More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2283 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  51.8 
 
 		 690 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  50.76 
 
 		 665 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  50.99 
 
 		 663 aa  662    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  50.99 
 
 		 663 aa  662    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3954  transketolase  50.15 
 
 		 664 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  54.48 
 
 		 666 aa  722    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  54.48 
 
 		 666 aa  722    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  49.18 
 
 		 668 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  50.76 
 
 		 665 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  50.68 
 
 		 662 aa  679    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  51.83 
 
 		 670 aa  658    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  51.83 
 
 		 670 aa  658    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  51.14 
 
 		 663 aa  663    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  51.45 
 
 		 664 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  53.6 
 
 		 664 aa  689    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  55.62 
 
 		 666 aa  757    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  53.56 
 
 		 666 aa  714    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  54.61 
 
 		 661 aa  700    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2025  transketolase  51.76 
 
 		 686 aa  654    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.410571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  50.76 
 
 		 665 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  52.96 
 
 		 674 aa  682    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  55.47 
 
 		 666 aa  754    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  53.75 
 
 		 664 aa  691    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  55.62 
 
 		 666 aa  755    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  50.52 
 
 		 668 aa  669    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  53.61 
 
 		 664 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  55.62 
 
 		 666 aa  754    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  51.8 
 
 		 690 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  51.13 
 
 		 668 aa  656    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  50.38 
 
 		 668 aa  649    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  50.15 
 
 		 665 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  49.92 
 
 		 665 aa  641    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3480  transketolase  50 
 
 		 664 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  49.85 
 
 		 666 aa  648    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  49.63 
 
 		 670 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  49.03 
 
 		 670 aa  658    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  49.77 
 
 		 663 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  50.15 
 
 		 661 aa  640    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  52.63 
 
 		 670 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  51.8 
 
 		 690 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  52.05 
 
 		 664 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  50.91 
 
 		 681 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  51.8 
 
 		 690 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  51.8 
 
 		 690 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  50.82 
 
 		 684 aa  648    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  50.6 
 
 		 669 aa  644    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  50.91 
 
 		 669 aa  651    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  51.5 
 
 		 664 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  51.04 
 
 		 671 aa  693    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  52.96 
 
 		 674 aa  682    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  55.47 
 
 		 666 aa  754    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  50.22 
 
 		 668 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  56.41 
 
 		 668 aa  706    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  53.95 
 
 		 723 aa  682    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0874  transketolase  50.53 
 
 		 663 aa  640    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000542021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  51.98 
 
 		 662 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  51.14 
 
 		 664 aa  640    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  51.73 
 
 		 670 aa  687    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3540  transketolase  51.45 
 
 		 664 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0018246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  51.8 
 
 		 675 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  59.34 
 
 		 678 aa  734    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  50.52 
 
 		 668 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  52.65 
 
 		 663 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  51.65 
 
 		 696 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  53.62 
 
 		 688 aa  684    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  52.34 
 
 		 662 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1309  transketolase  50.81 
 
 		 694 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  0.106663 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  50.81 
 
 		 680 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  58.43 
 
 		 674 aa  735    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  50.99 
 
 		 663 aa  662    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  51.8 
 
 		 690 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  50.99 
 
 		 663 aa  646    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  49.47 
 
 		 665 aa  636    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0788  transketolase  51.29 
 
 		 663 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000527477  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  51.9 
 
 		 666 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  51.1 
 
 		 695 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  51.56 
 
 		 697 aa  673    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  100 
 
 		 667 aa  1363    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  51.64 
 
 		 690 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  52.84 
 
 		 691 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  49.7 
 
 		 666 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  50.08 
 
 		 662 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  52.77 
 
 		 672 aa  662    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  51.29 
 
 		 664 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  51.29 
 
 		 664 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  50.91 
 
 		 666 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  51.3 
 
 		 665 aa  647    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  51.52 
 
 		 664 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  51.75 
 
 		 666 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  51.34 
 
 		 690 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  54.1 
 
 		 665 aa  686    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  52.34 
 
 		 658 aa  675    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  50.3 
 
 		 669 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  51.67 
 
 		 658 aa  649    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  52.74 
 
 		 664 aa  664    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  51.64 
 
 		 690 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  52.84 
 
 		 691 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  52.19 
 
 		 655 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  51.45 
 
 		 664 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  51.98 
 
 		 662 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>