More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1403 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  60.6 
 
 
666 aa  847    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  59.55 
 
 
666 aa  839    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  60.9 
 
 
666 aa  850    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  52.58 
 
 
667 aa  694    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  49.92 
 
 
653 aa  651    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  48.66 
 
 
695 aa  661    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  50.53 
 
 
666 aa  657    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  50.53 
 
 
666 aa  657    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  47.42 
 
 
671 aa  661    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  51.44 
 
 
675 aa  650    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  84.29 
 
 
662 aa  1179    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  51.18 
 
 
711 aa  705    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  55.32 
 
 
664 aa  710    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  60.9 
 
 
666 aa  851    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  57.42 
 
 
661 aa  738    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  50.75 
 
 
668 aa  672    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  50.98 
 
 
669 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  51.13 
 
 
662 aa  682    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  54.04 
 
 
674 aa  695    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  60.9 
 
 
666 aa  851    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  54.86 
 
 
664 aa  705    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  60.9 
 
 
666 aa  849    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  55.32 
 
 
664 aa  712    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  54.86 
 
 
664 aa  706    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  60.9 
 
 
666 aa  850    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  49.85 
 
 
672 aa  646    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  48.82 
 
 
691 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  55.1 
 
 
665 aa  724    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  61.05 
 
 
680 aa  850    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  100 
 
 
662 aa  1356    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  48.8 
 
 
668 aa  653    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  51.88 
 
 
670 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  49.4 
 
 
670 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  50.38 
 
 
674 aa  686    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3765  transketolase  58.93 
 
 
659 aa  775    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  52.17 
 
 
670 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  55.17 
 
 
664 aa  707    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  55.32 
 
 
664 aa  710    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  50.53 
 
 
666 aa  657    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  61.2 
 
 
666 aa  847    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  49.1 
 
 
684 aa  667    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  48.34 
 
 
669 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  51.28 
 
 
666 aa  660    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  60.45 
 
 
668 aa  842    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  54.04 
 
 
674 aa  695    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  60.9 
 
 
666 aa  851    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  49.4 
 
 
668 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  53.85 
 
 
668 aa  681    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  54.86 
 
 
664 aa  703    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  59.4 
 
 
668 aa  829    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  49.55 
 
 
670 aa  660    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  51.88 
 
 
670 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  49.49 
 
 
688 aa  696    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  53.18 
 
 
681 aa  699    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  60.9 
 
 
680 aa  853    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  48.2 
 
 
668 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  50.15 
 
 
669 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  49.25 
 
 
668 aa  653    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  51.35 
 
 
660 aa  659    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  51.13 
 
 
678 aa  683    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  49.39 
 
 
697 aa  650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  51.98 
 
 
667 aa  659    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  49.34 
 
 
691 aa  677    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  50.23 
 
 
668 aa  682    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  52.95 
 
 
682 aa  703    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  100 
 
 
662 aa  1356    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  50.15 
 
 
711 aa  686    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1616  transketolase  55.66 
 
 
662 aa  742    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0712144  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  54.95 
 
 
658 aa  728    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1480  transketolase  48.28 
 
 
679 aa  639    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.7705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  55.35 
 
 
658 aa  732    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  49.34 
 
 
691 aa  677    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  51.43 
 
 
655 aa  642    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  52.18 
 
 
670 aa  679    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1547  transketolase  58.93 
 
 
659 aa  776    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.45317  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  50 
 
 
671 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  50.15 
 
 
672 aa  634  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  50.53 
 
 
668 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  47.76 
 
 
698 aa  628  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  48.34 
 
 
669 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  48.8 
 
 
664 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  48.28 
 
 
664 aa  627  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  47 
 
 
669 aa  624  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  48.72 
 
 
664 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  50.46 
 
 
655 aa  623  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  48.64 
 
 
664 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  48.64 
 
 
664 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  47.45 
 
 
670 aa  621  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  47.45 
 
 
670 aa  621  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  48.48 
 
 
665 aa  621  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  47.56 
 
 
703 aa  618  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  47.75 
 
 
679 aa  616  1e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  47.24 
 
 
662 aa  613  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  46.77 
 
 
680 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  46.71 
 
 
694 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  47.82 
 
 
663 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0224  transketolase  47.97 
 
 
673 aa  614  9.999999999999999e-175  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  47.82 
 
 
665 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  47.65 
 
 
663 aa  613  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  47.38 
 
 
664 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>