More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1320 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  54.65 
 
 		 672 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  50.91 
 
 		 663 aa  649    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002468  transketolase  52.05 
 
 		 664 aa  635    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.624335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0745  transketolase  52.17 
 
 		 664 aa  645    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  59.24 
 
 		 657 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  55.71 
 
 		 666 aa  692    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  57.85 
 
 		 671 aa  713    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  52.06 
 
 		 665 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3703  transketolase  52.25 
 
 		 664 aa  642    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0981  transketolase  51.88 
 
 		 664 aa  643    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  47.54 
 
 		 690 aa  639    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  52.21 
 
 		 665 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  51.68 
 
 		 663 aa  636    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  53.14 
 
 		 661 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  51.65 
 
 		 664 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  54.27 
 
 		 668 aa  656    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  58.07 
 
 		 663 aa  745    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  52.13 
 
 		 680 aa  640    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  52.21 
 
 		 665 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  52.04 
 
 		 694 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  51.98 
 
 		 666 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  56.49 
 
 		 677 aa  715    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  51.44 
 
 		 667 aa  640    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  55.78 
 
 		 670 aa  675    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  52.07 
 
 		 663 aa  648    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  50.6 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  52.06 
 
 		 665 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  51.76 
 
 		 665 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  54.89 
 
 		 661 aa  692    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5014  transketolase  52.37 
 
 		 665 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  53.86 
 
 		 695 aa  696    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  58.16 
 
 		 668 aa  691    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  55.74 
 
 		 658 aa  717    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  52.45 
 
 		 663 aa  650    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  50.31 
 
 		 661 aa  662    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  51.89 
 
 		 661 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  54.21 
 
 		 661 aa  694    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  50.52 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  50.97 
 
 		 663 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  51.67 
 
 		 681 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  54.8 
 
 		 672 aa  686    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  59.91 
 
 		 657 aa  688    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  53.06 
 
 		 665 aa  671    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  53.59 
 
 		 666 aa  709    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  58.07 
 
 		 738 aa  744    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  52.14 
 
 		 668 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  57.01 
 
 		 663 aa  734    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  61.05 
 
 		 671 aa  775    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  53.24 
 
 		 681 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  71.93 
 
 		 655 aa  976    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  55.78 
 
 		 657 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  57.41 
 
 		 660 aa  681    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3900  transketolase  51.88 
 
 		 664 aa  642    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  50.97 
 
 		 663 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  58.51 
 
 		 671 aa  716    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  54.21 
 
 		 662 aa  680    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  70.94 
 
 		 655 aa  940    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  49.92 
 
 		 663 aa  669    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  53.51 
 
 		 671 aa  669    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  51.65 
 
 		 664 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4237  transketolase  50.6 
 
 		 663 aa  635    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  55.62 
 
 		 673 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  53.82 
 
 		 686 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  50 
 
 		 663 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  57.65 
 
 		 667 aa  706    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3418  transketolase  51.12 
 
 		 663 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0637477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  50.97 
 
 		 663 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  58.65 
 
 		 684 aa  758    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  57.89 
 
 		 671 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  54.52 
 
 		 662 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  52.36 
 
 		 666 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  52.58 
 
 		 663 aa  656    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  53.91 
 
 		 678 aa  679    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  55.52 
 
 		 651 aa  699    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  59.88 
 
 		 657 aa  688    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  51.53 
 
 		 666 aa  660    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  54.8 
 
 		 672 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  57.56 
 
 		 672 aa  714    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  53.35 
 
 		 673 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  100 
 
 		 660 aa  1348    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  56.24 
 
 		 657 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  53.55 
 
 		 681 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  50.76 
 
 		 666 aa  640    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  55.96 
 
 		 686 aa  696    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  51.14 
 
 		 662 aa  643    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  54.55 
 
 		 653 aa  689    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  55.9 
 
 		 657 aa  687    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  57.82 
 
 		 663 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  51.91 
 
 		 723 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  51.52 
 
 		 675 aa  635    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  51.65 
 
 		 664 aa  647    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  57.23 
 
 		 660 aa  723    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  51.91 
 
 		 665 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  52.29 
 
 		 665 aa  663    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  51.3 
 
 		 665 aa  640    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  53.55 
 
 		 681 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  50.6 
 
 		 663 aa  635  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02728  hypothetical protein  50.6 
 
 		 663 aa  635  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0501  transketolase  52.52 
 
 		 665 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  50.6 
 
 		 663 aa  635  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>