More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2903 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2594  transketolase  48.74 
 
 		 667 aa  635    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  48.89 
 
 		 667 aa  637    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  49.93 
 
 		 663 aa  666    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  49.93 
 
 		 663 aa  666    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  48.89 
 
 		 667 aa  637    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  54.72 
 
 		 666 aa  760    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  54.72 
 
 		 666 aa  760    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  48.27 
 
 		 680 aa  659    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  48.89 
 
 		 667 aa  637    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  51.49 
 
 		 662 aa  700    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  51.26 
 
 		 670 aa  657    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  51.26 
 
 		 670 aa  657    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  52.62 
 
 		 669 aa  734    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  51.4 
 
 		 664 aa  696    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  54.49 
 
 		 666 aa  777    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  52.53 
 
 		 695 aa  681    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  52.35 
 
 		 661 aa  679    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  49.93 
 
 		 663 aa  666    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  49.93 
 
 		 663 aa  665    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  50.22 
 
 		 674 aa  686    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  54.79 
 
 		 666 aa  776    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  51.1 
 
 		 664 aa  696    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  54.93 
 
 		 666 aa  777    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  50.96 
 
 		 664 aa  695    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  54.64 
 
 		 666 aa  775    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  59.18 
 
 		 678 aa  777    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  48.08 
 
 		 679 aa  647    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  48.36 
 
 		 741 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  49.85 
 
 		 664 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  49.19 
 
 		 665 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  66.23 
 
 		 691 aa  904    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  50.87 
 
 		 668 aa  717    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  56.62 
 
 		 667 aa  773    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  50.95 
 
 		 707 aa  651    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  51.1 
 
 		 670 aa  720    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3954  transketolase  49.12 
 
 		 664 aa  639    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  54.47 
 
 		 666 aa  758    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  53.29 
 
 		 670 aa  716    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  49.05 
 
 		 664 aa  641    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1034  transketolase  50.74 
 
 		 666 aa  640    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0910  transketolase  50.45 
 
 		 686 aa  638    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  53.83 
 
 		 664 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  51.18 
 
 		 662 aa  705    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  53.23 
 
 		 684 aa  713    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  53.06 
 
 		 669 aa  722    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  52.48 
 
 		 669 aa  719    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  49.85 
 
 		 664 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  52.32 
 
 		 691 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  50.22 
 
 		 674 aa  686    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  54.79 
 
 		 666 aa  776    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  50.73 
 
 		 668 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  54.53 
 
 		 668 aa  739    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  50 
 
 		 671 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  52.75 
 
 		 707 aa  714    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  59.06 
 
 		 674 aa  786    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  51.18 
 
 		 662 aa  705    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  51.97 
 
 		 669 aa  705    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  54.79 
 
 		 666 aa  774    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  51.54 
 
 		 670 aa  723    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  49.19 
 
 		 663 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0788  transketolase  48.96 
 
 		 663 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000527477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  49.93 
 
 		 663 aa  666    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  49.63 
 
 		 662 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  50.5 
 
 		 694 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  49.93 
 
 		 663 aa  666    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  48.89 
 
 		 667 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  49.93 
 
 		 723 aa  643    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  49.04 
 
 		 663 aa  654    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  50.59 
 
 		 663 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3480  transketolase  49.12 
 
 		 664 aa  639    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  48.67 
 
 		 664 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  48.74 
 
 		 667 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  47.26 
 
 		 665 aa  637    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  53.21 
 
 		 697 aa  739    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  53.9 
 
 		 667 aa  686    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2922  transketolase  48.92 
 
 		 697 aa  635    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.567008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  66.28 
 
 		 691 aa  929    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  49.71 
 
 		 664 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  48.89 
 
 		 662 aa  656    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  52.12 
 
 		 672 aa  719    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  48.6 
 
 		 664 aa  636    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  48.6 
 
 		 664 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  64.17 
 
 		 695 aa  903    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  48.89 
 
 		 694 aa  657    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  51.69 
 
 		 691 aa  679    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  53.76 
 
 		 666 aa  769    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  49.78 
 
 		 665 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  51.18 
 
 		 658 aa  656    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  50.15 
 
 		 658 aa  637    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  54.86 
 
 		 686 aa  714    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  66.28 
 
 		 691 aa  929    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  53.08 
 
 		 655 aa  672    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  48.6 
 
 		 664 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  50.87 
 
 		 692 aa  667    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  53.59 
 
 		 671 aa  739    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  53.95 
 
 		 671 aa  728    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  50.58 
 
 		 668 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  50.73 
 
 		 668 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  49.36 
 
 		 712 aa  649    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  53.29 
 
 		 670 aa  740    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>