More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6923 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_1669  transketolase  63.39 
 
 		 738 aa  825    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  55.56 
 
 		 657 aa  709    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0447  transketolase  58.27 
 
 		 671 aa  737    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.127654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6399  transketolase  56.95 
 
 		 670 aa  721    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0195479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6218  transketolase  54.59 
 
 		 681 aa  678    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.686322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3532  transketolase  59.41 
 
 		 657 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0387  transketolase  50.07 
 
 		 690 aa  667    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  56.2 
 
 		 695 aa  716    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1727  transketolase  63.24 
 
 		 663 aa  824    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.827271  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1193  transketolase  59.94 
 
 		 667 aa  756    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4915  transketolase  54.8 
 
 		 653 aa  697    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  66.62 
 
 		 665 aa  897    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  50.3 
 
 		 661 aa  651    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2734  transketolase  70.39 
 
 		 661 aa  934    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  53.31 
 
 		 672 aa  679    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3268  transketolase  58.41 
 
 		 657 aa  677    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0578167  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  54.76 
 
 		 677 aa  702    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4001  transketolase  58.1 
 
 		 657 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.923943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3236  transketolase  60.03 
 
 		 657 aa  727    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0595  transketolase  56.77 
 
 		 660 aa  698    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2601  transketolase  55.99 
 
 		 655 aa  716    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  58.02 
 
 		 671 aa  732    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  58.47 
 
 		 671 aa  738    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4466  transketolase  68.28 
 
 		 662 aa  892    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  55.37 
 
 		 655 aa  703    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  50.15 
 
 		 663 aa  674    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  53.93 
 
 		 671 aa  696    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  52.41 
 
 		 672 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  58.75 
 
 		 673 aa  755    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4766  transketolase  68.99 
 
 		 686 aa  910    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4017  transketolase  57.8 
 
 		 657 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.212996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  63.51 
 
 		 684 aa  823    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2650  transketolase  62.88 
 
 		 651 aa  783    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  57.71 
 
 		 671 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4312  transketolase  69.18 
 
 		 662 aa  886    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  53.46 
 
 		 672 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3531  transketolase  70.5 
 
 		 678 aa  911    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  54.77 
 
 		 666 aa  711    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0137  transketolase  57.27 
 
 		 666 aa  771    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1113  transketolase  54.45 
 
 		 673 aa  692    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1320  transketolase  53.14 
 
 		 660 aa  671    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6387  transketolase  54.74 
 
 		 681 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3638  transketolase  62.29 
 
 		 658 aa  798    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  62.27 
 
 		 686 aa  801    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6923  transketolase  100 
 
 		 661 aa  1345    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  61.36 
 
 		 663 aa  794    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  55.73 
 
 		 660 aa  702    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  68.23 
 
 		 661 aa  916    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1190  transketolase  61.27 
 
 		 663 aa  794    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6620  transketolase  54.74 
 
 		 681 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1697  transketolase  56.97 
 
 		 668 aa  709    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.473272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  56.68 
 
 		 672 aa  713    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1535  transketolase  50.99 
 
 		 692 aa  630  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.561828 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  51.21 
 
 		 661 aa  627  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2390  transketolase  49.77 
 
 		 666 aa  621  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0781466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03160  transketolase 1 (TK 1)  49.32 
 
 		 663 aa  622  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  50.6 
 
 		 680 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2893  transketolase  51.31 
 
 		 665 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  50.91 
 
 		 694 aa  615  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1828  transketolase  50.75 
 
 		 653 aa  611  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.208586  normal  0.379943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  50.3 
 
 		 663 aa  608  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  49.85 
 
 		 666 aa  609  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  50.15 
 
 		 665 aa  612  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  49.47 
 
 		 680 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3391  transketolase  50.67 
 
 		 699 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0869549  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4387  transketolase  49.92 
 
 		 660 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  50.99 
 
 		 667 aa  602  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  48.7 
 
 		 663 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  50.07 
 
 		 662 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1497  transketolase  50.83 
 
 		 675 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0538  transketolase  50.9 
 
 		 690 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.242033  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  49.24 
 
 		 663 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  50.15 
 
 		 690 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  50.15 
 
 		 690 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  50.15 
 
 		 690 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  50.15 
 
 		 690 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  50.15 
 
 		 675 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  50.15 
 
 		 690 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000495  transketolase  49.92 
 
 		 663 aa  598  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0562  transketolase  50.75 
 
 		 690 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.32365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  48.49 
 
 		 665 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3228  transketolase  48.8 
 
 		 665 aa  595  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0220  transketolase  50.58 
 
 		 681 aa  596  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  51.71 
 
 		 680 aa  598  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0850  transketolase  49.31 
 
 		 664 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889577  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  48.25 
 
 		 665 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0554  transketolase  48.94 
 
 		 665 aa  595  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0605  transketolase  50.75 
 
 		 690 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0697832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  48.49 
 
 		 723 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  50 
 
 		 696 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0552  transketolase  49 
 
 		 664 aa  598  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3722  transketolase  50.75 
 
 		 690 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  48.7 
 
 		 657 aa  597  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0847  transketolase  49.31 
 
 		 664 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0520  transketolase  48.57 
 
 		 663 aa  598  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0155  transketolase  50.75 
 
 		 690 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3352  transketolase  49.16 
 
 		 664 aa  595  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0638  transketolase  50.75 
 
 		 690 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0364868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0412  transketolase  48.91 
 
 		 1053 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3753  transketolase  49.85 
 
 		 675 aa  593  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>