More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3440 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  50 
 
 		 663 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  50.38 
 
 		 663 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  50.38 
 
 		 663 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  50.38 
 
 		 663 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06257  transketolase  51.75 
 
 		 668 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  55.18 
 
 		 657 aa  733    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  50.53 
 
 		 663 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  50.91 
 
 		 665 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  72.66 
 
 		 651 aa  931    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  58.73 
 
 		 657 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  56.79 
 
 		 653 aa  729    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  644    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  51.9 
 
 		 690 aa  722    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2750  transketolase  52.4 
 
 		 675 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  55.52 
 
 		 672 aa  726    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  50.82 
 
 		 664 aa  660    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4585  transketolase  51.32 
 
 		 695 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  76.97 
 
 		 663 aa  1051    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  51.42 
 
 		 675 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  51.43 
 
 		 665 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  60.55 
 
 		 657 aa  762    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  58.16 
 
 		 681 aa  762    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  50.14 
 
 		 696 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  52.29 
 
 		 657 aa  659    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  51.42 
 
 		 690 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  57.7 
 
 		 681 aa  752    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  51.34 
 
 		 690 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  51.73 
 
 		 665 aa  663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  63.58 
 
 		 663 aa  822    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3626  transketolase  50.83 
 
 		 690 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.560894  normal  0.611761 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  51.12 
 
 		 664 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2841  transketolase  51.13 
 
 		 677 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  53.22 
 
 		 661 aa  704    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  50.15 
 
 		 661 aa  635    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  62.17 
 
 		 661 aa  822    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  51.43 
 
 		 666 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  51.27 
 
 		 690 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  50.68 
 
 		 665 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03567  transketolase  50.74 
 
 		 675 aa  638    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  55.52 
 
 		 672 aa  728    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  60.7 
 
 		 657 aa  766    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  76.19 
 
 		 738 aa  1051    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  51.19 
 
 		 690 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  60.09 
 
 		 670 aa  780    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  51.42 
 
 		 690 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  51.14 
 
 		 666 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  50.92 
 
 		 692 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  51.27 
 
 		 690 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  50.15 
 
 		 694 aa  653    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  50.45 
 
 		 680 aa  653    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  50.38 
 
 		 663 aa  642    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  60.09 
 
 		 660 aa  760    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  51.42 
 
 		 690 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0220  transketolase  51.17 
 
 		 681 aa  643    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  60.06 
 
 		 671 aa  798    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  60.76 
 
 		 662 aa  812    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  56.81 
 
 		 655 aa  746    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  53.22 
 
 		 663 aa  721    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  56.36 
 
 		 671 aa  756    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  56.32 
 
 		 666 aa  749    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  50 
 
 		 667 aa  641    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  59.91 
 
 		 673 aa  806    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  59.76 
 
 		 686 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  48.79 
 
 		 663 aa  637    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  74.69 
 
 		 663 aa  1019    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  57.66 
 
 		 677 aa  743    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  51.12 
 
 		 664 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  52.04 
 
 		 680 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  60.44 
 
 		 671 aa  795    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  59.85 
 
 		 671 aa  793    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  60.76 
 
 		 662 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  55.67 
 
 		 672 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5014  transketolase  50.15 
 
 		 665 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  60.74 
 
 		 678 aa  797    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  66.31 
 
 		 684 aa  905    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  51.99 
 
 		 684 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2980  transketolase  51.96 
 
 		 659 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  62.27 
 
 		 661 aa  804    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  60.4 
 
 		 668 aa  776    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  60.46 
 
 		 695 aa  785    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  54.01 
 
 		 673 aa  706    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  55.96 
 
 		 660 aa  716    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  51.34 
 
 		 690 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  58.92 
 
 		 672 aa  749    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  58.01 
 
 		 681 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  49.48 
 
 		 666 aa  638    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  100 
 
 		 686 aa  1413    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  50.91 
 
 		 662 aa  645    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  51.06 
 
 		 663 aa  648    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  51.26 
 
 		 723 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  58.41 
 
 		 655 aa  766    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  53.58 
 
 		 666 aa  665    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  53.72 
 
 		 665 aa  671    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  50.91 
 
 		 665 aa  648    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  56.22 
 
 		 660 aa  722    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  51.04 
 
 		 690 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  51.82 
 
 		 665 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  67.88 
 
 		 666 aa  957    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  51.34 
 
 		 690 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  50.15 
 
 		 667 aa  645    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>