More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_3165 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5299  transketolase  48.45 
 
 
694 aa  646    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  48.18 
 
 
663 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  48.18 
 
 
663 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1698  transketolase  52.29 
 
 
691 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  49.4 
 
 
670 aa  673    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  51.75 
 
 
666 aa  701    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  51.75 
 
 
666 aa  701    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  56.23 
 
 
678 aa  731    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3742  transketolase  58.92 
 
 
666 aa  819    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000620958  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  53.16 
 
 
662 aa  724    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  48.55 
 
 
670 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  48.55 
 
 
670 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  98.34 
 
 
664 aa  1348    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  58.62 
 
 
666 aa  815    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  50.98 
 
 
669 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  57.27 
 
 
661 aa  749    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1843  transketolase  49.92 
 
 
676 aa  686    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  51.59 
 
 
666 aa  699    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1522  transketolase  49.92 
 
 
676 aa  686    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.566213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  97.92 
 
 
674 aa  1328    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  59.07 
 
 
666 aa  820    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  100 
 
 
664 aa  1365    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  58.77 
 
 
666 aa  818    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  48.41 
 
 
664 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  98.8 
 
 
664 aa  1350    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  58.92 
 
 
666 aa  819    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3699  transketolase  58.92 
 
 
680 aa  819    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000172901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  47.59 
 
 
663 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  58.32 
 
 
666 aa  815    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1844  transketolase  96.39 
 
 
664 aa  1294    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.862582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  54.95 
 
 
674 aa  726    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  48.18 
 
 
663 aa  639    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  48.18 
 
 
663 aa  639    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  47.59 
 
 
663 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  49.1 
 
 
670 aa  671    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  50.53 
 
 
668 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3738  transketolase  48.51 
 
 
695 aa  636    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  51.05 
 
 
670 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4065  transketolase  51.65 
 
 
668 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  48.86 
 
 
663 aa  656    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  54.86 
 
 
662 aa  726    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  48.29 
 
 
668 aa  668    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  48.18 
 
 
663 aa  639    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  48.79 
 
 
684 aa  672    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  51.28 
 
 
669 aa  659    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  50.3 
 
 
669 aa  660    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  49.55 
 
 
669 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  52.02 
 
 
667 aa  696    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  97.92 
 
 
674 aa  1328    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  59.07 
 
 
666 aa  820    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  50.83 
 
 
668 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  52.48 
 
 
668 aa  675    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3401  transketolase  99.25 
 
 
664 aa  1354    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  54.86 
 
 
662 aa  726    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  49.33 
 
 
695 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3388  transketolase  96.84 
 
 
664 aa  1301    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170816  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  48.62 
 
 
663 aa  645    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  52.04 
 
 
660 aa  711    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  52.57 
 
 
670 aa  689    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3790  transketolase  58.92 
 
 
666 aa  810    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258353  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  48.88 
 
 
680 aa  659    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  48.25 
 
 
664 aa  648    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  47.86 
 
 
694 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  48.41 
 
 
664 aa  649    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  48.34 
 
 
666 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  48.18 
 
 
663 aa  639    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  48.1 
 
 
663 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  48.87 
 
 
694 aa  655    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  51.58 
 
 
668 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  51.13 
 
 
668 aa  673    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0843  transketolase  51.95 
 
 
670 aa  656    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  49.77 
 
 
697 aa  672    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  53.75 
 
 
667 aa  704    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  47.59 
 
 
663 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  53.13 
 
 
691 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  50.15 
 
 
671 aa  687    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  49.32 
 
 
662 aa  651    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  51.34 
 
 
672 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  50.52 
 
 
690 aa  636    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0460  transketolase  48.73 
 
 
698 aa  653    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.857831  normal  0.375749 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  48.78 
 
 
665 aa  663    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  51.56 
 
 
711 aa  708    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2348  transketolase  49.93 
 
 
703 aa  644    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0773739  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1524  transketolase  58.62 
 
 
680 aa  818    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000346626  normal  0.0243149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  48.48 
 
 
665 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  54.97 
 
 
658 aa  721    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1480  transketolase  49.47 
 
 
679 aa  657    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.7705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  51.74 
 
 
658 aa  681    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  48.18 
 
 
663 aa  639    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  53.13 
 
 
691 aa  709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  51.5 
 
 
655 aa  688    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  50.6 
 
 
668 aa  696    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  49.85 
 
 
692 aa  660    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  52.2 
 
 
688 aa  728    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  47.46 
 
 
671 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  58.47 
 
 
666 aa  815    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  48.18 
 
 
663 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3413  transketolase  99.4 
 
 
664 aa  1359    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  49.24 
 
 
666 aa  656    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  48.33 
 
 
723 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>