More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0538 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  60.06 
 
 		 667 aa  808    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  62.59 
 
 		 663 aa  861    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  62.59 
 
 		 663 aa  861    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  60.06 
 
 		 667 aa  808    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  50.45 
 
 		 666 aa  644    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  50.45 
 
 		 666 aa  644    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  62.8 
 
 		 665 aa  852    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  92.61 
 
 		 690 aa  1327    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  65.92 
 
 		 670 aa  897    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  65.92 
 
 		 670 aa  897    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  49.28 
 
 		 690 aa  653    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  71.41 
 
 		 675 aa  943    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  66.47 
 
 		 680 aa  892    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  49.48 
 
 		 666 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  59.76 
 
 		 662 aa  819    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  51.72 
 
 		 663 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  62.15 
 
 		 664 aa  849    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  63.4 
 
 		 665 aa  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0192  transketolase  62.37 
 
 		 693 aa  833    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  49.33 
 
 		 666 aa  637    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  92.44 
 
 		 675 aa  1293    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  49.18 
 
 		 666 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  62.59 
 
 		 663 aa  852    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  49.18 
 
 		 666 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  92.46 
 
 		 690 aa  1324    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  57.21 
 
 		 668 aa  768    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  56.31 
 
 		 668 aa  760    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  61.38 
 
 		 667 aa  822    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  63.25 
 
 		 665 aa  865    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  57.95 
 
 		 665 aa  786    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  64.01 
 
 		 668 aa  854    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  59.25 
 
 		 690 aa  786    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  48.81 
 
 		 670 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  70.13 
 
 		 677 aa  956    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  62.59 
 
 		 664 aa  853    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  67.41 
 
 		 661 aa  928    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  62.54 
 
 		 694 aa  881    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  64.66 
 
 		 666 aa  855    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  92.61 
 
 		 690 aa  1327    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  62.72 
 
 		 665 aa  856    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  63.1 
 
 		 681 aa  847    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  63.31 
 
 		 663 aa  854    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  98.55 
 
 		 690 aa  1401    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  97.25 
 
 		 690 aa  1387    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  62.39 
 
 		 680 aa  881    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  50.81 
 
 		 669 aa  640    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  59.17 
 
 		 664 aa  787    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0244  transketolase  60.6 
 
 		 662 aa  828    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  92.46 
 
 		 690 aa  1324    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  49.33 
 
 		 666 aa  637    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  60.21 
 
 		 662 aa  822    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  53.37 
 
 		 668 aa  649    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  66.02 
 
 		 671 aa  900    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  62.76 
 
 		 666 aa  845    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2405  transketolase  58 
 
 		 682 aa  743    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  91.88 
 
 		 690 aa  1264    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  53.37 
 
 		 671 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  63.49 
 
 		 664 aa  867    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  54.02 
 
 		 655 aa  668    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  57.08 
 
 		 668 aa  747    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3959  transketolase  66.77 
 
 		 678 aa  877    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4112  transketolase  63.91 
 
 		 693 aa  833    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  63.27 
 
 		 667 aa  851    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  52.54 
 
 		 673 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  49.33 
 
 		 670 aa  642    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  65.67 
 
 		 663 aa  900    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4349  transketolase  60.41 
 
 		 693 aa  818    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  64.94 
 
 		 674 aa  861    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  84.92 
 
 		 662 aa  1158    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  68.62 
 
 		 680 aa  947    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  61.85 
 
 		 664 aa  843    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  53.37 
 
 		 671 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  59.76 
 
 		 664 aa  780    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0353  transketolase  59.58 
 
 		 663 aa  762    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  61.92 
 
 		 663 aa  825    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  67.82 
 
 		 657 aa  935    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  57.21 
 
 		 665 aa  776    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  62.31 
 
 		 684 aa  837    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  70.87 
 
 		 659 aa  954    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  55.82 
 
 		 665 aa  785    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1984  transketolase  64.19 
 
 		 693 aa  824    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  51.34 
 
 		 667 aa  641    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  62.35 
 
 		 664 aa  861    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  98.55 
 
 		 690 aa  1401    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  62.59 
 
 		 664 aa  859    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4056  transketolase  63.44 
 
 		 681 aa  860    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  62.39 
 
 		 666 aa  858    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  92.46 
 
 		 690 aa  1324    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  63.06 
 
 		 662 aa  870    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  61.62 
 
 		 692 aa  823    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  62.74 
 
 		 664 aa  862    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  62.59 
 
 		 664 aa  860    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  60.3 
 
 		 666 aa  796    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  60.54 
 
 		 665 aa  800    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  61.52 
 
 		 680 aa  842    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  92.46 
 
 		 696 aa  1325    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  100 
 
 		 690 aa  1419    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  63.7 
 
 		 665 aa  872    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4585  transketolase  65.64 
 
 		 695 aa  870    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  49.25 
 
 		 658 aa  639    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>