More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1015 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  51.51 
 
 		 663 aa  643    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  51.51 
 
 		 663 aa  643    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  52.18 
 
 		 694 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0510  transketolase  52.27 
 
 		 664 aa  649    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  51.51 
 
 		 663 aa  643    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  48.78 
 
 		 690 aa  665    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  56.08 
 
 		 657 aa  717    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  50.08 
 
 		 657 aa  643    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  51.51 
 
 		 663 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  56.8 
 
 		 668 aa  725    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  62.9 
 
 		 663 aa  847    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  62.94 
 
 		 651 aa  785    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  50.83 
 
 		 665 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  50.97 
 
 		 663 aa  645    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  60.37 
 
 		 658 aa  779    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  59.54 
 
 		 667 aa  749    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  50.99 
 
 		 665 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  55.26 
 
 		 655 aa  705    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  51.51 
 
 		 663 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  56.35 
 
 		 653 aa  706    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  58.41 
 
 		 657 aa  696    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  51.36 
 
 		 663 aa  642    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  50.91 
 
 		 661 aa  661    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  52.94 
 
 		 664 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  76.06 
 
 		 661 aa  1031    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  64.12 
 
 		 684 aa  844    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  51.65 
 
 		 663 aa  650    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  51.51 
 
 		 663 aa  643    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  55.54 
 
 		 672 aa  710    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  58.41 
 
 		 657 aa  697    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  55.59 
 
 		 672 aa  706    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  51.36 
 
 		 663 aa  642    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  62.27 
 
 		 663 aa  813    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  51.51 
 
 		 663 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  51.66 
 
 		 663 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  56.95 
 
 		 666 aa  722    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  63.05 
 
 		 738 aa  846    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  51.51 
 
 		 663 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  52.02 
 
 		 680 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  61.12 
 
 		 657 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  52.64 
 
 		 664 aa  659    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  57.38 
 
 		 660 aa  709    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  55.54 
 
 		 672 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  59.03 
 
 		 666 aa  817    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  60.3 
 
 		 671 aa  776    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  87.1 
 
 		 662 aa  1153    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  54.97 
 
 		 655 aa  694    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  50.3 
 
 		 663 aa  679    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  56.24 
 
 		 671 aa  723    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  56.63 
 
 		 677 aa  729    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  51.81 
 
 		 665 aa  648    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  61.25 
 
 		 673 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  83.33 
 
 		 686 aa  1123    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  58.38 
 
 		 671 aa  751    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  58.1 
 
 		 657 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  68.23 
 
 		 661 aa  895    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  52.43 
 
 		 663 aa  655    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  52.68 
 
 		 653 aa  645    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  51.51 
 
 		 663 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  53.02 
 
 		 695 aa  694    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  58.79 
 
 		 671 aa  757    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  86.65 
 
 		 662 aa  1126    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  58.78 
 
 		 670 aa  738    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  66.67 
 
 		 665 aa  901    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  76.97 
 
 		 678 aa  1014    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  61.95 
 
 		 663 aa  820    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  51.36 
 
 		 663 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  53.87 
 
 		 672 aa  703    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  51.51 
 
 		 663 aa  643    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  53.61 
 
 		 673 aa  699    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  54.89 
 
 		 660 aa  692    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  55.73 
 
 		 681 aa  690    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  61.74 
 
 		 657 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  60.91 
 
 		 686 aa  803    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  100 
 
 		 661 aa  1347    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  55.57 
 
 		 681 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  52.94 
 
 		 664 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  56.69 
 
 		 660 aa  734    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  59.55 
 
 		 671 aa  760    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  55.73 
 
 		 681 aa  691    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  51.44 
 
 		 667 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  51.44 
 
 		 667 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  50.91 
 
 		 664 aa  632  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02318  hypothetical protein  51.44 
 
 		 667 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  52.78 
 
 		 671 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  50.15 
 
 		 666 aa  634  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  49.92 
 
 		 723 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  51.21 
 
 		 662 aa  634  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  51.44 
 
 		 667 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3686  transketolase  51.44 
 
 		 667 aa  631  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  51.06 
 
 		 664 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  52.63 
 
 		 671 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  51.44 
 
 		 667 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  50.9 
 
 		 663 aa  632  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  50.98 
 
 		 668 aa  631  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  50.45 
 
 		 675 aa  630  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  51.22 
 
 		 666 aa  629  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  51.29 
 
 		 665 aa  631  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  50.98 
 
 		 664 aa  628  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  49.77 
 
 		 665 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>