.24 
 
 		 662 aa  611  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  47.24 
 
 		 678 aa  609  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  47.91 
 
 		 653 aa  610  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  46.92 
 
 		 666 aa  609  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  47.17 
 
 		 666 aa  608  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  47.17 
 
 		 666 aa  608  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  47.31 
 
 		 666 aa  608  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  46.62 
 
 		 666 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  46.77 
 
 		 680 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  46.77 
 
 		 666 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  46.62 
 
 		 666 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  46.62 
 
 		 666 aa  598  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  46.77 
 
 		 666 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  47.3 
 
 		 681 aa  600  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  47.74 
 
 		 665 aa  599  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  46.62 
 
 		 666 aa  599  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  46.62 
 
 		 666 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  47.24 
 
 		 666 aa  596  1e-169  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  47.58 
 
 		 671 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  46.47 
 
 		 680 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  47.58 
 
 		 671 aa  598  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  47.75 
 
 		 690 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  44.96 
 
 		 711 aa  592  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2618  transketolase  46.27 
 
 		 666 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  46.84 
 
 		 664 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  47.75 
 
 		 690 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  46.27 
 
 		 666 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  46.27 
 
 		 666 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  47.44 
 
 		 665 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2840  transketolase  46.27 
 
 		 666 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  46.61 
 
 		 665 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  47.6 
 
 		 690 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  47.6 
 
 		 675 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  47.6 
 
 		 690 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01730  conserved hypothetical protein  44.7 
 
 		 725 aa  590  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  47.98 
 
 		 665 aa  590  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  46.03 
 
 		 666 aa  592  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2667  transketolase  46.12 
 
 		 666 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  46.47 
 
 		 666 aa  592  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  47.6 
 
 		 696 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  46.77 
 
 		 668 aa  591  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  46.54 
 
 		 666 aa  591  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  47.6 
 
 		 690 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  46.12 
 
 		 667 aa  588  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  46.12 
 
 		 667 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  46.12 
 
 		 667 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  45.7 
 
 		 671 aa  588  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2748  transketolase  47.68 
 
 		 690 aa  588  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.495668 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  46.59 
 
 		 677 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  46.69 
 
 		 661 aa  588  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  46.46 
 
 		 684 aa  586  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0409  transketolase  46.84 
 
 		 662 aa  587  1e-166  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  45.97 
 
 		 667 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  46.12 
 
 		 667 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  47.38 
 
 		 690 aa  588  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  46.12 
 
 		 667 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  45.97 
 
 		 667 aa  585  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  46.12 
 
 		 667 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  47.46 
 
 		 690 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  47.08 
 
 		 690 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  47.08 
 
 		 665 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  47.08 
 
 		 690 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  46.34 
 
 		 662 aa  583  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  47.08 
 
 		 690 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  47.08 
 
 		 690 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1616  transketolase  44.58 
 
 		 662 aa  579  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  47.23 
 
 		 666 aa  581  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  46.91 
 
 		 675 aa  580  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  45.1 
 
 		 668 aa  579  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  43.58 
 
 		 676 aa  580  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  47 
 
 		 690 aa  579  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  46.04 
 
 		 694 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  46.66 
 
 		 659 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  46.08 
 
 		 680 aa  580  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  47.07 
 
 		 665 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>