More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0278 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0752  transketolase  52.37 
 
 		 664 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  54.53 
 
 		 674 aa  697    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  51.52 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  51.52 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  51.67 
 
 		 663 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  57.42 
 
 		 662 aa  752    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  49.7 
 
 		 666 aa  645    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  49.7 
 
 		 666 aa  645    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  49.77 
 
 		 665 aa  635    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  54.24 
 
 		 666 aa  665    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  56.69 
 
 		 662 aa  760    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  50.53 
 
 		 670 aa  668    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  50.53 
 
 		 670 aa  667    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  51.82 
 
 		 663 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3659  transketolase  52.48 
 
 		 664 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.119403 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  57.42 
 
 		 664 aa  740    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  60.94 
 
 		 666 aa  829    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  50 
 
 		 662 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  100 
 
 		 661 aa  1358    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  50.51 
 
 		 688 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  51.88 
 
 		 664 aa  651    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  49.32 
 
 		 665 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  56.27 
 
 		 674 aa  730    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  60.78 
 
 		 666 aa  825    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  57.27 
 
 		 664 aa  742    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  60.63 
 
 		 666 aa  823    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  50.91 
 
 		 666 aa  657    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  57.42 
 
 		 664 aa  739    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  60.94 
 
 		 666 aa  827    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0014  transketolase  51.5 
 
 		 660 aa  671    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  51.67 
 
 		 663 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  52.96 
 
 		 668 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  53.31 
 
 		 667 aa  693    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  50.08 
 
 		 665 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0876  transketolase  51.59 
 
 		 663 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  50.98 
 
 		 663 aa  655    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1379  transketolase  52.5 
 
 		 711 aa  696    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  51.52 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  51.2 
 
 		 670 aa  677    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  51.67 
 
 		 663 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  51.06 
 
 		 664 aa  652    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  54.72 
 
 		 670 aa  690    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3540  transketolase  52.63 
 
 		 664 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0018246  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  51.21 
 
 		 664 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  48.44 
 
 		 668 aa  653    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0874  transketolase  50.61 
 
 		 663 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000542021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  60.94 
 
 		 666 aa  832    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  49.33 
 
 		 684 aa  650    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  52.39 
 
 		 669 aa  671    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  52.61 
 
 		 669 aa  686    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  52.81 
 
 		 675 aa  636    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3369  transketolase  60.63 
 
 		 666 aa  824    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00015872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  56.27 
 
 		 674 aa  730    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  60.78 
 
 		 666 aa  825    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  51.2 
 
 		 668 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  55.2 
 
 		 668 aa  696    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17351  transketolase  52.19 
 
 		 669 aa  693    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.625161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  53.89 
 
 		 670 aa  708    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  52.42 
 
 		 667 aa  638    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  51.36 
 
 		 666 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0788  transketolase  52.04 
 
 		 663 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000527477  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  50.6 
 
 		 668 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4319  transketolase  52.78 
 
 		 666 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.658339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  51.52 
 
 		 667 aa  657    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  51.36 
 
 		 663 aa  648    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  51.57 
 
 		 669 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  51.65 
 
 		 670 aa  683    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  52.64 
 
 		 680 aa  669    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  52.64 
 
 		 694 aa  667    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  51.06 
 
 		 663 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  50.53 
 
 		 664 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  51.73 
 
 		 664 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  51.21 
 
 		 664 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  52.05 
 
 		 663 aa  652    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  51.52 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  51.68 
 
 		 668 aa  635    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  51.2 
 
 		 668 aa  681    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  51.52 
 
 		 663 aa  650    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  57.42 
 
 		 662 aa  752    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  54.61 
 
 		 667 aa  698    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  52.63 
 
 		 664 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  50.45 
 
 		 723 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  50.52 
 
 		 691 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  50.91 
 
 		 666 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  51.5 
 
 		 668 aa  686    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  53.24 
 
 		 662 aa  678    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  53.88 
 
 		 672 aa  687    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  52.63 
 
 		 664 aa  664    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  52.48 
 
 		 664 aa  663    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  52.38 
 
 		 668 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  51.36 
 
 		 663 aa  649    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  50.83 
 
 		 680 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0367  transketolase  50.83 
 
 		 671 aa  657    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  50.45 
 
 		 665 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  73.9 
 
 		 658 aa  1016    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1480  transketolase  50.84 
 
 		 679 aa  669    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.7705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  56.88 
 
 		 658 aa  742    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0416  transketolase  55.81 
 
 		 678 aa  712    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.985586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  50.52 
 
 		 691 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  50.98 
 
 		 655 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>