More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0367 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  51.84 
 
 		 703 aa  678    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  50.15 
 
 		 664 aa  666    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  49.48 
 
 		 691 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  50.6 
 
 		 664 aa  641    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4964  transketolase  49.34 
 
 		 691 aa  643    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.102617 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  53.78 
 
 		 666 aa  746    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  53.78 
 
 		 666 aa  746    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  49.34 
 
 		 691 aa  643    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  53.09 
 
 		 667 aa  702    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  49.09 
 
 		 680 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  47.38 
 
 		 662 aa  658    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  50.22 
 
 		 670 aa  662    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  49.85 
 
 		 670 aa  662    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  50.81 
 
 		 698 aa  680    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  50 
 
 		 664 aa  666    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  54.15 
 
 		 666 aa  764    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  54.15 
 
 		 666 aa  755    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  50.83 
 
 		 661 aa  641    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  53.07 
 
 		 670 aa  704    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  50 
 
 		 664 aa  665    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  49.4 
 
 		 674 aa  657    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  54.3 
 
 		 666 aa  760    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  50.3 
 
 		 664 aa  665    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  54 
 
 		 666 aa  758    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  49.85 
 
 		 664 aa  662    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  54.15 
 
 		 666 aa  759    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  49.7 
 
 		 699 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  49.54 
 
 		 679 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  52.75 
 
 		 695 aa  702    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  49.56 
 
 		 686 aa  674    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  49.41 
 
 		 668 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  49.92 
 
 		 665 aa  652    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  55.81 
 
 		 676 aa  760    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  52.68 
 
 		 678 aa  689    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  48.55 
 
 		 707 aa  643    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  49.92 
 
 		 670 aa  674    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  47.42 
 
 		 662 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  49.78 
 
 		 691 aa  661    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  53.07 
 
 		 670 aa  685    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  50.3 
 
 		 664 aa  669    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  53.78 
 
 		 661 aa  707    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  54.9 
 
 		 672 aa  706    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  51.43 
 
 		 664 aa  668    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  53.59 
 
 		 660 aa  708    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  53.64 
 
 		 684 aa  725    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  53.01 
 
 		 669 aa  679    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  52.71 
 
 		 669 aa  695    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  52.71 
 
 		 674 aa  692    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  56.17 
 
 		 668 aa  727    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  53.58 
 
 		 680 aa  759    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  49.4 
 
 		 674 aa  657    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  54.3 
 
 		 666 aa  760    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  50 
 
 		 668 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  54.14 
 
 		 668 aa  706    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  54.52 
 
 		 711 aa  741    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  48.67 
 
 		 707 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  50.38 
 
 		 670 aa  678    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  51.13 
 
 		 665 aa  670    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  49.09 
 
 		 694 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  50.38 
 
 		 667 aa  639    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  56.14 
 
 		 669 aa  738    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  51.5 
 
 		 669 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  56.34 
 
 		 668 aa  758    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  55.19 
 
 		 668 aa  772    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  48.48 
 
 		 694 aa  664    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1981  transketolase  50.67 
 
 		 664 aa  638    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  54.45 
 
 		 666 aa  765    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  100 
 
 		 671 aa  1392    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  54.15 
 
 		 666 aa  759    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  53.7 
 
 		 662 aa  719    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  51.59 
 
 		 679 aa  654    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  54 
 
 		 666 aa  753    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0224  transketolase  50.37 
 
 		 673 aa  637    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  51.58 
 
 		 697 aa  708    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  51.04 
 
 		 667 aa  681    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  48.83 
 
 		 712 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  53.47 
 
 		 691 aa  722    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  50.15 
 
 		 664 aa  662    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  54.27 
 
 		 670 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  49.62 
 
 		 662 aa  649    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  54.55 
 
 		 672 aa  709    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  53.32 
 
 		 691 aa  705    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  55.81 
 
 		 676 aa  760    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  48.3 
 
 		 694 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  49.63 
 
 		 668 aa  672    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  50.08 
 
 		 669 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  49.56 
 
 		 695 aa  648    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  53.78 
 
 		 666 aa  743    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  53.73 
 
 		 680 aa  760    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  50.38 
 
 		 664 aa  640    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  50.76 
 
 		 660 aa  671    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  53.47 
 
 		 691 aa  722    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  51.81 
 
 		 655 aa  675    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2874  transketolase  49.56 
 
 		 687 aa  648    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  47.8 
 
 		 692 aa  646    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  53.59 
 
 		 711 aa  740    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  53.96 
 
 		 671 aa  713    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  47.42 
 
 		 662 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  55.17 
 
 		 668 aa  743    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  55.98 
 
 		 688 aa  761    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>