More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3411 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0367  transketolase  50 
 
 
671 aa  687    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  51.8 
 
 
668 aa  658    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  49.01 
 
 
664 aa  654    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  96.99 
 
 
664 aa  1302    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2874  transketolase  48.21 
 
 
687 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  51.29 
 
 
666 aa  697    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  51.29 
 
 
666 aa  697    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  54.9 
 
 
662 aa  735    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  49.62 
 
 
676 aa  684    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  53.46 
 
 
662 aa  727    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  48.55 
 
 
670 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  48.55 
 
 
670 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  100 
 
 
664 aa  1366    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  58.62 
 
 
666 aa  815    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  52.73 
 
 
691 aa  690    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  57.42 
 
 
661 aa  749    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  48.41 
 
 
664 aa  638    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  48.04 
 
 
666 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  48.78 
 
 
663 aa  653    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  96.59 
 
 
674 aa  1313    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  59.07 
 
 
666 aa  818    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  98.34 
 
 
664 aa  1348    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  58.77 
 
 
666 aa  816    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  55.32 
 
 
662 aa  731    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  97.74 
 
 
664 aa  1316    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  58.92 
 
 
666 aa  817    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  49.47 
 
 
664 aa  662    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  58.62 
 
 
680 aa  816    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  51.89 
 
 
660 aa  711    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  50.22 
 
 
690 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  56.23 
 
 
678 aa  734    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  48.25 
 
 
664 aa  645    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  48.89 
 
 
695 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  51.65 
 
 
670 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  48.96 
 
 
670 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  50.98 
 
 
668 aa  673    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  47.99 
 
 
668 aa  669    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  51.2 
 
 
670 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  58.92 
 
 
680 aa  818    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  50.45 
 
 
669 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  49.23 
 
 
660 aa  644    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  51.57 
 
 
667 aa  692    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  61.17 
 
 
668 aa  851    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  48.79 
 
 
684 aa  672    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  51.13 
 
 
669 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  50.15 
 
 
669 aa  661    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  49.25 
 
 
670 aa  674    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  48.43 
 
 
680 aa  655    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  96.59 
 
 
674 aa  1313    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  59.07 
 
 
666 aa  818    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  50.68 
 
 
668 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  52.18 
 
 
668 aa  674    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  58.92 
 
 
666 aa  809    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  51.9 
 
 
666 aa  699    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  50.45 
 
 
668 aa  696    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  49.4 
 
 
669 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  50.38 
 
 
668 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  48.07 
 
 
695 aa  635    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  49.63 
 
 
696 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  49.1 
 
 
663 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  52.49 
 
 
688 aa  733    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  48.41 
 
 
664 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  48.43 
 
 
698 aa  651    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  48.01 
 
 
694 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  51.43 
 
 
672 aa  671    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  48.01 
 
 
663 aa  640    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  48.6 
 
 
694 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  49.62 
 
 
676 aa  684    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  47.72 
 
 
723 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  48.49 
 
 
694 aa  651    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  96.84 
 
 
664 aa  1302    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  58.32 
 
 
666 aa  813    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  49.47 
 
 
697 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  53.6 
 
 
667 aa  702    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  48.48 
 
 
665 aa  662    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  53.58 
 
 
691 aa  715    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  58.17 
 
 
666 aa  813    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  49.32 
 
 
662 aa  653    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  51.34 
 
 
672 aa  662    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  58.92 
 
 
666 aa  817    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  98.04 
 
 
664 aa  1342    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  55.32 
 
 
662 aa  731    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  48.78 
 
 
665 aa  668    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  51.43 
 
 
668 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  48.77 
 
 
661 aa  639    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  47.87 
 
 
665 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  54.82 
 
 
658 aa  722    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1480  transketolase  49.47 
 
 
679 aa  654    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.7705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  51.89 
 
 
658 aa  683    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  49.48 
 
 
703 aa  644    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  53.58 
 
 
691 aa  715    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  51.35 
 
 
655 aa  688    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  98.95 
 
 
664 aa  1353    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  49.77 
 
 
692 aa  659    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  47.61 
 
 
671 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  50.98 
 
 
669 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  52.42 
 
 
670 aa  689    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  54.79 
 
 
674 aa  724    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  48.94 
 
 
666 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  48.41 
 
 
664 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>