More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0970 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  50.29 
 
 		 680 aa  716    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  56.61 
 
 		 672 aa  714    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  51.77 
 
 		 666 aa  701    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  51.77 
 
 		 666 aa  701    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  53.82 
 
 		 669 aa  697    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  58.36 
 
 		 678 aa  745    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  49.7 
 
 		 662 aa  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  49.19 
 
 		 662 aa  653    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  50.44 
 
 		 666 aa  713    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  50.88 
 
 		 666 aa  719    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  50.29 
 
 		 666 aa  706    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  50.59 
 
 		 666 aa  711    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  49.55 
 
 		 664 aa  638    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  50.29 
 
 		 666 aa  709    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  49.4 
 
 		 664 aa  637    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  50.44 
 
 		 666 aa  711    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  100 
 
 		 695 aa  1416    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  64.99 
 
 		 711 aa  888    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  64.49 
 
 		 688 aa  873    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  54.34 
 
 		 667 aa  722    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  50 
 
 		 669 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  51.65 
 
 		 686 aa  655    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  48.03 
 
 		 670 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3879  transketolase  51.98 
 
 		 675 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  52.14 
 
 		 670 aa  676    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  50.59 
 
 		 666 aa  706    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  51.1 
 
 		 670 aa  684    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  52.47 
 
 		 664 aa  643    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  64.17 
 
 		 711 aa  904    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  51.04 
 
 		 684 aa  658    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  49.34 
 
 		 669 aa  651    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  50.66 
 
 		 669 aa  667    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  49.85 
 
 		 664 aa  644    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  48.82 
 
 		 668 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  50.59 
 
 		 666 aa  711    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  49.26 
 
 		 668 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  52.73 
 
 		 668 aa  685    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  50.95 
 
 		 707 aa  675    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  54.28 
 
 		 668 aa  762    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  50.44 
 
 		 666 aa  711    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  48.47 
 
 		 670 aa  672    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  51.03 
 
 		 665 aa  654    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  48.97 
 
 		 668 aa  657    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  52.72 
 
 		 668 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  53.24 
 
 		 676 aa  704    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  48.66 
 
 		 662 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  49.36 
 
 		 694 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  51.99 
 
 		 670 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  52.95 
 
 		 666 aa  700    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  49.49 
 
 		 669 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  50.22 
 
 		 698 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  52 
 
 		 697 aa  701    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  51.1 
 
 		 667 aa  637    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  51.91 
 
 		 666 aa  703    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  65.07 
 
 		 691 aa  899    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0870  transketolase  51.99 
 
 		 670 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  53.89 
 
 		 672 aa  688    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  58.13 
 
 		 682 aa  768    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  53.24 
 
 		 676 aa  704    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  58.33 
 
 		 674 aa  753    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  50.37 
 
 		 668 aa  687    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  50.15 
 
 		 680 aa  711    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2122  transketolase  54.42 
 
 		 668 aa  754    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  50.29 
 
 		 668 aa  674    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  48.66 
 
 		 662 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  49.55 
 
 		 664 aa  636    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  65.07 
 
 		 691 aa  899    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  54.28 
 
 		 681 aa  703    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  51.32 
 
 		 671 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  64.78 
 
 		 691 aa  872    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  49.57 
 
 		 703 aa  647    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  52.75 
 
 		 671 aa  702    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  48.75 
 
 		 668 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  48.89 
 
 		 664 aa  634  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  49.4 
 
 		 664 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  50.36 
 
 		 653 aa  634  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  49.26 
 
 		 664 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  48.68 
 
 		 674 aa  628  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  49.33 
 
 		 663 aa  625  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  48.68 
 
 		 674 aa  628  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  49.48 
 
 		 663 aa  627  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  49.33 
 
 		 663 aa  625  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  49.33 
 
 		 663 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  49.33 
 
 		 663 aa  624  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2023  transketolase  52.42 
 
 		 655 aa  622  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.98963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  49.33 
 
 		 663 aa  624  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  49.19 
 
 		 663 aa  624  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  49.33 
 
 		 663 aa  624  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  48.45 
 
 		 694 aa  625  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  50.82 
 
 		 663 aa  624  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  50.74 
 
 		 663 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  49.33 
 
 		 663 aa  624  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  50.74 
 
 		 665 aa  623  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  49.26 
 
 		 692 aa  622  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  49.93 
 
 		 666 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  49.26 
 
 		 664 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2840  transketolase  49.93 
 
 		 666 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  49.26 
 
 		 664 aa  620  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  49.04 
 
 		 663 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2667  transketolase  49.93 
 
 		 666 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>