More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3341 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  74.89 
 
 
667 aa  1066    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  94.87 
 
 
663 aa  1318    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  94.87 
 
 
663 aa  1318    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  74.89 
 
 
667 aa  1066    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  52.05 
 
 
666 aa  695    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  52.05 
 
 
666 aa  695    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  71.99 
 
 
665 aa  1019    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  71.26 
 
 
667 aa  1005    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  69.1 
 
 
670 aa  983    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  69.25 
 
 
670 aa  984    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  63.04 
 
 
690 aa  859    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  63.99 
 
 
675 aa  865    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  57.25 
 
 
681 aa  795    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  49.85 
 
 
666 aa  659    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  70.59 
 
 
662 aa  993    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  63.04 
 
 
675 aa  859    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  50.45 
 
 
663 aa  638    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  72.25 
 
 
664 aa  1027    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  72.89 
 
 
665 aa  1029    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  73.19 
 
 
666 aa  1016    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  50.15 
 
 
666 aa  660    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  58.2 
 
 
692 aa  799    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  50 
 
 
666 aa  659    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0192  transketolase  56.81 
 
 
693 aa  784    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  50 
 
 
666 aa  659    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  63.04 
 
 
690 aa  859    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  58.9 
 
 
668 aa  828    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  58.6 
 
 
668 aa  824    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  71.23 
 
 
665 aa  1007    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  68.23 
 
 
665 aa  954    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  66.11 
 
 
668 aa  906    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  58.56 
 
 
690 aa  815    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  50.53 
 
 
670 aa  682    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  65.16 
 
 
677 aa  901    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  60.87 
 
 
680 aa  816    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  67.12 
 
 
661 aa  931    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  52.95 
 
 
669 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  53.19 
 
 
670 aa  675    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  63.19 
 
 
690 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  68.22 
 
 
665 aa  959    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  72.74 
 
 
681 aa  1030    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  62.89 
 
 
690 aa  851    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3959  transketolase  58.72 
 
 
678 aa  780    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  52.04 
 
 
669 aa  678    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  52.19 
 
 
669 aa  689    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  64.76 
 
 
664 aa  874    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0244  transketolase  65.96 
 
 
662 aa  920    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  63.4 
 
 
664 aa  856    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  50.15 
 
 
666 aa  660    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  50.76 
 
 
668 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  54.92 
 
 
668 aa  686    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  66.06 
 
 
671 aa  916    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  51.21 
 
 
668 aa  685    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  58.03 
 
 
682 aa  773    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  63.64 
 
 
690 aa  834    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  51.51 
 
 
671 aa  650    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  50.68 
 
 
670 aa  682    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  52.36 
 
 
655 aa  660    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  73.45 
 
 
664 aa  1047    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  76.59 
 
 
663 aa  1062    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4112  transketolase  57.33 
 
 
693 aa  771    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  71.88 
 
 
667 aa  1000    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  50.45 
 
 
673 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  62.59 
 
 
668 aa  870    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  65.86 
 
 
663 aa  914    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4349  transketolase  54.99 
 
 
693 aa  762    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  58.79 
 
 
674 aa  792    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  64.76 
 
 
662 aa  867    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  60.3 
 
 
680 aa  829    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  73.6 
 
 
664 aa  1033    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  51.81 
 
 
671 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4585  transketolase  58.86 
 
 
695 aa  800    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  64.76 
 
 
663 aa  890    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  68.83 
 
 
663 aa  970    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  63.04 
 
 
696 aa  859    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  67.62 
 
 
665 aa  945    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  58.12 
 
 
684 aa  802    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  64.3 
 
 
659 aa  879    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  71.04 
 
 
665 aa  1032    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  63.04 
 
 
690 aa  859    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  49.77 
 
 
667 aa  636    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  63.19 
 
 
690 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  63.34 
 
 
690 aa  858    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  48.89 
 
 
691 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  49.78 
 
 
688 aa  658    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  70.18 
 
 
666 aa  991    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  73.76 
 
 
664 aa  1028    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  74.92 
 
 
662 aa  1065    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  52.23 
 
 
672 aa  660    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  73.76 
 
 
664 aa  1051    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  73.45 
 
 
664 aa  1047    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  64.47 
 
 
666 aa  900    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  65.17 
 
 
665 aa  907    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  74.21 
 
 
680 aa  1038    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  50.98 
 
 
668 aa  688    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  62.59 
 
 
690 aa  852    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  71.99 
 
 
665 aa  1023    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1984  transketolase  61.29 
 
 
693 aa  804    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  52.62 
 
 
670 aa  672    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  63.34 
 
 
690 aa  858    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>