More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1738 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1193  transketolase  56.86 
 
 		 667 aa  728    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  58.84 
 
 		 657 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  55.03 
 
 		 651 aa  701    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  53.65 
 
 		 681 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  47.69 
 
 		 690 aa  642    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  53.51 
 
 		 666 aa  716    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  56.04 
 
 		 684 aa  739    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  56.68 
 
 		 657 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  57.93 
 
 		 663 aa  763    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  58.99 
 
 		 671 aa  756    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  56.43 
 
 		 653 aa  700    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  59.88 
 
 		 657 aa  696    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  71.65 
 
 		 672 aa  981    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  48.32 
 
 		 661 aa  639    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  54.64 
 
 		 661 aa  703    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  71.49 
 
 		 672 aa  978    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  60.18 
 
 		 657 aa  699    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  58.6 
 
 		 695 aa  763    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  57.1 
 
 		 658 aa  715    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  56.08 
 
 		 661 aa  717    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  57.06 
 
 		 655 aa  725    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  57.16 
 
 		 670 aa  707    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  58.36 
 
 		 660 aa  715    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  100 
 
 		 657 aa  1346    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  50.91 
 
 		 660 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  54.13 
 
 		 671 aa  687    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  55.97 
 
 		 662 aa  693    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  55.95 
 
 		 655 aa  710    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  49.24 
 
 		 663 aa  659    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  77.44 
 
 		 671 aa  1065    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  55.56 
 
 		 661 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  56.09 
 
 		 673 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  56.08 
 
 		 686 aa  708    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  53.67 
 
 		 671 aa  689    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  55.81 
 
 		 662 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  71.19 
 
 		 672 aa  978    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  55.75 
 
 		 657 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  56.55 
 
 		 678 aa  712    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  58.08 
 
 		 738 aa  763    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  66.25 
 
 		 672 aa  858    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  56.75 
 
 		 665 aa  731    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  73.82 
 
 		 673 aa  998    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  55.9 
 
 		 660 aa  687    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  57.16 
 
 		 668 aa  718    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  53.04 
 
 		 681 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  55.59 
 
 		 686 aa  709    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  56.55 
 
 		 663 aa  701    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  54.26 
 
 		 666 aa  688    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  59.32 
 
 		 663 aa  766    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  54.12 
 
 		 660 aa  688    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  53.42 
 
 		 677 aa  681    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  53.19 
 
 		 681 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  54.43 
 
 		 671 aa  695    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  49.62 
 
 		 668 aa  622  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  49.54 
 
 		 692 aa  622  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6143  transketolase  51.37 
 
 		 682 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  51.05 
 
 		 665 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  49.78 
 
 		 666 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  49.77 
 
 		 663 aa  615  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  49.85 
 
 		 653 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  49.01 
 
 		 668 aa  612  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  49.85 
 
 		 677 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  50.53 
 
 		 671 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  49.55 
 
 		 663 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  50.75 
 
 		 665 aa  612  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  51.11 
 
 		 680 aa  610  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2740  transketolase  50.46 
 
 		 659 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  48.57 
 
 		 723 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  49.4 
 
 		 666 aa  610  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  51.14 
 
 		 666 aa  610  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  48.57 
 
 		 665 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  50.07 
 
 		 663 aa  608  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1497  transketolase  51.42 
 
 		 675 aa  610  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  50.07 
 
 		 663 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  50.07 
 
 		 663 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  49.55 
 
 		 671 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  48.57 
 
 		 665 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  48.72 
 
 		 665 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  49.32 
 
 		 665 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  49.33 
 
 		 694 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  49.63 
 
 		 671 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  50.07 
 
 		 663 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  50.07 
 
 		 663 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  49.93 
 
 		 663 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  49.93 
 
 		 663 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  50.07 
 
 		 663 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  49.47 
 
 		 666 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  48.96 
 
 		 665 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3391  transketolase  49.85 
 
 		 699 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0869549  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  51.05 
 
 		 668 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  49.93 
 
 		 663 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  49.55 
 
 		 661 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  49.85 
 
 		 690 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  48.36 
 
 		 681 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  49.93 
 
 		 663 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  48.27 
 
 		 657 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  49.85 
 
 		 662 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  49.32 
 
 		 665 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  49.48 
 
 		 659 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  49.33 
 
 		 680 aa  605  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>