More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4614 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00688  transketolase TktA (AFU_orthologue; AFUA_1G13500)  49.63 
 
 		 684 aa  650    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0372185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  56.78 
 
 		 667 aa  747    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  52.27 
 
 		 663 aa  662    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  52.27 
 
 		 663 aa  662    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  50.38 
 
 		 662 aa  695    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  55.46 
 
 		 666 aa  739    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  55.46 
 
 		 666 aa  739    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  50.38 
 
 		 662 aa  695    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11477  transketolase  51.49 
 
 		 700 aa  643    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.1255700000000003e-24  normal  0.494205 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  49.17 
 
 		 662 aa  675    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  52.55 
 
 		 670 aa  672    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  52.55 
 
 		 670 aa  672    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3480  transketolase  51.28 
 
 		 664 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  54.79 
 
 		 664 aa  713    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  55.47 
 
 		 666 aa  758    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  52.27 
 
 		 663 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  54.53 
 
 		 661 aa  690    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  51.89 
 
 		 664 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  50.08 
 
 		 665 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  53.82 
 
 		 674 aa  703    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  55.47 
 
 		 666 aa  757    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  54.95 
 
 		 664 aa  714    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  55.32 
 
 		 666 aa  755    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  54.79 
 
 		 664 aa  713    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  55.47 
 
 		 666 aa  756    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  52.21 
 
 		 690 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3954  transketolase  51.43 
 
 		 664 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  86.33 
 
 		 678 aa  1168    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  51.89 
 
 		 664 aa  662    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  58.33 
 
 		 695 aa  766    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  52.21 
 
 		 690 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  51.52 
 
 		 680 aa  657    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  51.23 
 
 		 741 aa  659    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  52.35 
 
 		 707 aa  684    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  49.93 
 
 		 670 aa  691    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  52.06 
 
 		 696 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  50.45 
 
 		 661 aa  641    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  53.11 
 
 		 670 aa  696    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  52.21 
 
 		 690 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  50 
 
 		 665 aa  636    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  51.52 
 
 		 694 aa  657    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  53.98 
 
 		 664 aa  670    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  51.62 
 
 		 690 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  54.88 
 
 		 684 aa  706    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  53.19 
 
 		 669 aa  694    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  53.64 
 
 		 669 aa  714    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  50.53 
 
 		 664 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  52.47 
 
 		 670 aa  705    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0244  transketolase  49.7 
 
 		 662 aa  640    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  53.82 
 
 		 674 aa  703    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  55.47 
 
 		 666 aa  757    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  49.18 
 
 		 668 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  56.85 
 
 		 668 aa  734    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  54.68 
 
 		 686 aa  712    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  51.01 
 
 		 707 aa  695    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  52.5 
 
 		 690 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  52.65 
 
 		 679 aa  646    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  52.04 
 
 		 664 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  49.33 
 
 		 668 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  51.36 
 
 		 667 aa  645    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  49.63 
 
 		 668 aa  689    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  51.36 
 
 		 663 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  52.63 
 
 		 662 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  51.17 
 
 		 694 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  55.02 
 
 		 680 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  100 
 
 		 674 aa  1359    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  51.37 
 
 		 712 aa  663    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  52.11 
 
 		 663 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  52.21 
 
 		 690 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  50.22 
 
 		 670 aa  692    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  50.15 
 
 		 679 aa  654    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  55.17 
 
 		 666 aa  733    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  52.04 
 
 		 697 aa  721    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  58.43 
 
 		 667 aa  736    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  51.47 
 
 		 690 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  61.71 
 
 		 691 aa  800    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  49.32 
 
 		 666 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  50.53 
 
 		 662 aa  649    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  55.1 
 
 		 672 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  51.42 
 
 		 669 aa  693    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  51.52 
 
 		 664 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2922  transketolase  50.88 
 
 		 697 aa  660    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.567008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  55.93 
 
 		 666 aa  759    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  51.93 
 
 		 669 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  51.18 
 
 		 690 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  50.68 
 
 		 665 aa  636    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  53.66 
 
 		 658 aa  675    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  52.19 
 
 		 658 aa  636    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  52.21 
 
 		 690 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  51.47 
 
 		 690 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  61.71 
 
 		 691 aa  800    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  55.71 
 
 		 655 aa  705    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  51.36 
 
 		 664 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  55.83 
 
 		 692 aa  724    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  60.64 
 
 		 688 aa  801    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  53.26 
 
 		 671 aa  675    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2541  transketolase  51.03 
 
 		 714 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  49.7 
 
 		 668 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  52.21 
 
 		 675 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  51.67 
 
 		 663 aa  650    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>