More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0387 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  48.12 
 
 
690 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  52.23 
 
 
657 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  48.84 
 
 
690 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  51.33 
 
 
684 aa  709    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  100 
 
 
690 aa  1447    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2748  transketolase  48.77 
 
 
690 aa  648    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.495668 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  48.12 
 
 
696 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  48.1 
 
 
663 aa  656    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  49.42 
 
 
665 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  52.68 
 
 
663 aa  721    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  52.34 
 
 
651 aa  682    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  47.69 
 
 
657 aa  642    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3391  transketolase  49.64 
 
 
699 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0869549  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  50.07 
 
 
670 aa  662    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  48.12 
 
 
690 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  48.48 
 
 
655 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  48.12 
 
 
690 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  48.39 
 
 
668 aa  643    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  47.95 
 
 
668 aa  636    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  52.53 
 
 
657 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  51.01 
 
 
681 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  52.78 
 
 
658 aa  694    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  48.78 
 
 
661 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  58.43 
 
 
661 aa  817    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  50.51 
 
 
661 aa  676    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  48.12 
 
 
690 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  48.27 
 
 
690 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  49.85 
 
 
667 aa  656    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  50.57 
 
 
666 aa  706    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  49.05 
 
 
695 aa  667    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  50.81 
 
 
660 aa  652    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  50.52 
 
 
671 aa  673    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  49.71 
 
 
662 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  48.33 
 
 
655 aa  655    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  49.33 
 
 
653 aa  654    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  58.72 
 
 
663 aa  832    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  47.48 
 
 
666 aa  637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  48.69 
 
 
657 aa  642    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  51.17 
 
 
673 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  49.64 
 
 
686 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  48.34 
 
 
723 aa  652    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  49.35 
 
 
662 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  49.34 
 
 
671 aa  678    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  49.04 
 
 
671 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  49.12 
 
 
662 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  48.12 
 
 
690 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  50.29 
 
 
678 aa  665    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  51.24 
 
 
666 aa  686    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  48.55 
 
 
690 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  52.53 
 
 
738 aa  719    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  54.18 
 
 
663 aa  736    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  47.54 
 
 
660 aa  639    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  48.55 
 
 
690 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  51.01 
 
 
681 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  52.23 
 
 
686 aa  700    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  50.07 
 
 
661 aa  649    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  48.82 
 
 
671 aa  673    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  48.12 
 
 
675 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  48.54 
 
 
660 aa  640    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  49.28 
 
 
690 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  48.48 
 
 
665 aa  654    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  51.01 
 
 
681 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  48.55 
 
 
690 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  47.25 
 
 
665 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2599  transketolase  48.27 
 
 
672 aa  635  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286494 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  48.61 
 
 
668 aa  632  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  48.12 
 
 
670 aa  631  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  48.12 
 
 
670 aa  631  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  47.68 
 
 
665 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  48.1 
 
 
664 aa  630  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  47.82 
 
 
666 aa  630  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  47.46 
 
 
665 aa  630  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  47.36 
 
 
694 aa  625  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0220  transketolase  47.19 
 
 
681 aa  627  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  47.57 
 
 
680 aa  626  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  47.1 
 
 
665 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  46.96 
 
 
665 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  47.51 
 
 
661 aa  622  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0501  transketolase  48.12 
 
 
665 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  46.99 
 
 
666 aa  623  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  47.1 
 
 
665 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  47.76 
 
 
664 aa  619  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  47.68 
 
 
681 aa  618  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5014  transketolase  46.96 
 
 
665 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16096 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  47.38 
 
 
666 aa  620  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  47.83 
 
 
690 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  45.91 
 
 
671 aa  621  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  47.61 
 
 
665 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  47.51 
 
 
672 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  46.87 
 
 
666 aa  615  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  46.87 
 
 
666 aa  615  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  46.89 
 
 
666 aa  616  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  46.1 
 
 
665 aa  616  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  46.98 
 
 
663 aa  615  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4827  transketolase  46.96 
 
 
674 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.827436  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  45.45 
 
 
660 aa  616  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  48.24 
 
 
663 aa  616  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  47.25 
 
 
664 aa  617  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  47.51 
 
 
682 aa  615  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  46.16 
 
 
663 aa  618  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>