More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0946 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  52.43 
 
 
664 aa  655    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.582031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  49.92 
 
 
667 aa  648    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  51.37 
 
 
663 aa  673    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  51.37 
 
 
663 aa  673    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  49.92 
 
 
667 aa  648    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  51.13 
 
 
666 aa  705    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  51.13 
 
 
666 aa  705    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3423  transketolase  51.36 
 
 
668 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  51.37 
 
 
665 aa  677    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  54.8 
 
 
688 aa  730    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  54.75 
 
 
662 aa  746    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  50.08 
 
 
670 aa  667    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  50.08 
 
 
670 aa  666    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  50.37 
 
 
696 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  57.14 
 
 
664 aa  763    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  60.73 
 
 
666 aa  832    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  48.49 
 
 
662 aa  648    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  57.74 
 
 
661 aa  759    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  50.45 
 
 
664 aa  659    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  50.61 
 
 
665 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  55.84 
 
 
674 aa  751    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  60.42 
 
 
666 aa  827    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  56.84 
 
 
664 aa  762    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  60.42 
 
 
666 aa  825    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  50.22 
 
 
668 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  56.84 
 
 
664 aa  761    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  60.57 
 
 
666 aa  826    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  50.07 
 
 
690 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  53.14 
 
 
670 aa  701    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  55.1 
 
 
662 aa  727    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  50.91 
 
 
665 aa  666    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  50.07 
 
 
665 aa  666    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  50.08 
 
 
668 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  50.15 
 
 
669 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  49.77 
 
 
657 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  50.6 
 
 
670 aa  698    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  50.07 
 
 
675 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  51.36 
 
 
664 aa  675    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  52.85 
 
 
670 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  50.22 
 
 
690 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  49.85 
 
 
665 aa  636    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  50.3 
 
 
681 aa  656    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  50.46 
 
 
664 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  51.03 
 
 
695 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  51.81 
 
 
684 aa  689    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  52.93 
 
 
669 aa  691    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  51.58 
 
 
669 aa  694    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  49.55 
 
 
680 aa  656    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  51.67 
 
 
664 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  51.22 
 
 
666 aa  668    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  55.84 
 
 
674 aa  751    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  60.42 
 
 
666 aa  827    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  51.51 
 
 
668 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  53.61 
 
 
668 aa  687    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  50.07 
 
 
690 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  51.06 
 
 
665 aa  672    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  50.75 
 
 
670 aa  698    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  49.62 
 
 
664 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  50.22 
 
 
690 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  55.1 
 
 
662 aa  727    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  51.29 
 
 
667 aa  672    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  50.83 
 
 
673 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  50 
 
 
663 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  49.85 
 
 
662 aa  642    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  48.68 
 
 
694 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  50.6 
 
 
668 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  49.7 
 
 
664 aa  656    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  49.55 
 
 
694 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  50 
 
 
663 aa  661    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  50.76 
 
 
663 aa  664    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  50.07 
 
 
665 aa  667    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  50.07 
 
 
690 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  51.05 
 
 
668 aa  692    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  51.98 
 
 
666 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  51.06 
 
 
697 aa  689    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  56.48 
 
 
667 aa  729    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  50.22 
 
 
690 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  51.85 
 
 
691 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  49.4 
 
 
666 aa  654    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  51.66 
 
 
662 aa  682    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  52.1 
 
 
672 aa  670    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  50.91 
 
 
664 aa  671    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  51.06 
 
 
664 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  51.44 
 
 
666 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  51.52 
 
 
665 aa  653    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  49.7 
 
 
680 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  50.6 
 
 
664 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  54.72 
 
 
674 aa  716    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  52.58 
 
 
665 aa  698    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  54.3 
 
 
658 aa  717    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  49.85 
 
 
666 aa  661    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  54.68 
 
 
658 aa  700    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  49.85 
 
 
667 aa  647    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  50.22 
 
 
690 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  51.85 
 
 
691 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  55.41 
 
 
655 aa  726    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  50.76 
 
 
664 aa  668    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  51.73 
 
 
666 aa  702    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  50.9 
 
 
668 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  50.15 
 
 
671 aa  675    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>