More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1522 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1843  transketolase  100 
 
 		 676 aa  1396    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  49.85 
 
 		 667 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2874  transketolase  50.74 
 
 		 687 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  49.32 
 
 		 664 aa  664    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.862582 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  49.85 
 
 		 667 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  52.78 
 
 		 666 aa  711    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  52.78 
 
 		 666 aa  711    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3316  transketolase  49.27 
 
 		 712 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210127 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  49.92 
 
 		 664 aa  665    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  50.22 
 
 		 670 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  50.22 
 
 		 670 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  50.98 
 
 		 680 aa  713    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  49.62 
 
 		 664 aa  664    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  51.13 
 
 		 666 aa  713    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  50.3 
 
 		 661 aa  643    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  51.43 
 
 		 666 aa  716    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1241  transketolase  56.24 
 
 		 668 aa  764    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000546415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  49.04 
 
 		 674 aa  657    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  51.28 
 
 		 666 aa  711    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  49.92 
 
 		 664 aa  666    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  50.98 
 
 		 666 aa  708    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  49.92 
 
 		 664 aa  669    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  51.13 
 
 		 666 aa  710    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4964  transketolase  51.04 
 
 		 691 aa  653    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.102617 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2743  transketolase  49.85 
 
 		 667 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  59.85 
 
 		 678 aa  786    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  52.18 
 
 		 666 aa  699    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4511  transketolase  54.05 
 
 		 669 aa  718    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.545809  normal  0.774153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  50.38 
 
 		 664 aa  677    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  50.68 
 
 		 666 aa  705    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2305  transketolase  51.75 
 
 		 691 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2002  transketolase  49.71 
 
 		 707 aa  650    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.90383  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  49.7 
 
 		 670 aa  677    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  49.85 
 
 		 667 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  55.56 
 
 		 672 aa  704    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  53.21 
 
 		 670 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3089  transketolase  49.27 
 
 		 741 aa  646    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.37552 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  49.18 
 
 		 669 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  53.95 
 
 		 698 aa  721    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  54.09 
 
 		 664 aa  686    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  48.21 
 
 		 668 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  53.16 
 
 		 684 aa  690    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  49.93 
 
 		 669 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  50.82 
 
 		 669 aa  677    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  50 
 
 		 670 aa  677    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  58.41 
 
 		 674 aa  773    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4501  transketolase  51.04 
 
 		 691 aa  653    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.58871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  49.04 
 
 		 674 aa  657    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  51.28 
 
 		 666 aa  711    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  48.81 
 
 		 668 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  54.65 
 
 		 668 aa  712    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  51.13 
 
 		 666 aa  710    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0468  transketolase  51.52 
 
 		 707 aa  690    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2618  transketolase  50.23 
 
 		 666 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  54.12 
 
 		 688 aa  744    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  49.55 
 
 		 668 aa  689    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  49.92 
 
 		 662 aa  680    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  49.85 
 
 		 667 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  49.1 
 
 		 668 aa  672    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  50.3 
 
 		 663 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  50.83 
 
 		 666 aa  697    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  49.1 
 
 		 668 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2707  transketolase  50.23 
 
 		 666 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  52.27 
 
 		 694 aa  689    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  53.31 
 
 		 667 aa  717    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  55.81 
 
 		 671 aa  760    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  49.48 
 
 		 669 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  100 
 
 		 676 aa  1396    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  54.69 
 
 		 711 aa  744    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  55.38 
 
 		 686 aa  721    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  53.6 
 
 		 668 aa  698    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2667  transketolase  50.23 
 
 		 666 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  56.16 
 
 		 691 aa  749    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  55.29 
 
 		 697 aa  756    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  55.64 
 
 		 667 aa  698    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  49.1 
 
 		 679 aa  642    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  56.85 
 
 		 691 aa  778    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2840  transketolase  50.23 
 
 		 666 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  50.93 
 
 		 703 aa  676    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  52.83 
 
 		 672 aa  681    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  51.13 
 
 		 680 aa  712    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  47.22 
 
 		 660 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  51.54 
 
 		 694 aa  677    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2733  transketolase  50.23 
 
 		 666 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  54.11 
 
 		 670 aa  715    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  49.92 
 
 		 664 aa  668    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  52.06 
 
 		 695 aa  661    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  53.24 
 
 		 695 aa  704    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  52.17 
 
 		 668 aa  724    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  56.85 
 
 		 691 aa  778    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  50.75 
 
 		 655 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5017  transketolase  50.89 
 
 		 691 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  53.2 
 
 		 692 aa  703    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  49.85 
 
 		 671 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  53.36 
 
 		 670 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2922  transketolase  48.4 
 
 		 697 aa  640    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.567008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>