More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0465 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2601  transketolase  50.08 
 
 
655 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  50.77 
 
 
666 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  52.97 
 
 
667 aa  689    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  58.72 
 
 
690 aa  832    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  53.51 
 
 
684 aa  722    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  53.92 
 
 
657 aa  679    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  49.16 
 
 
663 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  54.91 
 
 
663 aa  723    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  52.84 
 
 
658 aa  687    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  50.45 
 
 
668 aa  658    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  50.45 
 
 
668 aa  659    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  53.2 
 
 
653 aa  704    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  49.62 
 
 
668 aa  646    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  53.99 
 
 
657 aa  709    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  82.81 
 
 
661 aa  1144    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  49.7 
 
 
661 aa  671    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  53.61 
 
 
651 aa  687    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  54.75 
 
 
738 aa  721    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  49.24 
 
 
657 aa  659    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  51.78 
 
 
671 aa  682    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  51.78 
 
 
660 aa  669    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  51.6 
 
 
671 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  49.84 
 
 
662 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  49.85 
 
 
655 aa  671    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  100 
 
 
663 aa  1375    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  49.54 
 
 
671 aa  650    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  50.39 
 
 
681 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  51.86 
 
 
673 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  50.15 
 
 
686 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  50.3 
 
 
661 aa  679    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  52.32 
 
 
671 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  49.84 
 
 
662 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  50.38 
 
 
678 aa  665    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  52.94 
 
 
671 aa  726    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  47.1 
 
 
677 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  51.91 
 
 
695 aa  688    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  49.92 
 
 
660 aa  669    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  50.7 
 
 
681 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  53.37 
 
 
665 aa  702    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  53.59 
 
 
686 aa  697    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  55.47 
 
 
663 aa  725    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  52.07 
 
 
670 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  50.77 
 
 
660 aa  685    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  50.15 
 
 
661 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  53.03 
 
 
666 aa  701    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  50.7 
 
 
681 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  47.73 
 
 
672 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  49.39 
 
 
657 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  47.58 
 
 
672 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  47.43 
 
 
672 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  49.08 
 
 
657 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  48.53 
 
 
672 aa  625  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  47.8 
 
 
657 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  48.2 
 
 
673 aa  621  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  47.59 
 
 
665 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  48.17 
 
 
665 aa  615  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  45.57 
 
 
692 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1883  transketolase  51.28 
 
 
672 aa  613  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.768149  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  47.63 
 
 
668 aa  614  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  48.17 
 
 
666 aa  614  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  48.26 
 
 
665 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  47.31 
 
 
665 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  47.09 
 
 
665 aa  609  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  48.04 
 
 
682 aa  610  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  48.04 
 
 
662 aa  612  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  47.36 
 
 
666 aa  608  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  47.47 
 
 
665 aa  602  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  47.3 
 
 
665 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2790  transketolase  48.69 
 
 
692 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  46.72 
 
 
665 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  47.03 
 
 
666 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  47.46 
 
 
690 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  47.23 
 
 
690 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  47.23 
 
 
690 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  47.31 
 
 
690 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  47.23 
 
 
690 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  45.36 
 
 
660 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  48.26 
 
 
665 aa  600  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  48.26 
 
 
663 aa  600  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  47.3 
 
 
665 aa  602  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  46.19 
 
 
661 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  46.93 
 
 
696 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  46.49 
 
 
663 aa  601  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  47.24 
 
 
653 aa  599  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  46.72 
 
 
665 aa  601  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2748  transketolase  46.91 
 
 
690 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.495668 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  47.63 
 
 
667 aa  595  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  46.93 
 
 
690 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  46.93 
 
 
690 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  46.93 
 
 
690 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  46.93 
 
 
690 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  46.93 
 
 
690 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  46.43 
 
 
681 aa  595  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  46.93 
 
 
690 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1212  transketolase  47.63 
 
 
667 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2611  transketolase  47.63 
 
 
667 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1195  transketolase  47.73 
 
 
690 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2599  transketolase  47.21 
 
 
672 aa  598  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5014  transketolase  47 
 
 
665 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.16096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  46.67 
 
 
665 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>