More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4915 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2108  transketolase  58.41 
 
 		 684 aa  764    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  56.02 
 
 		 657 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  49.34 
 
 		 690 aa  658    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  54.89 
 
 		 661 aa  687    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  58.94 
 
 		 663 aa  739    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  55.57 
 
 		 666 aa  729    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  58 
 
 		 663 aa  738    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  100 
 
 		 653 aa  1335    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  57.36 
 
 		 658 aa  723    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  55.33 
 
 		 665 aa  700    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  55.19 
 
 		 677 aa  711    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  56.73 
 
 		 661 aa  717    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  52.7 
 
 		 661 aa  680    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  57.01 
 
 		 661 aa  724    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  61.48 
 
 		 667 aa  744    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  58.71 
 
 		 663 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  55.1 
 
 		 672 aa  679    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  56.79 
 
 		 657 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  56.74 
 
 		 668 aa  692    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  58.49 
 
 		 651 aa  716    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  58.19 
 
 		 670 aa  721    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  51.61 
 
 		 692 aa  653    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  57.67 
 
 		 671 aa  728    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  57.77 
 
 		 666 aa  712    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  58.26 
 
 		 660 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  58.72 
 
 		 671 aa  738    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  54.49 
 
 		 662 aa  679    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  56.79 
 
 		 655 aa  731    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  53.1 
 
 		 663 aa  708    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  55.45 
 
 		 671 aa  702    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  59.17 
 
 		 673 aa  747    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  54.59 
 
 		 686 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1669  transketolase  58 
 
 		 738 aa  737    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  54.85 
 
 		 655 aa  713    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  58.56 
 
 		 671 aa  740    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  55.11 
 
 		 662 aa  679    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  54.79 
 
 		 672 aa  678    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  57.08 
 
 		 678 aa  706    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  54.7 
 
 		 681 aa  687    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  55.1 
 
 		 672 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  56.48 
 
 		 657 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  53.68 
 
 		 673 aa  659    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  54.52 
 
 		 660 aa  694    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  54.7 
 
 		 681 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  56.9 
 
 		 695 aa  710    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  56.79 
 
 		 686 aa  709    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  56.68 
 
 		 657 aa  708    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  56.99 
 
 		 657 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  55.67 
 
 		 660 aa  703    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  56.37 
 
 		 657 aa  724    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  58.26 
 
 		 671 aa  738    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  54.7 
 
 		 681 aa  689    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  54.33 
 
 		 672 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  51.13 
 
 		 665 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  50.83 
 
 		 665 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  50.68 
 
 		 665 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  49.92 
 
 		 660 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  50.15 
 
 		 665 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1617  transketolase  49.77 
 
 		 665 aa  610  1e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.804069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  49.85 
 
 		 723 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5014  transketolase  50 
 
 		 665 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  49.85 
 
 		 666 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  49.17 
 
 		 665 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0154  transketolase  49.62 
 
 		 668 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  49.17 
 
 		 665 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6143  transketolase  49.54 
 
 		 682 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1849  transketolase  49.32 
 
 		 665 aa  608  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.322822 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1538  transketolase  49.17 
 
 		 666 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0168278  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0139  transketolase  49.47 
 
 		 668 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05570  transketolase  49.85 
 
 		 665 aa  605  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  49.7 
 
 		 663 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2579  transketolase  51.21 
 
 		 671 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  51.21 
 
 		 661 aa  601  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  50.08 
 
 		 664 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  49.85 
 
 		 663 aa  598  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3252  transketolase  50.46 
 
 		 663 aa  595  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  50.23 
 
 		 664 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  50.15 
 
 		 668 aa  597  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2989  transketolase  50.91 
 
 		 671 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  49.85 
 
 		 666 aa  595  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2853  transketolase  50.38 
 
 		 665 aa  598  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  50.08 
 
 		 664 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  49.32 
 
 		 663 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  49.32 
 
 		 663 aa  593  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3093  transketolase  49.32 
 
 		 663 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3238  transketolase  49.03 
 
 		 663 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3367  transketolase  49.32 
 
 		 663 aa  594  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3322  transketolase  49.03 
 
 		 663 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3313  transketolase  49.18 
 
 		 663 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3269  transketolase  49.17 
 
 		 663 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5267  transketolase  49.17 
 
 		 681 aa  595  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02341  transketolase  48.64 
 
 		 666 aa  594  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.904862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3228  transketolase  49.47 
 
 		 665 aa  593  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3077  transketolase  49.32 
 
 		 663 aa  594  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  49.77 
 
 		 663 aa  592  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0501  transketolase  49.85 
 
 		 665 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2740  transketolase  49.92 
 
 		 659 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131701 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0776  transketolase  49.32 
 
 		 663 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0260346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3256  transketolase  49.18 
 
 		 663 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  48.41 
 
 		 667 aa  593  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>