More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2594 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00688  transketolase TktA (AFU_orthologue; AFUA_1G13500)  50.15 
 
 		 684 aa  660    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0372185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  52.65 
 
 		 671 aa  706    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  52.5 
 
 		 662 aa  722    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  52.94 
 
 		 664 aa  712    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  52.53 
 
 		 669 aa  708    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  53.86 
 
 		 666 aa  724    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  53.86 
 
 		 666 aa  724    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  51.18 
 
 		 703 aa  677    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  53 
 
 		 666 aa  719    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  51.89 
 
 		 662 aa  691    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  50.22 
 
 		 670 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  50.22 
 
 		 670 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  53.09 
 
 		 664 aa  712    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  52.85 
 
 		 666 aa  724    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  52.68 
 
 		 695 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  53.47 
 
 		 661 aa  692    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  55.57 
 
 		 668 aa  760    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  55.02 
 
 		 676 aa  750    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  52.6 
 
 		 674 aa  705    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  52.55 
 
 		 666 aa  719    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  53.39 
 
 		 664 aa  712    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  52.7 
 
 		 666 aa  718    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  53.09 
 
 		 664 aa  709    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  52.7 
 
 		 666 aa  719    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  53.54 
 
 		 698 aa  717    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  48.1 
 
 		 668 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  53.64 
 
 		 670 aa  711    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  53.3 
 
 		 666 aa  731    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  54.28 
 
 		 695 aa  714    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  64.47 
 
 		 678 aa  877    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  53.7 
 
 		 664 aa  719    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  51.64 
 
 		 668 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  49.41 
 
 		 707 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  50.97 
 
 		 670 aa  697    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  50.68 
 
 		 663 aa  639    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  53.94 
 
 		 670 aa  709    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  49.85 
 
 		 694 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  53.09 
 
 		 664 aa  708    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2874  transketolase  52.44 
 
 		 687 aa  686    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  53.47 
 
 		 664 aa  701    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  55.02 
 
 		 676 aa  750    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  54.45 
 
 		 684 aa  715    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  52.83 
 
 		 669 aa  689    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  52.98 
 
 		 669 aa  710    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1616  transketolase  49.16 
 
 		 662 aa  638    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  50.68 
 
 		 665 aa  649    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  57.4 
 
 		 711 aa  752    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  52.6 
 
 		 674 aa  705    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  52.55 
 
 		 666 aa  719    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  52.08 
 
 		 668 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  55.72 
 
 		 668 aa  719    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  51.06 
 
 		 664 aa  642    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  50.58 
 
 		 707 aa  693    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  52.7 
 
 		 666 aa  719    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  52.53 
 
 		 668 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  53.18 
 
 		 662 aa  710    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  52.53 
 
 		 668 aa  709    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  49.7 
 
 		 699 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  53.24 
 
 		 664 aa  711    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  53.79 
 
 		 670 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  53.79 
 
 		 670 aa  692    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  50.89 
 
 		 694 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  55.02 
 
 		 667 aa  721    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  52.7 
 
 		 666 aa  712    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  51.94 
 
 		 691 aa  686    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  54.23 
 
 		 665 aa  723    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  54.97 
 
 		 668 aa  751    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  54.14 
 
 		 666 aa  723    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  51.94 
 
 		 691 aa  687    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  55.82 
 
 		 672 aa  718    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  53.02 
 
 		 697 aa  733    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  56.34 
 
 		 667 aa  716    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4964  transketolase  51.94 
 
 		 691 aa  687    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.102617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  56.73 
 
 		 691 aa  749    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  54.69 
 
 		 668 aa  713    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  51.41 
 
 		 670 aa  699    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  55.17 
 
 		 711 aa  749    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  52.84 
 
 		 680 aa  724    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  53.78 
 
 		 672 aa  717    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  50.76 
 
 		 664 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  50.91 
 
 		 664 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  50.3 
 
 		 680 aa  646    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  49.78 
 
 		 686 aa  668    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  53.18 
 
 		 662 aa  710    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  54.14 
 
 		 668 aa  734    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  54.8 
 
 		 668 aa  744    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  53.48 
 
 		 658 aa  687    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  52.91 
 
 		 691 aa  711    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  50.68 
 
 		 694 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  52.54 
 
 		 680 aa  721    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  56.73 
 
 		 691 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  52.9 
 
 		 669 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  56.17 
 
 		 655 aa  714    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  50.91 
 
 		 664 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  49.19 
 
 		 692 aa  660    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  57.27 
 
 		 688 aa  767    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  53.34 
 
 		 671 aa  715    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  55.52 
 
 		 669 aa  725    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  63.83 
 
 		 674 aa  875    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  56.37 
 
 		 691 aa  721    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>